MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli SE11 plasmid pSE11-1

Total Repeats: 187

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011419	ATC	2	6	1102	1107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011419	TCA	2	6	1216	1221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011419	GTT	2	6	1234	1239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011419	AAG	2	6	1276	1281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011419	ATT	2	6	1325	1330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011419	CGC	2	6	1349	1354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_011419	ACC	2	6	1492	1497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_011419	CAC	2	6	1521	1526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_011419	GCA	2	6	1533	1538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011419	GCC	2	6	1570	1575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_011419	AAC	2	6	1593	1598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011419	TGT	2	6	1617	1622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011419	TCT	2	6	1646	1651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011419	CGG	2	6	1854	1859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011419	AAC	2	6	1881	1886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011419	GCC	2	6	1892	1897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_011419	ATT	2	6	1916	1921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011419	ATT	2	6	2591	2596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011419	AAT	2	6	2625	2630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011419	TAC	2	6	2998	3003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_011419	GTT	2	6	3016	3021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011419	ACT	2	6	3060	3065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011419	GCG	2	6	3084	3089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011419	GAT	2	6	5085	5090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011419	CAC	2	6	5099	5104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_011419	GCC	2	6	5302	5307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_011419	TGA	2	6	5346	5351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011419	GCT	2	6	5387	5392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011419	GCC	2	6	5412	5417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_011419	TCG	3	9	5423	5431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011419	CGC	2	6	5495	5500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_011419	CCG	2	6	5630	5635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_011419	CAC	2	6	5644	5649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_011419	TGT	2	6	5655	5660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011419	CTT	2	6	5686	5691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011419	TCA	2	6	5742	5747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011419	GAC	2	6	5797	5802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011419	GTG	2	6	5883	5888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011419	CAG	2	6	5933	5938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011419	TGG	2	6	5985	5990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011419	AGT	2	6	5996	6001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011419	ATG	2	6	6023	6028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011419	GCC	2	6	6107	6112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_011419	GGA	2	6	6289	6294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011419	GAA	2	6	6354	6359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011419	ACC	2	6	6366	6371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_011419	GCC	2	6	6492	6497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_011419	ATC	2	6	7189	7194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011419	CGG	2	6	8454	8459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011419	CAC	2	6	8477	8482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_011419	TCA	2	6	9184	9189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011419	CGG	2	6	9249	9254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011419	GCC	2	6	9305	9310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_011419	AGC	2	6	9339	9344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011419	TCG	2	6	9394	9399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011419	GAT	2	6	10259	10264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011419	TAA	2	6	10574	10579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011419	TAA	2	6	10630	10635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011419	GTA	2	6	10664	10669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011419	TGT	2	6	10748	10753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011419	AGA	3	9	10792	10800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011419	TGT	2	6	12289	12294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011419	TGC	2	6	12345	12350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011419	CAG	2	6	12359	12364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011419	TAA	2	6	12440	12445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011419	ACA	2	6	14808	14813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011419	ATA	3	9	14827	14835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011419	CAT	2	6	14865	14870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011419	ATA	2	6	16184	16189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011419	AGG	2	6	16371	16376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011419	TGA	2	6	17647	17652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011419	CTT	2	6	17686	17691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011419	TTA	3	9	17828	17836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011419	GTC	2	6	20980	20985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011419	GAA	2	6	20995	21000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011419	TTG	2	6	21187	21192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011419	CAA	2	6	21233	21238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011419	CAA	2	6	21250	21255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011419	AAT	2	6	21282	21287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011419	TCA	2	6	21341	21346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_011419	TAT	2	6	21372	21377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011419	CGG	2	6	22515	22520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011419	TGT	2	6	22528	22533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011419	ACC	2	6	22587	22592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_011419	TGC	2	6	22646	22651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_011419	CCT	2	6	23004	23009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_011419	GTT	3	9	23016	23024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011419	ATC	2	6	23046	23051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_011419	ATG	2	6	23147	23152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011419	TCC	2	6	23165	23170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_011419	TTG	2	6	23382	23387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011419	CCT	2	6	23755	23760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_011419	GAT	2	6	23761	23766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011419	CTT	2	6	24857	24862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_011419	TGT	2	6	24971	24976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011419	TTA	2	6	25135	25140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011419	GAT	2	6	25189	25194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011419	TCT	2	6	25615	25620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011419	TTA	2	6	25621	25626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011419	TTC	2	6	28527	28532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_011419	ATG	2	6	28646	28651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011419	TAA	2	6	32277	32282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011419	ATT	2	6	32308	32313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011419	CAC	2	6	33887	33892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_011419	AAG	2	6	33921	33926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011419	GTT	2	6	33931	33936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011419	CGC	2	6	35297	35302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_011419	GCG	2	6	35309	35314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_011419	GGC	2	6	36966	36971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_011419	GCC	2	6	36975	36980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_011419	GCC	2	6	37632	37637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_011419	GCA	2	6	38049	38054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_011419	GCC	2	6	38067	38072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_011419	AAT	2	6	38954	38959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011419	GCA	2	6	40954	40959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_011419	GGT	2	6	42774	42779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011419	GCG	2	6	42791	42796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011419	CGG	2	6	42830	42835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_011419	CGT	2	6	42897	42902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011419	CGC	2	6	42962	42967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_011419	CCT	2	6	42983	42988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_011419	GGA	2	6	43167	43172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011419	CGG	2	6	43696	43701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011419	GCC	2	6	43718	43723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_011419	AGG	2	6	43760	43765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011419	GCG	2	6	43775	43780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_011419	GAA	2	6	44321	44326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011419	CAG	2	6	44389	44394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_011419	CCG	2	6	44876	44881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_011419	GGC	2	6	45229	45234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_011419	AGG	2	6	45258	45263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011419	CAG	2	6	46223	46228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_011419	ATC	2	6	48157	48162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_011419	ATC	2	6	48569	48574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_011419	ATG	2	6	48627	48632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011419	TTG	2	6	56526	56531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011419	CGG	2	6	56877	56882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_011419	GCC	2	6	56893	56898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_011419	TTG	2	6	56902	56907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011419	TCT	2	6	56933	56938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_011419	ACA	2	6	57333	57338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_011419	AGT	2	6	57482	57487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.