MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Coxiella burnetii CbuK_Q154 plasmid pQpRS_K_Q154

Total Repeats: 154

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011526	A	8	8	455	462	100 %	0 %	0 %	0 %	212208406
2	NC_011526	A	6	6	722	727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011526	A	6	6	858	863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011526	A	6	6	992	997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011526	A	7	7	1047	1053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011526	T	6	6	1395	1400	0 %	100 %	0 %	0 %	212208407
7	NC_011526	T	7	7	1464	1470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011526	A	6	6	1633	1638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011526	A	6	6	1693	1698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011526	T	6	6	1711	1716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011526	A	6	6	2121	2126	100 %	0 %	0 %	0 %	212208408
12	NC_011526	T	6	6	2158	2163	0 %	100 %	0 %	0 %	212208408
13	NC_011526	A	6	6	2832	2837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011526	A	7	7	2938	2944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011526	T	6	6	3291	3296	0 %	100 %	0 %	0 %	212208410
16	NC_011526	T	8	8	3635	3642	0 %	100 %	0 %	0 %	212208410
17	NC_011526	A	7	7	3763	3769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011526	A	6	6	4672	4677	100 %	0 %	0 %	0 %	212208412
19	NC_011526	A	6	6	5054	5059	100 %	0 %	0 %	0 %	212208412
20	NC_011526	A	8	8	5257	5264	100 %	0 %	0 %	0 %	212208412
21	NC_011526	A	7	7	5422	5428	100 %	0 %	0 %	0 %	212208412
22	NC_011526	A	6	6	5458	5463	100 %	0 %	0 %	0 %	212208412
23	NC_011526	T	6	6	5518	5523	0 %	100 %	0 %	0 %	212208412
24	NC_011526	T	6	6	5577	5582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011526	A	7	7	5657	5663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011526	A	6	6	5715	5720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011526	T	6	6	5733	5738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011526	A	6	6	6143	6148	100 %	0 %	0 %	0 %	212208413
29	NC_011526	T	6	6	6180	6185	0 %	100 %	0 %	0 %	212208413
30	NC_011526	T	6	6	6499	6504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011526	A	8	8	6594	6601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011526	T	6	6	6765	6770	0 %	100 %	0 %	0 %	212208414
33	NC_011526	A	6	6	7189	7194	100 %	0 %	0 %	0 %	212208414
34	NC_011526	A	7	7	7286	7292	100 %	0 %	0 %	0 %	212208414
35	NC_011526	A	7	7	7640	7646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011526	T	7	7	7663	7669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011526	A	7	7	7724	7730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011526	A	6	6	7947	7952	100 %	0 %	0 %	0 %	212208415
39	NC_011526	T	6	6	8206	8211	0 %	100 %	0 %	0 %	212208415
40	NC_011526	T	6	6	8348	8353	0 %	100 %	0 %	0 %	212208415
41	NC_011526	A	6	6	8728	8733	100 %	0 %	0 %	0 %	212208415
42	NC_011526	T	8	8	8831	8838	0 %	100 %	0 %	0 %	212208415
43	NC_011526	A	6	6	8934	8939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011526	T	7	7	9043	9049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011526	A	6	6	9111	9116	100 %	0 %	0 %	0 %	212208416
46	NC_011526	A	6	6	9849	9854	100 %	0 %	0 %	0 %	212208417
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49	NC_011526	A	7	7	11504	11510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011526	A	6	6	11529	11534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011526	T	6	6	11622	11627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011526	A	8	8	11686	11693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011526	A	7	7	12359	12365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011526	A	6	6	12872	12877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011526	A	7	7	13932	13938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011526	A	7	7	14277	14283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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67	NC_011526	A	6	6	18961	18966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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71	NC_011526	A	6	6	19687	19692	100 %	0 %	0 %	0 %	212208422
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90	NC_011526	A	6	6	24277	24282	100 %	0 %	0 %	0 %	212208429
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100	NC_011526	A	7	7	26040	26046	100 %	0 %	0 %	0 %	212208432
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102	NC_011526	A	6	6	26241	26246	100 %	0 %	0 %	0 %	212208432
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112	NC_011526	T	6	6	29300	29305	0 %	100 %	0 %	0 %	212208436
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.