MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli SE11 plasmid pSE11-1

Total Repeats: 213

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011419	CCGG	2	8	402	409	0 %	0 %	50 %	50 %	209921953
2	NC_011419	GAAA	2	8	504	511	75 %	0 %	25 %	0 %	209921953
3	NC_011419	CTGC	2	8	919	926	0 %	25 %	25 %	50 %	209921953
4	NC_011419	GCTG	2	8	1053	1060	0 %	25 %	50 %	25 %	209921953
5	NC_011419	CCCG	2	8	3533	3540	0 %	0 %	25 %	75 %	209921958
6	NC_011419	GAAA	2	8	3676	3683	75 %	0 %	25 %	0 %	209921958
7	NC_011419	GGCG	2	8	4636	4643	0 %	0 %	75 %	25 %	209921960
8	NC_011419	CAGC	2	8	4953	4960	25 %	0 %	25 %	50 %	209921960
9	NC_011419	TCGT	2	8	6534	6541	0 %	50 %	25 %	25 %	209921962
10	NC_011419	CTCG	2	8	6586	6593	0 %	25 %	25 %	50 %	209921962
11	NC_011419	TGCA	2	8	6910	6917	25 %	25 %	25 %	25 %	209921962
12	NC_011419	GAAC	2	8	6929	6936	50 %	0 %	25 %	25 %	209921962
13	NC_011419	ACGC	2	8	7012	7019	25 %	0 %	25 %	50 %	209921962
14	NC_011419	GCTG	2	8	7044	7051	0 %	25 %	50 %	25 %	209921962
15	NC_011419	TGCA	2	8	7730	7737	25 %	25 %	25 %	25 %	209921963
16	NC_011419	CAGG	2	8	8229	8236	25 %	0 %	50 %	25 %	209921963
17	NC_011419	TCGC	2	8	8269	8276	0 %	25 %	25 %	50 %	209921963
18	NC_011419	CAAT	2	8	8498	8505	50 %	25 %	0 %	25 %	209921964
19	NC_011419	AACC	2	8	8531	8538	50 %	0 %	0 %	50 %	209921964
20	NC_011419	GAAT	2	8	8690	8697	50 %	25 %	25 %	0 %	209921965
21	NC_011419	AACC	2	8	8851	8858	50 %	0 %	0 %	50 %	209921965
22	NC_011419	GGCG	2	8	9810	9817	0 %	0 %	75 %	25 %	209921968
23	NC_011419	CAGC	2	8	10127	10134	25 %	0 %	25 %	50 %	209921968
24	NC_011419	GGGA	2	8	10313	10320	25 %	0 %	75 %	0 %	209921969
25	NC_011419	CTGG	2	8	10354	10361	0 %	25 %	50 %	25 %	209921969
26	NC_011419	AAAG	2	8	11931	11938	75 %	0 %	25 %	0 %	209921970
27	NC_011419	GCAG	2	8	12932	12939	25 %	0 %	50 %	25 %	209921971
28	NC_011419	TGCT	2	8	13129	13136	0 %	50 %	25 %	25 %	209921971
29	NC_011419	ATCA	2	8	13815	13822	50 %	25 %	0 %	25 %	209921971
30	NC_011419	AATT	2	8	13877	13884	50 %	50 %	0 %	0 %	209921971
31	NC_011419	TGAT	2	8	14353	14360	25 %	50 %	25 %	0 %	209921971
32	NC_011419	TAAA	2	8	14400	14407	75 %	25 %	0 %	0 %	209921971
33	NC_011419	ACAG	2	8	14431	14438	50 %	0 %	25 %	25 %	209921972
34	NC_011419	AGAA	2	8	14454	14461	75 %	0 %	25 %	0 %	209921972
35	NC_011419	AGCA	2	8	14514	14521	50 %	0 %	25 %	25 %	209921972
36	NC_011419	CTTC	2	8	15364	15371	0 %	50 %	0 %	50 %	209921974
37	NC_011419	CGTC	2	8	15605	15612	0 %	25 %	25 %	50 %	209921974
38	NC_011419	CAGC	2	8	15654	15661	25 %	0 %	25 %	50 %	209921974
39	NC_011419	CAGC	2	8	15788	15795	25 %	0 %	25 %	50 %	209921974
40	NC_011419	CATT	2	8	15922	15929	25 %	50 %	0 %	25 %	209921975
41	NC_011419	ATCC	2	8	16103	16110	25 %	25 %	0 %	50 %	209921975
42	NC_011419	ATTT	2	8	18044	18051	25 %	75 %	0 %	0 %	209921979
43	NC_011419	ATTT	2	8	18919	18926	25 %	75 %	0 %	0 %	209921979
44	NC_011419	TCAT	2	8	19778	19785	25 %	50 %	0 %	25 %	209921980
45	NC_011419	TCAT	2	8	20189	20196	25 %	50 %	0 %	25 %	209921980
46	NC_011419	CTGA	2	8	20751	20758	25 %	25 %	25 %	25 %	209921981
47	NC_011419	CTGT	2	8	20849	20856	0 %	50 %	25 %	25 %	209921981
48	NC_011419	GCTG	2	8	20857	20864	0 %	25 %	50 %	25 %	209921981
49	NC_011419	CCGG	2	8	23680	23687	0 %	0 %	50 %	50 %	209921984
50	NC_011419	CGGC	2	8	23844	23851	0 %	0 %	50 %	50 %	209921985
51	NC_011419	CGTC	2	8	23996	24003	0 %	25 %	25 %	50 %	209921985
52	NC_011419	CGGC	2	8	24266	24273	0 %	0 %	50 %	50 %	209921985
53	NC_011419	CGTG	2	8	24350	24357	0 %	25 %	50 %	25 %	209921985
54	NC_011419	ATCC	2	8	25487	25494	25 %	25 %	0 %	50 %	209921986
55	NC_011419	GCTG	2	8	25563	25570	0 %	25 %	50 %	25 %	209921986
56	NC_011419	TACA	2	8	25865	25872	50 %	25 %	0 %	25 %	209921987
57	NC_011419	TCCC	2	8	26202	26209	0 %	25 %	0 %	75 %	209921987
58	NC_011419	AGGA	2	8	26802	26809	50 %	0 %	50 %	0 %	209921988
59	NC_011419	CAGC	2	8	26865	26872	25 %	0 %	25 %	50 %	209921988
60	NC_011419	CAGG	2	8	26927	26934	25 %	0 %	50 %	25 %	209921988
61	NC_011419	CTGA	2	8	27750	27757	25 %	25 %	25 %	25 %	209921989
62	NC_011419	ATCA	2	8	28044	28051	50 %	25 %	0 %	25 %	209921989
63	NC_011419	AACA	2	8	28065	28072	75 %	0 %	0 %	25 %	209921989
64	NC_011419	GAAA	3	12	29242	29253	75 %	0 %	25 %	0 %	209921991
65	NC_011419	AAAT	2	8	29869	29876	75 %	25 %	0 %	0 %	209921992
66	NC_011419	GTTA	2	8	29989	29996	25 %	50 %	25 %	0 %	209921992
67	NC_011419	CAGC	2	8	30503	30510	25 %	0 %	25 %	50 %	209921993
68	NC_011419	GTGA	2	8	31580	31587	25 %	25 %	50 %	0 %	209921994
69	NC_011419	AGAA	2	8	31815	31822	75 %	0 %	25 %	0 %	209921994
70	NC_011419	CAGC	2	8	31996	32003	25 %	0 %	25 %	50 %	209921995
71	NC_011419	GTAT	2	8	32648	32655	25 %	50 %	25 %	0 %	209921997
72	NC_011419	TTCA	2	8	33286	33293	25 %	50 %	0 %	25 %	209921997
73	NC_011419	TGGC	2	8	33408	33415	0 %	25 %	50 %	25 %	209921997
74	NC_011419	CGGG	2	8	33566	33573	0 %	0 %	75 %	25 %	209921998
75	NC_011419	GCAG	2	8	34450	34457	25 %	0 %	50 %	25 %	209921999
76	NC_011419	ATGA	2	8	34699	34706	50 %	25 %	25 %	0 %	209922000
77	NC_011419	CAGT	2	8	35593	35600	25 %	25 %	25 %	25 %	209922002
78	NC_011419	AGTG	2	8	35942	35949	25 %	25 %	50 %	0 %	209922002
79	NC_011419	GGCA	2	8	37291	37298	25 %	0 %	50 %	25 %	209922005
80	NC_011419	GTAA	2	8	38892	38899	50 %	25 %	25 %	0 %	209922009
81	NC_011419	AAGC	2	8	38998	39005	50 %	0 %	25 %	25 %	209922010
82	NC_011419	GAAC	2	8	39971	39978	50 %	0 %	25 %	25 %	209922010
83	NC_011419	ACGC	2	8	40268	40275	25 %	0 %	25 %	50 %	209922010
84	NC_011419	GAAG	2	8	40436	40443	50 %	0 %	50 %	0 %	209922010
85	NC_011419	TCAG	2	8	40537	40544	25 %	25 %	25 %	25 %	209922010
86	NC_011419	CAGA	2	8	40872	40879	50 %	0 %	25 %	25 %	209922010
87	NC_011419	TCAC	2	8	41068	41075	25 %	25 %	0 %	50 %	209922011
88	NC_011419	CTTT	2	8	41532	41539	0 %	75 %	0 %	25 %	209922012
89	NC_011419	TGGC	2	8	41636	41643	0 %	25 %	50 %	25 %	209922012
90	NC_011419	CCGT	2	8	41723	41730	0 %	25 %	25 %	50 %	209922012
91	NC_011419	CTGG	2	8	45681	45688	0 %	25 %	50 %	25 %	209922019
92	NC_011419	GCTG	2	8	45960	45967	0 %	25 %	50 %	25 %	209922019
93	NC_011419	ATAA	2	8	46752	46759	75 %	25 %	0 %	0 %	209922022
94	NC_011419	TGCC	2	8	46963	46970	0 %	25 %	25 %	50 %	209922022
95	NC_011419	TGAC	2	8	47463	47470	25 %	25 %	25 %	25 %	209922023
96	NC_011419	TGAT	2	8	47712	47719	25 %	50 %	25 %	0 %	209922023
97	NC_011419	CCTG	2	8	48225	48232	0 %	25 %	25 %	50 %	209922024
98	NC_011419	AGTG	2	8	48762	48769	25 %	25 %	50 %	0 %	209922025
99	NC_011419	AAGA	2	8	48780	48787	75 %	0 %	25 %	0 %	209922025
100	NC_011419	TGTT	2	8	48992	48999	0 %	75 %	25 %	0 %	209922025
101	NC_011419	TTCG	2	8	49147	49154	0 %	50 %	25 %	25 %	209922026
102	NC_011419	TGCC	2	8	49681	49688	0 %	25 %	25 %	50 %	209922026
103	NC_011419	GATG	2	8	49954	49961	25 %	25 %	50 %	0 %	209922026
104	NC_011419	AAAG	2	8	50555	50562	75 %	0 %	25 %	0 %	209922026
105	NC_011419	TTTG	2	8	50818	50825	0 %	75 %	25 %	0 %	209922026
106	NC_011419	ACAA	2	8	51585	51592	75 %	0 %	0 %	25 %	209922026
107	NC_011419	GAAG	2	8	51695	51702	50 %	0 %	50 %	0 %	209922026
108	NC_011419	GGTT	2	8	51868	51875	0 %	50 %	50 %	0 %	209922027
109	NC_011419	TCAA	2	8	52461	52468	50 %	25 %	0 %	25 %	209922027
110	NC_011419	CGGT	2	8	54430	54437	0 %	25 %	50 %	25 %	209922028
111	NC_011419	GGCT	2	8	54507	54514	0 %	25 %	50 %	25 %	209922028
112	NC_011419	CAGG	2	8	54535	54542	25 %	0 %	50 %	25 %	209922028
113	NC_011419	GTTC	2	8	54562	54569	0 %	50 %	25 %	25 %	209922028
114	NC_011419	GCAG	2	8	54950	54957	25 %	0 %	50 %	25 %	209922028
115	NC_011419	ATCA	2	8	55002	55009	50 %	25 %	0 %	25 %	209922028
116	NC_011419	ATCA	2	8	56631	56638	50 %	25 %	0 %	25 %	209922030
117	NC_011419	TAAT	2	8	58048	58055	50 %	50 %	0 %	0 %	209922033
118	NC_011419	GCTG	2	8	58058	58065	0 %	25 %	50 %	25 %	209922033
119	NC_011419	CAGA	2	8	58223	58230	50 %	0 %	25 %	25 %	209922034
120	NC_011419	TTGT	2	8	58903	58910	0 %	75 %	25 %	0 %	209922035
121	NC_011419	AAGA	2	8	59093	59100	75 %	0 %	25 %	0 %	209922035
122	NC_011419	TCTG	2	8	59147	59154	0 %	50 %	25 %	25 %	209922035
123	NC_011419	AATA	2	8	59346	59353	75 %	25 %	0 %	0 %	209922036
124	NC_011419	AGGT	2	8	59430	59437	25 %	25 %	50 %	0 %	209922036
125	NC_011419	GAAT	2	8	59801	59808	50 %	25 %	25 %	0 %	209922036
126	NC_011419	CAGC	2	8	60326	60333	25 %	0 %	25 %	50 %	209922036
127	NC_011419	ACCC	2	8	60388	60395	25 %	0 %	0 %	75 %	209922036
128	NC_011419	GGCT	2	8	60719	60726	0 %	25 %	50 %	25 %	209922036
129	NC_011419	TTAA	2	8	61462	61469	50 %	50 %	0 %	0 %	209922036
130	NC_011419	GCCA	2	8	61553	61560	25 %	0 %	25 %	50 %	209922037
131	NC_011419	TGGC	2	8	61855	61862	0 %	25 %	50 %	25 %	209922037
132	NC_011419	ATGG	2	8	62038	62045	25 %	25 %	50 %	0 %	209922037
133	NC_011419	TGAT	2	8	62141	62148	25 %	50 %	25 %	0 %	209922038
134	NC_011419	TGAT	2	8	63134	63141	25 %	50 %	25 %	0 %	209922038
135	NC_011419	GCCC	2	8	63980	63987	0 %	0 %	25 %	75 %	209922040
136	NC_011419	GCCT	2	8	64639	64646	0 %	25 %	25 %	50 %	209922040
137	NC_011419	CAGA	2	8	65550	65557	50 %	0 %	25 %	25 %	209922040
138	NC_011419	CCGC	2	8	66039	66046	0 %	0 %	25 %	75 %	209922040
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.