MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Coxiella burnetii CbuK_Q154 plasmid pQpRS_K_Q154

Total Repeats: 103

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011526	A	8	8	455	462	100 %	0 %	0 %	0 %	212208406
2	NC_011526	T	6	6	1395	1400	0 %	100 %	0 %	0 %	212208407
3	NC_011526	A	6	6	2121	2126	100 %	0 %	0 %	0 %	212208408
4	NC_011526	T	6	6	2158	2163	0 %	100 %	0 %	0 %	212208408
5	NC_011526	T	6	6	3291	3296	0 %	100 %	0 %	0 %	212208410
6	NC_011526	T	8	8	3635	3642	0 %	100 %	0 %	0 %	212208410
7	NC_011526	A	6	6	4672	4677	100 %	0 %	0 %	0 %	212208412
8	NC_011526	A	6	6	5054	5059	100 %	0 %	0 %	0 %	212208412
9	NC_011526	A	8	8	5257	5264	100 %	0 %	0 %	0 %	212208412
10	NC_011526	A	7	7	5422	5428	100 %	0 %	0 %	0 %	212208412
11	NC_011526	A	6	6	5458	5463	100 %	0 %	0 %	0 %	212208412
12	NC_011526	T	6	6	5518	5523	0 %	100 %	0 %	0 %	212208412
13	NC_011526	A	6	6	6143	6148	100 %	0 %	0 %	0 %	212208413
14	NC_011526	T	6	6	6180	6185	0 %	100 %	0 %	0 %	212208413
15	NC_011526	T	6	6	6765	6770	0 %	100 %	0 %	0 %	212208414
16	NC_011526	A	6	6	7189	7194	100 %	0 %	0 %	0 %	212208414
17	NC_011526	A	7	7	7286	7292	100 %	0 %	0 %	0 %	212208414
18	NC_011526	A	6	6	7947	7952	100 %	0 %	0 %	0 %	212208415
19	NC_011526	T	6	6	8206	8211	0 %	100 %	0 %	0 %	212208415
20	NC_011526	T	6	6	8348	8353	0 %	100 %	0 %	0 %	212208415
21	NC_011526	A	6	6	8728	8733	100 %	0 %	0 %	0 %	212208415
22	NC_011526	T	8	8	8831	8838	0 %	100 %	0 %	0 %	212208415
23	NC_011526	A	6	6	9111	9116	100 %	0 %	0 %	0 %	212208416
24	NC_011526	A	6	6	9849	9854	100 %	0 %	0 %	0 %	212208417
25	NC_011526	A	7	7	10618	10624	100 %	0 %	0 %	0 %	212208418
26	NC_011526	A	8	8	10660	10667	100 %	0 %	0 %	0 %	212208418
27	NC_011526	T	8	8	16271	16278	0 %	100 %	0 %	0 %	212208419
28	NC_011526	T	6	6	16940	16945	0 %	100 %	0 %	0 %	212208419
29	NC_011526	A	7	7	17001	17007	100 %	0 %	0 %	0 %	212208419
30	NC_011526	T	6	6	17205	17210	0 %	100 %	0 %	0 %	212208419
31	NC_011526	A	6	6	17837	17842	100 %	0 %	0 %	0 %	212208420
32	NC_011526	T	7	7	19303	19309	0 %	100 %	0 %	0 %	212208422
33	NC_011526	A	6	6	19529	19534	100 %	0 %	0 %	0 %	212208422
34	NC_011526	A	6	6	19687	19692	100 %	0 %	0 %	0 %	212208422
35	NC_011526	T	7	7	20495	20501	0 %	100 %	0 %	0 %	212208424
36	NC_011526	T	6	6	20558	20563	0 %	100 %	0 %	0 %	212208424
37	NC_011526	T	6	6	21107	21112	0 %	100 %	0 %	0 %	212208424
38	NC_011526	T	6	6	22323	22328	0 %	100 %	0 %	0 %	212208426
39	NC_011526	T	7	7	22351	22357	0 %	100 %	0 %	0 %	212208426
40	NC_011526	T	6	6	23079	23084	0 %	100 %	0 %	0 %	212208428
41	NC_011526	A	6	6	23499	23504	100 %	0 %	0 %	0 %	212208429
42	NC_011526	T	7	7	23617	23623	0 %	100 %	0 %	0 %	212208429
43	NC_011526	A	6	6	23731	23736	100 %	0 %	0 %	0 %	212208429
44	NC_011526	A	7	7	24033	24039	100 %	0 %	0 %	0 %	212208429
45	NC_011526	T	6	6	24224	24229	0 %	100 %	0 %	0 %	212208429
46	NC_011526	A	6	6	24277	24282	100 %	0 %	0 %	0 %	212208429
47	NC_011526	T	6	6	24457	24462	0 %	100 %	0 %	0 %	212208429
48	NC_011526	A	6	6	24500	24505	100 %	0 %	0 %	0 %	212208429
49	NC_011526	A	6	6	25116	25121	100 %	0 %	0 %	0 %	212208430
50	NC_011526	A	6	6	25294	25299	100 %	0 %	0 %	0 %	212208431
51	NC_011526	T	6	6	25557	25562	0 %	100 %	0 %	0 %	212208431
52	NC_011526	A	7	7	25973	25979	100 %	0 %	0 %	0 %	212208432
53	NC_011526	A	7	7	26040	26046	100 %	0 %	0 %	0 %	212208432
54	NC_011526	A	6	6	26198	26203	100 %	0 %	0 %	0 %	212208432
55	NC_011526	A	6	6	26241	26246	100 %	0 %	0 %	0 %	212208432
56	NC_011526	T	8	8	26669	26676	0 %	100 %	0 %	0 %	212208433
57	NC_011526	A	7	7	26832	26838	100 %	0 %	0 %	0 %	212208434
58	NC_011526	T	6	6	26913	26918	0 %	100 %	0 %	0 %	212208434
59	NC_011526	T	6	6	27310	27315	0 %	100 %	0 %	0 %	212208435
60	NC_011526	T	6	6	27649	27654	0 %	100 %	0 %	0 %	212208436
61	NC_011526	T	6	6	27801	27806	0 %	100 %	0 %	0 %	212208436
62	NC_011526	T	6	6	28340	28345	0 %	100 %	0 %	0 %	212208436
63	NC_011526	T	7	7	28407	28413	0 %	100 %	0 %	0 %	212208436
64	NC_011526	T	6	6	29166	29171	0 %	100 %	0 %	0 %	212208436
65	NC_011526	T	6	6	29300	29305	0 %	100 %	0 %	0 %	212208436
66	NC_011526	A	6	6	29582	29587	100 %	0 %	0 %	0 %	212208436
67	NC_011526	T	6	6	29876	29881	0 %	100 %	0 %	0 %	212208436
68	NC_011526	T	7	7	30127	30133	0 %	100 %	0 %	0 %	212208436
69	NC_011526	T	6	6	30551	30556	0 %	100 %	0 %	0 %	212208437
70	NC_011526	T	6	6	30611	30616	0 %	100 %	0 %	0 %	212208437
71	NC_011526	A	6	6	30797	30802	100 %	0 %	0 %	0 %	212208437
72	NC_011526	A	7	7	31026	31032	100 %	0 %	0 %	0 %	212208438
73	NC_011526	T	6	6	31152	31157	0 %	100 %	0 %	0 %	212208438
74	NC_011526	A	8	8	31252	31259	100 %	0 %	0 %	0 %	212208438
75	NC_011526	A	6	6	31465	31470	100 %	0 %	0 %	0 %	212208438
76	NC_011526	T	6	6	31788	31793	0 %	100 %	0 %	0 %	212208439
77	NC_011526	A	7	7	32000	32006	100 %	0 %	0 %	0 %	212208439
78	NC_011526	G	6	6	32091	32096	0 %	0 %	100 %	0 %	212208439
79	NC_011526	A	6	6	32508	32513	100 %	0 %	0 %	0 %	212208440
80	NC_011526	T	8	8	32541	32548	0 %	100 %	0 %	0 %	212208440
81	NC_011526	T	7	7	32559	32565	0 %	100 %	0 %	0 %	212208440
82	NC_011526	T	6	6	32700	32705	0 %	100 %	0 %	0 %	212208441
83	NC_011526	T	6	6	32852	32857	0 %	100 %	0 %	0 %	212208441
84	NC_011526	T	7	7	34082	34088	0 %	100 %	0 %	0 %	212208442
85	NC_011526	A	7	7	34623	34629	100 %	0 %	0 %	0 %	212208443
86	NC_011526	A	6	6	34670	34675	100 %	0 %	0 %	0 %	212208443
87	NC_011526	A	6	6	34689	34694	100 %	0 %	0 %	0 %	212208443
88	NC_011526	T	6	6	34702	34707	0 %	100 %	0 %	0 %	212208443
89	NC_011526	A	7	7	34874	34880	100 %	0 %	0 %	0 %	212208444
90	NC_011526	A	6	6	35012	35017	100 %	0 %	0 %	0 %	212208444
91	NC_011526	A	7	7	35160	35166	100 %	0 %	0 %	0 %	212208444
92	NC_011526	A	7	7	36031	36037	100 %	0 %	0 %	0 %	212208445
93	NC_011526	A	7	7	36589	36595	100 %	0 %	0 %	0 %	212208445
94	NC_011526	A	6	6	36663	36668	100 %	0 %	0 %	0 %	212208445
95	NC_011526	A	7	7	37307	37313	100 %	0 %	0 %	0 %	212208446
96	NC_011526	A	7	7	37591	37597	100 %	0 %	0 %	0 %	212208446
97	NC_011526	A	6	6	37708	37713	100 %	0 %	0 %	0 %	212208446
98	NC_011526	A	6	6	37730	37735	100 %	0 %	0 %	0 %	212208446
99	NC_011526	A	6	6	38242	38247	100 %	0 %	0 %	0 %	212208446
100	NC_011526	A	6	6	38644	38649	100 %	0 %	0 %	0 %	212208447
101	NC_011526	A	6	6	38707	38712	100 %	0 %	0 %	0 %	212208447
102	NC_011526	T	6	6	38836	38841	0 %	100 %	0 %	0 %	212208447
103	NC_011526	T	8	8	38905	38912	0 %	100 %	0 %	0 %	212208447

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.