MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Coxiella burnetii CbuK_Q154 plasmid pQpRS_K_Q154

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011526	TA	4	8	30	37	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011526	AT	3	6	61	66	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011526	AC	3	6	1751	1756	50 %	0 %	0 %	50 %	212208408
4	NC_011526	TC	3	6	1839	1844	0 %	50 %	0 %	50 %	212208408
5	NC_011526	TG	3	6	2284	2289	0 %	50 %	50 %	0 %	212208408
6	NC_011526	TG	3	6	3257	3262	0 %	50 %	50 %	0 %	212208410
7	NC_011526	TG	3	6	3730	3735	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011526	GA	3	6	4419	4424	50 %	0 %	50 %	0 %	212208412
9	NC_011526	AG	3	6	4600	4605	50 %	0 %	50 %	0 %	212208412
10	NC_011526	AC	3	6	4801	4806	50 %	0 %	0 %	50 %	212208412
11	NC_011526	GC	3	6	5225	5230	0 %	0 %	50 %	50 %	212208412
12	NC_011526	AT	3	6	5618	5623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011526	AC	3	6	5773	5778	50 %	0 %	0 %	50 %	212208413
14	NC_011526	TC	3	6	5861	5866	0 %	50 %	0 %	50 %	212208413
15	NC_011526	GT	3	6	6351	6356	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011526	TG	3	6	7820	7825	0 %	50 %	50 %	0 %	212208415
17	NC_011526	AG	3	6	8791	8796	50 %	0 %	50 %	0 %	212208415
18	NC_011526	TA	3	6	9832	9837	50 %	50 %	0 %	0 %	212208417
19	NC_011526	GA	3	6	9961	9966	50 %	0 %	50 %	0 %	212208417
20	NC_011526	AT	3	6	11373	11378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011526	GA	3	6	12498	12503	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011526	TC	3	6	12948	12953	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_011526	TA	3	6	13233	13238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011526	GC	3	6	13442	13447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_011526	GC	3	6	13942	13947	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_011526	TG	3	6	14964	14969	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011526	TA	3	6	16023	16028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011526	AG	3	6	16097	16102	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011526	AT	3	6	18767	18772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011526	TG	3	6	18826	18831	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011526	TC	3	6	19791	19796	0 %	50 %	0 %	50 %	212208422
32	NC_011526	TC	3	6	20701	20706	0 %	50 %	0 %	50 %	212208424
33	NC_011526	TC	4	8	21331	21338	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_011526	GA	3	6	21408	21413	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011526	GC	3	6	22908	22913	0 %	0 %	50 %	50 %	212208427
36	NC_011526	GC	3	6	22919	22924	0 %	0 %	50 %	50 %	212208427
37	NC_011526	GA	3	6	23485	23490	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011526	AT	3	6	23525	23530	50 %	50 %	0 %	0 %	212208429
39	NC_011526	AT	3	6	23694	23699	50 %	50 %	0 %	0 %	212208429
40	NC_011526	AG	3	6	23776	23781	50 %	0 %	50 %	0 %	212208429
41	NC_011526	GT	3	6	23796	23801	0 %	50 %	50 %	0 %	212208429
42	NC_011526	CT	3	6	24126	24131	0 %	50 %	0 %	50 %	212208429
43	NC_011526	TC	3	6	24451	24456	0 %	50 %	0 %	50 %	212208429
44	NC_011526	AG	3	6	24638	24643	50 %	0 %	50 %	0 %	212208429
45	NC_011526	AT	3	6	24653	24658	50 %	50 %	0 %	0 %	212208429
46	NC_011526	CA	3	6	25702	25707	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_011526	AT	3	6	25878	25883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011526	TA	3	6	25910	25915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011526	TG	3	6	26181	26186	0 %	50 %	50 %	0 %	212208432
50	NC_011526	TC	3	6	28370	28375	0 %	50 %	0 %	50 %	212208436
51	NC_011526	TG	3	6	28481	28486	0 %	50 %	50 %	0 %	212208436
52	NC_011526	GT	3	6	28685	28690	0 %	50 %	50 %	0 %	212208436
53	NC_011526	GA	4	8	29367	29374	50 %	0 %	50 %	0 %	212208436
54	NC_011526	CT	3	6	29995	30000	0 %	50 %	0 %	50 %	212208436
55	NC_011526	AT	3	6	30346	30351	50 %	50 %	0 %	0 %	212208437
56	NC_011526	CT	3	6	30403	30408	0 %	50 %	0 %	50 %	212208437
57	NC_011526	TA	4	8	31961	31968	50 %	50 %	0 %	0 %	212208439
58	NC_011526	AG	3	6	32997	33002	50 %	0 %	50 %	0 %	212208441
59	NC_011526	TC	3	6	33346	33351	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_011526	AT	3	6	33371	33376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011526	GC	3	6	34107	34112	0 %	0 %	50 %	50 %	212208442
62	NC_011526	GA	3	6	34278	34283	50 %	0 %	50 %	0 %	212208442
63	NC_011526	TG	3	6	35764	35769	0 %	50 %	50 %	0 %	212208444
64	NC_011526	GC	3	6	36848	36853	0 %	0 %	50 %	50 %	212208445
65	NC_011526	TG	3	6	36905	36910	0 %	50 %	50 %	0 %	212208445
66	NC_011526	GA	3	6	37663	37668	50 %	0 %	50 %	0 %	212208446
67	NC_011526	CG	3	6	38497	38502	0 %	0 %	50 %	50 %	212208447
68	NC_011526	CG	3	6	38848	38853	0 %	0 %	50 %	50 %	212208447
69	NC_011526	AT	4	8	39271	39278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.