MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Coxiella burnetii CbuK_Q154 plasmid pQpRS_K_Q154

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011526	GGGT	2	8	166	173	0 %	25 %	75 %	0 %	212208406
2	NC_011526	GAAC	2	8	412	419	50 %	0 %	25 %	25 %	212208406
3	NC_011526	ATTG	2	8	1290	1297	25 %	50 %	25 %	0 %	212208407
4	NC_011526	TTCA	2	8	1721	1728	25 %	50 %	0 %	25 %	212208408
5	NC_011526	AGCA	2	8	2051	2058	50 %	0 %	25 %	25 %	212208408
6	NC_011526	TTGG	2	8	3502	3509	0 %	50 %	50 %	0 %	212208410
7	NC_011526	TCTG	2	8	4053	4060	0 %	50 %	25 %	25 %	212208411
8	NC_011526	ATTT	3	12	4854	4865	25 %	75 %	0 %	0 %	212208412
9	NC_011526	CATT	2	8	4930	4937	25 %	50 %	0 %	25 %	212208412
10	NC_011526	TCAA	2	8	5315	5322	50 %	25 %	0 %	25 %	212208412
11	NC_011526	TTCA	2	8	5743	5750	25 %	50 %	0 %	25 %	212208413
12	NC_011526	AGCA	2	8	6073	6080	50 %	0 %	25 %	25 %	212208413
13	NC_011526	GTTT	2	8	6623	6630	0 %	75 %	25 %	0 %	212208414
14	NC_011526	AATT	2	8	6989	6996	50 %	50 %	0 %	0 %	212208414
15	NC_011526	TGAT	2	8	7115	7122	25 %	50 %	25 %	0 %	212208414
16	NC_011526	CCGG	2	8	7360	7367	0 %	0 %	50 %	50 %	212208414
17	NC_011526	CTTG	2	8	8323	8330	0 %	50 %	25 %	25 %	212208415
18	NC_011526	TTGA	2	8	8649	8656	25 %	50 %	25 %	0 %	212208415
19	NC_011526	TTCT	2	8	8686	8693	0 %	75 %	0 %	25 %	212208415
20	NC_011526	TCGA	2	8	9361	9368	25 %	25 %	25 %	25 %	212208417
21	NC_011526	TCAT	2	8	9452	9459	25 %	50 %	0 %	25 %	212208417
22	NC_011526	TTTA	2	8	9714	9721	25 %	75 %	0 %	0 %	212208417
23	NC_011526	AAAT	2	8	9913	9920	75 %	25 %	0 %	0 %	212208417
24	NC_011526	GAAA	2	8	10024	10031	75 %	0 %	25 %	0 %	212208417
25	NC_011526	ACCA	2	8	10181	10188	50 %	0 %	0 %	50 %	212208418
26	NC_011526	TGGG	2	8	11107	11114	0 %	25 %	75 %	0 %	212208418
27	NC_011526	TTCA	2	8	16431	16438	25 %	50 %	0 %	25 %	212208419
28	NC_011526	TCTT	2	8	16665	16672	0 %	75 %	0 %	25 %	212208419
29	NC_011526	ATAA	2	8	17217	17224	75 %	25 %	0 %	0 %	212208419
30	NC_011526	TATT	2	8	19413	19420	25 %	75 %	0 %	0 %	212208422
31	NC_011526	CAAA	2	8	20550	20557	75 %	0 %	0 %	25 %	212208424
32	NC_011526	GAAT	2	8	20756	20763	50 %	25 %	25 %	0 %	212208424
33	NC_011526	ACGT	2	8	20765	20772	25 %	25 %	25 %	25 %	212208424
34	NC_011526	AGGC	2	8	20828	20835	25 %	0 %	50 %	25 %	212208424
35	NC_011526	ATTG	2	8	20922	20929	25 %	50 %	25 %	0 %	212208424
36	NC_011526	GATG	2	8	21785	21792	25 %	25 %	50 %	0 %	212208425
37	NC_011526	TCCA	2	8	21942	21949	25 %	25 %	0 %	50 %	212208425
38	NC_011526	GTTT	2	8	22346	22353	0 %	75 %	25 %	0 %	212208426
39	NC_011526	GTCA	2	8	22382	22389	25 %	25 %	25 %	25 %	212208426
40	NC_011526	TTAC	2	8	24041	24048	25 %	50 %	0 %	25 %	212208429
41	NC_011526	AGAT	2	8	24205	24212	50 %	25 %	25 %	0 %	212208429
42	NC_011526	CTTG	2	8	27412	27419	0 %	50 %	25 %	25 %	212208435
43	NC_011526	TAAG	2	8	27694	27701	50 %	25 %	25 %	0 %	212208436
44	NC_011526	ATCC	2	8	28248	28255	25 %	25 %	0 %	50 %	212208436
45	NC_011526	TGGC	2	8	28289	28296	0 %	25 %	50 %	25 %	212208436
46	NC_011526	GGTT	2	8	28631	28638	0 %	50 %	50 %	0 %	212208436
47	NC_011526	GTGA	2	8	28705	28712	25 %	25 %	50 %	0 %	212208436
48	NC_011526	CTTT	2	8	28742	28749	0 %	75 %	0 %	25 %	212208436
49	NC_011526	TTTG	2	8	28860	28867	0 %	75 %	25 %	0 %	212208436
50	NC_011526	GTTT	2	8	28903	28910	0 %	75 %	25 %	0 %	212208436
51	NC_011526	TTTC	2	8	29925	29932	0 %	75 %	0 %	25 %	212208436
52	NC_011526	GCAA	2	8	29936	29943	50 %	0 %	25 %	25 %	212208436
53	NC_011526	CTTA	2	8	31194	31201	25 %	50 %	0 %	25 %	212208438
54	NC_011526	AACT	2	8	31541	31548	50 %	25 %	0 %	25 %	212208438
55	NC_011526	GTTG	2	8	32405	32412	0 %	50 %	50 %	0 %	212208440
56	NC_011526	CAAA	2	8	32491	32498	75 %	0 %	0 %	25 %	212208440
57	NC_011526	ACCC	2	8	32962	32969	25 %	0 %	0 %	75 %	212208441
58	NC_011526	CTTC	2	8	33020	33027	0 %	50 %	0 %	50 %	212208441
59	NC_011526	ATTG	2	8	33649	33656	25 %	50 %	25 %	0 %	212208442
60	NC_011526	TTTC	2	8	33697	33704	0 %	75 %	0 %	25 %	212208442
61	NC_011526	GTTT	2	8	34310	34317	0 %	75 %	25 %	0 %	212208442
62	NC_011526	GGAA	2	8	35001	35008	50 %	0 %	50 %	0 %	212208444
63	NC_011526	ATTG	2	8	35496	35503	25 %	50 %	25 %	0 %	212208444
64	NC_011526	ATGA	2	8	35580	35587	50 %	25 %	25 %	0 %	212208444
65	NC_011526	TTCT	2	8	35749	35756	0 %	75 %	0 %	25 %	212208444
66	NC_011526	TAAT	2	8	35893	35900	50 %	50 %	0 %	0 %	212208444
67	NC_011526	TAAA	2	8	36077	36084	75 %	25 %	0 %	0 %	212208445
68	NC_011526	CAGC	2	8	36253	36260	25 %	0 %	25 %	50 %	212208445
69	NC_011526	GAAT	2	8	37019	37026	50 %	25 %	25 %	0 %	212208446
70	NC_011526	AAAG	2	8	37109	37116	75 %	0 %	25 %	0 %	212208446
71	NC_011526	TTTA	2	8	37131	37138	25 %	75 %	0 %	0 %	212208446
72	NC_011526	TAAT	2	8	37745	37752	50 %	50 %	0 %	0 %	212208446
73	NC_011526	GAAA	2	8	38013	38020	75 %	0 %	25 %	0 %	212208446
74	NC_011526	GCTT	2	8	38212	38219	0 %	50 %	25 %	25 %	212208446
75	NC_011526	TTCT	2	8	38425	38432	0 %	75 %	0 %	25 %	212208447
76	NC_011526	CGAA	2	8	38596	38603	50 %	0 %	25 %	25 %	212208447

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.