MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Coxiella burnetii CbuK_Q154 plasmid pQpRS_K_Q154

Total Repeats: 463

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011526	TTG	2	6	9	14	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011526	GGT	2	6	246	251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212208406
3	NC_011526	AGA	2	6	363	368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212208406
4	NC_011526	GAA	2	6	529	534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212208406
5	NC_011526	GTC	2	6	675	680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011526	CCG	2	6	733	738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_011526	CAT	2	6	901	906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011526	TGA	2	6	959	964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011526	AGA	2	6	1017	1022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011526	TTC	2	6	1249	1254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011526	GCC	2	6	1268	1273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_011526	TGC	2	6	1317	1322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212208407
13	NC_011526	GCC	2	6	1364	1369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212208407
14	NC_011526	TAT	2	6	1558	1563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011526	GAG	2	6	1583	1588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011526	ATT	2	6	1594	1599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011526	CTA	2	6	1742	1747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212208408
18	NC_011526	TGG	2	6	1757	1762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212208408
19	NC_011526	TGC	2	6	1785	1790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212208408
20	NC_011526	CAA	2	6	1862	1867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212208408
21	NC_011526	TTA	2	6	1928	1933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208408
22	NC_011526	TGT	2	6	2144	2149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212208408
23	NC_011526	TCG	2	6	2172	2177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212208408
24	NC_011526	TCG	2	6	2376	2381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212208408
25	NC_011526	GGC	2	6	2615	2620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212208408
26	NC_011526	TAA	2	6	2828	2833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011526	CTG	2	6	2996	3001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212208409
28	NC_011526	CCA	2	6	3009	3014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212208409
29	NC_011526	CTT	2	6	3268	3273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212208410
30	NC_011526	AGT	2	6	3332	3337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212208410
31	NC_011526	AAC	2	6	3369	3374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212208410
32	NC_011526	CCA	2	6	3399	3404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212208410
33	NC_011526	CCA	2	6	3433	3438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212208410
34	NC_011526	TTA	2	6	3517	3522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208410
35	NC_011526	AGT	2	6	3534	3539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212208410
36	NC_011526	TAA	2	6	3548	3553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212208410
37	NC_011526	AAC	2	6	3616	3621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212208410
38	NC_011526	ATT	2	6	3684	3689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011526	TGC	2	6	3770	3775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011526	AAT	2	6	3803	3808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011526	ATA	2	6	3845	3850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011526	TAA	2	6	3873	3878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011526	CTA	2	6	3927	3932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011526	TAT	2	6	3953	3958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208411
45	NC_011526	ACC	2	6	4011	4016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212208411
46	NC_011526	GGT	2	6	4073	4078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212208411
47	NC_011526	ACA	2	6	4222	4227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011526	TGA	2	6	4331	4336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212208412
49	NC_011526	CAA	2	6	4570	4575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212208412
50	NC_011526	CGA	2	6	4661	4666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212208412
51	NC_011526	GTT	2	6	4717	4722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212208412
52	NC_011526	TTA	2	6	4723	4728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208412
53	NC_011526	TTC	2	6	4731	4736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212208412
54	NC_011526	GGT	2	6	4867	4872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212208412
55	NC_011526	GAG	2	6	4903	4908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212208412
56	NC_011526	ACC	2	6	4945	4950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212208412
57	NC_011526	ATT	2	6	4995	5000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208412
58	NC_011526	ATT	2	6	5027	5032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208412
59	NC_011526	ATG	2	6	5075	5080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212208412
60	NC_011526	ACT	2	6	5092	5097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212208412
61	NC_011526	ATT	2	6	5105	5110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208412
62	NC_011526	ATT	2	6	5270	5275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208412
63	NC_011526	TAT	2	6	5335	5340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208412
64	NC_011526	AAG	2	6	5357	5362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212208412
65	NC_011526	TTA	2	6	5482	5487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208412
66	NC_011526	CTA	2	6	5764	5769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212208413
67	NC_011526	TGG	2	6	5779	5784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212208413
68	NC_011526	TGC	2	6	5807	5812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212208413
69	NC_011526	CAA	2	6	5884	5889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212208413
70	NC_011526	TTA	2	6	5950	5955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208413
71	NC_011526	TGT	2	6	6166	6171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212208413
72	NC_011526	TCG	2	6	6194	6199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212208413
73	NC_011526	ACA	2	6	6363	6368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_011526	ATA	2	6	6419	6424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011526	ATG	2	6	6425	6430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011526	GAA	2	6	6590	6595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011526	AGG	2	6	6684	6689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212208414
78	NC_011526	GTT	2	6	6778	6783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212208414
79	NC_011526	ATT	2	6	6863	6868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208414
80	NC_011526	TGA	2	6	7040	7045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212208414
81	NC_011526	AGA	2	6	7062	7067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212208414
82	NC_011526	CAC	2	6	7109	7114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212208414
83	NC_011526	GAA	2	6	7165	7170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212208414
84	NC_011526	GGT	2	6	7198	7203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212208414
85	NC_011526	CGG	2	6	7300	7305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212208414
86	NC_011526	GTG	2	6	7328	7333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212208414
87	NC_011526	AAT	2	6	7386	7391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212208414
88	NC_011526	GGC	2	6	7461	7466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212208414
89	NC_011526	AGC	2	6	7517	7522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212208414
90	NC_011526	AAG	2	6	7569	7574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212208414
91	NC_011526	TGT	2	6	7654	7659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011526	GCT	2	6	7683	7688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011526	CTG	2	6	7802	7807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212208415
94	NC_011526	ATG	2	6	8008	8013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212208415
95	NC_011526	AAT	2	6	8076	8081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212208415
96	NC_011526	ATT	2	6	8097	8102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208415
97	NC_011526	CAG	2	6	8243	8248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212208415
98	NC_011526	TTC	2	6	8262	8267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212208415
99	NC_011526	ATT	2	6	8292	8297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208415
100	NC_011526	ATT	2	6	8316	8321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208415
101	NC_011526	CTT	2	6	8372	8377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212208415
102	NC_011526	TTC	2	6	8397	8402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212208415
103	NC_011526	ATA	2	6	8448	8453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212208415
104	NC_011526	TCA	2	6	8455	8460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212208415
105	NC_011526	CGC	2	6	8466	8471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212208415
106	NC_011526	ATC	2	6	8490	8495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212208415
107	NC_011526	ATT	2	6	8589	8594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208415
108	NC_011526	CTT	3	9	8612	8620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212208415
109	NC_011526	CAA	3	9	8640	8648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212208415
110	NC_011526	CCT	2	6	8878	8883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_011526	TAT	2	6	8916	8921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011526	AGA	2	6	8925	8930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011526	AAT	2	6	9062	9067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011526	ATT	3	9	9136	9144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208416
115	NC_011526	TAA	2	6	9145	9150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212208416
116	NC_011526	TAT	3	9	9297	9305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011526	AAT	2	6	9333	9338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212208417
118	NC_011526	ATA	2	6	9445	9450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212208417
119	NC_011526	TGA	2	6	9482	9487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212208417
120	NC_011526	GAA	2	6	9516	9521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212208417
121	NC_011526	ATT	2	6	9549	9554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208417
122	NC_011526	GAA	2	6	9597	9602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212208417
123	NC_011526	ATT	2	6	9642	9647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208417
124	NC_011526	ATT	2	6	9754	9759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208417
125	NC_011526	TGG	2	6	9810	9815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212208417
126	NC_011526	CCA	2	6	9971	9976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212208417
127	NC_011526	GAT	2	6	10100	10105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011526	TAA	2	6	10152	10157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212208418
129	NC_011526	TTC	2	6	10375	10380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212208418
130	NC_011526	ATT	2	6	10413	10418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208418
131	NC_011526	TGA	2	6	10465	10470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212208418
132	NC_011526	TAT	2	6	10490	10495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208418
133	NC_011526	ATA	2	6	10635	10640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212208418
134	NC_011526	ACA	2	6	10673	10678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212208418
135	NC_011526	TCT	2	6	10905	10910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212208418
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267	NC_011526	TAA	2	6	22568	22573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_011526	ATT	2	6	22763	22768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_011526	TCG	2	6	22864	22869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212208427
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281	NC_011526	TAA	2	6	23477	23482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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385	NC_011526	ATT	2	6	32237	32242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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393	NC_011526	AAT	2	6	33094	33099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212208441
394	NC_011526	TTC	2	6	33231	33236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212208441
395	NC_011526	CGC	2	6	33334	33339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
396	NC_011526	CTA	2	6	33356	33361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
397	NC_011526	CAA	2	6	33412	33417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
398	NC_011526	CTT	2	6	33423	33428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
399	NC_011526	TTC	2	6	33498	33503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
400	NC_011526	CTC	2	6	33518	33523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212208442
401	NC_011526	CTT	2	6	33559	33564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212208442
402	NC_011526	AAT	2	6	33581	33586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212208442
403	NC_011526	AAT	2	6	33761	33766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212208442
404	NC_011526	TTG	2	6	33785	33790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212208442
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407	NC_011526	TCA	2	6	34053	34058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212208442
408	NC_011526	CTT	2	6	34096	34101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212208442
409	NC_011526	GTA	2	6	34264	34269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212208442
410	NC_011526	ATT	2	6	34383	34388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208442
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414	NC_011526	AAT	2	6	34719	34724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
415	NC_011526	GAA	2	6	34986	34991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212208444
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419	NC_011526	ATT	2	6	35352	35357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208444
420	NC_011526	TCC	2	6	35392	35397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212208444
421	NC_011526	ACA	2	6	35413	35418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212208444
422	NC_011526	ATG	2	6	35482	35487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212208444
423	NC_011526	ATT	2	6	35538	35543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208444
424	NC_011526	ATT	2	6	35559	35564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208444
425	NC_011526	TCA	2	6	35599	35604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212208444
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431	NC_011526	CAG	2	6	36047	36052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212208445
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452	NC_011526	GAA	2	6	38033	38038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212208446
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