MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli SE11 plasmid pSE11-1

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011419	CAAA	2	8	1261	1268	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011419	AACA	2	8	1386	1393	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011419	CCCG	2	8	1576	1583	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_011419	ATCA	2	8	1825	1832	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011419	CTGA	2	8	3040	3047	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_011419	GCTG	2	8	5445	5452	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_011419	CCGA	2	8	5566	5573	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_011419	CATC	2	8	5833	5840	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_011419	GCCG	2	8	9213	9220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_011419	CGCC	2	8	9374	9381	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11	NC_011419	GGCT	2	8	10554	10561	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011419	ATAA	2	8	10760	10767	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011419	ATTC	2	8	10773	10780	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_011419	TACT	2	8	10858	10865	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_011419	CTTT	2	8	14772	14779	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011419	GAAT	2	8	20931	20938	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011419	TCAG	2	8	21204	21211	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_011419	TGTC	2	8	23171	23178	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_011419	ATCC	2	8	23411	23418	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_011419	CTCA	2	8	24945	24952	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_011419	ATAC	2	8	25594	25601	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_011419	AACA	2	8	28141	28148	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_011419	TGTT	2	8	28843	28850	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011419	ACGG	2	8	36958	36965	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_011419	TGCC	2	8	37671	37678	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_011419	GCCT	2	8	43745	43752	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_011419	CTAT	2	8	44917	44924	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_011419	ATTT	2	8	56471	56478	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011419	GTTG	2	8	57391	57398	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011419	TTTA	2	8	58432	58439	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011419	CAAA	2	8	58465	58472	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_011419	CTAT	2	8	59195	59202	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_011419	ACAG	2	8	80281	80288	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_011419	GTTT	2	8	80295	80302	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011419	AAAT	2	8	80325	80332	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011419	CTGG	2	8	80389	80396	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_011419	AGAA	2	8	95920	95927	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011419	AAAG	2	8	96566	96573	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011419	CGAG	2	8	96619	96626	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_011419	AGAA	2	8	96634	96641	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011419	GGCC	2	8	97465	97472	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_011419	TTTC	2	8	97513	97520	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_011419	TGCC	2	8	99026	99033	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_011419	TCTT	2	8	99923	99930	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.