MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Coxiella burnetii CbuK_Q154 plasmid pQpRS_K_Q154

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011526	AC	3	6	1751	1756	50 %	0 %	0 %	50 %	212208408
2	NC_011526	TC	3	6	1839	1844	0 %	50 %	0 %	50 %	212208408
3	NC_011526	TG	3	6	2284	2289	0 %	50 %	50 %	0 %	212208408
4	NC_011526	TG	3	6	3257	3262	0 %	50 %	50 %	0 %	212208410
5	NC_011526	GA	3	6	4419	4424	50 %	0 %	50 %	0 %	212208412
6	NC_011526	AG	3	6	4600	4605	50 %	0 %	50 %	0 %	212208412
7	NC_011526	AC	3	6	4801	4806	50 %	0 %	0 %	50 %	212208412
8	NC_011526	GC	3	6	5225	5230	0 %	0 %	50 %	50 %	212208412
9	NC_011526	AC	3	6	5773	5778	50 %	0 %	0 %	50 %	212208413
10	NC_011526	TC	3	6	5861	5866	0 %	50 %	0 %	50 %	212208413
11	NC_011526	TG	3	6	7820	7825	0 %	50 %	50 %	0 %	212208415
12	NC_011526	AG	3	6	8791	8796	50 %	0 %	50 %	0 %	212208415
13	NC_011526	TA	3	6	9832	9837	50 %	50 %	0 %	0 %	212208417
14	NC_011526	GA	3	6	9961	9966	50 %	0 %	50 %	0 %	212208417
15	NC_011526	TC	3	6	19791	19796	0 %	50 %	0 %	50 %	212208422
16	NC_011526	TC	3	6	20701	20706	0 %	50 %	0 %	50 %	212208424
17	NC_011526	GC	3	6	22908	22913	0 %	0 %	50 %	50 %	212208427
18	NC_011526	GC	3	6	22919	22924	0 %	0 %	50 %	50 %	212208427
19	NC_011526	AT	3	6	23525	23530	50 %	50 %	0 %	0 %	212208429
20	NC_011526	AT	3	6	23694	23699	50 %	50 %	0 %	0 %	212208429
21	NC_011526	AG	3	6	23776	23781	50 %	0 %	50 %	0 %	212208429
22	NC_011526	GT	3	6	23796	23801	0 %	50 %	50 %	0 %	212208429
23	NC_011526	CT	3	6	24126	24131	0 %	50 %	0 %	50 %	212208429
24	NC_011526	TC	3	6	24451	24456	0 %	50 %	0 %	50 %	212208429
25	NC_011526	AG	3	6	24638	24643	50 %	0 %	50 %	0 %	212208429
26	NC_011526	AT	3	6	24653	24658	50 %	50 %	0 %	0 %	212208429
27	NC_011526	TG	3	6	26181	26186	0 %	50 %	50 %	0 %	212208432
28	NC_011526	TC	3	6	28370	28375	0 %	50 %	0 %	50 %	212208436
29	NC_011526	TG	3	6	28481	28486	0 %	50 %	50 %	0 %	212208436
30	NC_011526	GT	3	6	28685	28690	0 %	50 %	50 %	0 %	212208436
31	NC_011526	GA	4	8	29367	29374	50 %	0 %	50 %	0 %	212208436
32	NC_011526	CT	3	6	29995	30000	0 %	50 %	0 %	50 %	212208436
33	NC_011526	AT	3	6	30346	30351	50 %	50 %	0 %	0 %	212208437
34	NC_011526	CT	3	6	30403	30408	0 %	50 %	0 %	50 %	212208437
35	NC_011526	TA	4	8	31961	31968	50 %	50 %	0 %	0 %	212208439
36	NC_011526	AG	3	6	32997	33002	50 %	0 %	50 %	0 %	212208441
37	NC_011526	GC	3	6	34107	34112	0 %	0 %	50 %	50 %	212208442
38	NC_011526	GA	3	6	34278	34283	50 %	0 %	50 %	0 %	212208442
39	NC_011526	TG	3	6	35764	35769	0 %	50 %	50 %	0 %	212208444
40	NC_011526	GC	3	6	36848	36853	0 %	0 %	50 %	50 %	212208445
41	NC_011526	TG	3	6	36905	36910	0 %	50 %	50 %	0 %	212208445
42	NC_011526	GA	3	6	37663	37668	50 %	0 %	50 %	0 %	212208446
43	NC_011526	CG	3	6	38497	38502	0 %	0 %	50 %	50 %	212208447
44	NC_011526	CG	3	6	38848	38853	0 %	0 %	50 %	50 %	212208447

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.