MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Escherichia coli SE11 plasmid pSE11-1

Total Repeats: 30

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011419	TGCGTA	2	12	332	343	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	209921953
2	NC_011419	GTGAAA	2	12	749	760	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	209921953
3	NC_011419	GGATGG	2	12	1799	1810	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011419	ATAGAT	3	18	2796	2813	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	209921956
5	NC_011419	AGTACA	2	12	2941	2952	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_011419	CCATCA	2	12	5146	5157	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	209921961
7	NC_011419	CCATCA	2	12	9428	9439	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	209921967
8	NC_011419	ATGCTC	2	12	11832	11843	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	209921970
9	NC_011419	TGCTGA	2	12	13019	13030	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	209921971
10	NC_011419	CAATAA	2	12	14838	14849	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_011419	GGCTTT	2	12	15980	15991	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	209921975
12	NC_011419	ATTTTG	2	12	18493	18504	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	209921979
13	NC_011419	GTTGTG	2	12	23770	23781	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011419	CCGTAG	2	12	24077	24088	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	209921985
15	NC_011419	AACAGC	2	12	28249	28260	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	209921990
16	NC_011419	AGCCTC	2	12	38548	38559	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	209922008
17	NC_011419	GGCGCT	2	12	39554	39565	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	209922010
18	NC_011419	CAGGTG	2	12	39585	39596	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	209922010
19	NC_011419	GTGGCG	2	12	39675	39686	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	209922010
20	NC_011419	GCCGGA	2	12	39926	39937	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	209922010
21	NC_011419	GGCTGT	2	12	41464	41475	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	209922012
22	NC_011419	CCCGTA	2	12	45660	45671	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	209922019
23	NC_011419	GATATC	2	12	53018	53029	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	209922027
24	NC_011419	TGTGCC	2	12	60072	60083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209922036
25	NC_011419	ACCGGT	2	12	65138	65149	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	209922040
26	NC_011419	CTTTTC	2	12	67561	67572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209922041
27	NC_011419	TTCCGG	2	12	67753	67764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209922041
28	NC_011419	AGTGTC	2	12	73866	73877	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	209922050
29	NC_011419	GGAAAA	2	12	81051	81062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209922056
30	NC_011419	GTTTAT	2	12	98543	98554	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.