MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori P12 plasmid HPP12

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011499	TATG	2	8	227	234	25 %	50 %	25 %	0 %	210135771
2	NC_011499	TTTG	2	8	433	440	0 %	75 %	25 %	0 %	210135771
3	NC_011499	AATG	2	8	767	774	50 %	25 %	25 %	0 %	210135771
4	NC_011499	TATT	2	8	961	968	25 %	75 %	0 %	0 %	210135771
5	NC_011499	CAAA	2	8	1611	1618	75 %	0 %	0 %	25 %	210135772
6	NC_011499	TTTG	2	8	1971	1978	0 %	75 %	25 %	0 %	210135772
7	NC_011499	ATGA	2	8	1994	2001	50 %	25 %	25 %	0 %	210135772
8	NC_011499	TCAT	2	8	2078	2085	25 %	50 %	0 %	25 %	210135772
9	NC_011499	ATAA	2	8	2234	2241	75 %	25 %	0 %	0 %	210135772
10	NC_011499	TAAC	2	8	2253	2260	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_011499	CTTG	2	8	2765	2772	0 %	50 %	25 %	25 %	210135774
12	NC_011499	ATTG	2	8	3280	3287	25 %	50 %	25 %	0 %	210135774
13	NC_011499	TTTC	2	8	3347	3354	0 %	75 %	0 %	25 %	210135774
14	NC_011499	TTAG	2	8	4370	4377	25 %	50 %	25 %	0 %	210135774
15	NC_011499	TAAC	2	8	4488	4495	50 %	25 %	0 %	25 %	210135774
16	NC_011499	ATTG	2	8	4519	4526	25 %	50 %	25 %	0 %	210135777
17	NC_011499	TGAT	2	8	5001	5008	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011499	TTTG	2	8	5699	5706	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011499	TGTA	2	8	5794	5801	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011499	GTTG	2	8	5828	5835	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011499	ATCT	2	8	5961	5968	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_011499	AGCG	2	8	6002	6009	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_011499	TTTG	2	8	6040	6047	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011499	TGTA	2	8	6523	6530	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011499	GTTG	2	8	6557	6564	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011499	ATCT	2	8	6690	6697	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_011499	AGCG	2	8	6731	6738	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_011499	TTTG	2	8	6769	6776	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011499	TTTG	2	8	7893	7900	0 %	75 %	25 %	0 %	210135780
30	NC_011499	CCTG	2	8	9458	9465	0 %	25 %	25 %	50 %	210135781
31	NC_011499	CATG	2	8	9764	9771	25 %	25 %	25 %	25 %	210135781
32	NC_011499	GAAA	2	8	9866	9873	75 %	0 %	25 %	0 %	210135781
33	NC_011499	ATGC	2	8	9954	9961	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_011499	GAAA	2	8	9991	9998	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.