MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli SE11 plasmid pSE11-1

Total Repeats: 165

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011419	GC	3	6	247	252	0 %	0 %	50 %	50 %	209921953
2	NC_011419	AC	4	8	469	476	50 %	0 %	0 %	50 %	209921953
3	NC_011419	GT	3	6	614	619	0 %	50 %	50 %	0 %	209921953
4	NC_011419	GC	3	6	897	902	0 %	0 %	50 %	50 %	209921953
5	NC_011419	CG	3	6	1462	1467	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_011419	CA	3	6	2520	2525	50 %	0 %	0 %	50 %	209921955
7	NC_011419	TG	4	8	2543	2550	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011419	TA	3	6	3316	3321	50 %	50 %	0 %	0 %	209921957
9	NC_011419	TA	3	6	3803	3808	50 %	50 %	0 %	0 %	209921958
10	NC_011419	CA	3	6	3878	3883	50 %	0 %	0 %	50 %	209921958
11	NC_011419	GC	3	6	4623	4628	0 %	0 %	50 %	50 %	209921960
12	NC_011419	GA	3	6	4742	4747	50 %	0 %	50 %	0 %	209921960
13	NC_011419	CG	4	8	5867	5874	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_011419	GC	3	6	6644	6649	0 %	0 %	50 %	50 %	209921962
15	NC_011419	CG	3	6	6870	6875	0 %	0 %	50 %	50 %	209921962
16	NC_011419	AG	3	6	8842	8847	50 %	0 %	50 %	0 %	209921965
17	NC_011419	GC	3	6	9797	9802	0 %	0 %	50 %	50 %	209921968
18	NC_011419	GA	3	6	9916	9921	50 %	0 %	50 %	0 %	209921968
19	NC_011419	AT	3	6	10729	10734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011419	TC	3	6	10735	10740	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_011419	GC	3	6	12775	12780	0 %	0 %	50 %	50 %	209921971
22	NC_011419	CT	3	6	12825	12830	0 %	50 %	0 %	50 %	209921971
23	NC_011419	AC	3	6	12862	12867	50 %	0 %	0 %	50 %	209921971
24	NC_011419	GA	3	6	12944	12949	50 %	0 %	50 %	0 %	209921971
25	NC_011419	AG	3	6	13001	13006	50 %	0 %	50 %	0 %	209921971
26	NC_011419	AG	3	6	13947	13952	50 %	0 %	50 %	0 %	209921971
27	NC_011419	AT	3	6	14101	14106	50 %	50 %	0 %	0 %	209921971
28	NC_011419	TA	3	6	14462	14467	50 %	50 %	0 %	0 %	209921972
29	NC_011419	AG	3	6	14639	14644	50 %	0 %	50 %	0 %	209921972
30	NC_011419	AT	3	6	14701	14706	50 %	50 %	0 %	0 %	209921972
31	NC_011419	TG	3	6	16165	16170	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011419	GA	3	6	16534	16539	50 %	0 %	50 %	0 %	209921977
33	NC_011419	GC	3	6	16540	16545	0 %	0 %	50 %	50 %	209921977
34	NC_011419	TC	3	6	16981	16986	0 %	50 %	0 %	50 %	209921978
35	NC_011419	GA	3	6	17046	17051	50 %	0 %	50 %	0 %	209921978
36	NC_011419	CG	3	6	17966	17971	0 %	0 %	50 %	50 %	209921979
37	NC_011419	GC	4	8	18341	18348	0 %	0 %	50 %	50 %	209921979
38	NC_011419	AT	3	6	18929	18934	50 %	50 %	0 %	0 %	209921979
39	NC_011419	AG	3	6	19224	19229	50 %	0 %	50 %	0 %	209921979
40	NC_011419	AG	3	6	19478	19483	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011419	CA	4	8	19810	19817	50 %	0 %	0 %	50 %	209921980
42	NC_011419	TA	3	6	21013	21018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011419	GA	3	6	21040	21045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011419	CT	3	6	21290	21295	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_011419	GC	3	6	21610	21615	0 %	0 %	50 %	50 %	209921982
46	NC_011419	GC	3	6	21820	21825	0 %	0 %	50 %	50 %	209921982
47	NC_011419	TC	3	6	22413	22418	0 %	50 %	0 %	50 %	209921982
48	NC_011419	GA	3	6	22424	22429	50 %	0 %	50 %	0 %	209921982
49	NC_011419	CA	3	6	23092	23097	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_011419	CG	3	6	24309	24314	0 %	0 %	50 %	50 %	209921985
51	NC_011419	GA	3	6	24514	24519	50 %	0 %	50 %	0 %	209921985
52	NC_011419	CT	3	6	24683	24688	0 %	50 %	0 %	50 %	209921985
53	NC_011419	TG	3	6	24743	24748	0 %	50 %	50 %	0 %	209921985
54	NC_011419	CG	3	6	24910	24915	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_011419	GC	3	6	25001	25006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_011419	GT	3	6	25146	25151	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011419	AT	3	6	25669	25674	50 %	50 %	0 %	0 %	209921987
58	NC_011419	AT	3	6	26445	26450	50 %	50 %	0 %	0 %	209921987
59	NC_011419	GC	3	6	26684	26689	0 %	0 %	50 %	50 %	209921988
60	NC_011419	AT	3	6	27291	27296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011419	GT	3	6	28078	28083	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011419	AT	3	6	28414	28419	50 %	50 %	0 %	0 %	209921990
63	NC_011419	AG	3	6	28433	28438	50 %	0 %	50 %	0 %	209921990
64	NC_011419	TG	3	6	28499	28504	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011419	TG	3	6	28737	28742	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011419	TG	3	6	29717	29722	0 %	50 %	50 %	0 %	209921991
67	NC_011419	GC	3	6	29980	29985	0 %	0 %	50 %	50 %	209921992
68	NC_011419	TG	3	6	30598	30603	0 %	50 %	50 %	0 %	209921993
69	NC_011419	GA	3	6	31205	31210	50 %	0 %	50 %	0 %	209921993
70	NC_011419	GC	3	6	31431	31436	0 %	0 %	50 %	50 %	209921993
71	NC_011419	CA	3	6	31440	31445	50 %	0 %	0 %	50 %	209921993
72	NC_011419	GC	3	6	31809	31814	0 %	0 %	50 %	50 %	209921994
73	NC_011419	CA	4	8	32290	32297	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_011419	GT	3	6	32472	32477	0 %	50 %	50 %	0 %	209921996
75	NC_011419	AC	3	6	32881	32886	50 %	0 %	0 %	50 %	209921997
76	NC_011419	TG	3	6	33086	33091	0 %	50 %	50 %	0 %	209921997
77	NC_011419	CA	3	6	34416	34421	50 %	0 %	0 %	50 %	209921999
78	NC_011419	GC	3	6	34647	34652	0 %	0 %	50 %	50 %	209922000
79	NC_011419	GC	3	6	35012	35017	0 %	0 %	50 %	50 %	209922001
80	NC_011419	TG	3	6	35948	35953	0 %	50 %	50 %	0 %	209922002
81	NC_011419	GC	3	6	37234	37239	0 %	0 %	50 %	50 %	209922005
82	NC_011419	CG	3	6	37646	37651	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_011419	GT	3	6	38022	38027	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011419	TG	3	6	38639	38644	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011419	CG	3	6	39578	39583	0 %	0 %	50 %	50 %	209922010
86	NC_011419	TG	3	6	40855	40860	0 %	50 %	50 %	0 %	209922010
87	NC_011419	TC	3	6	41221	41226	0 %	50 %	0 %	50 %	209922011
88	NC_011419	GT	3	6	44070	44075	0 %	50 %	50 %	0 %	209922015
89	NC_011419	CT	3	6	44870	44875	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_011419	CG	3	6	45171	45176	0 %	0 %	50 %	50 %	209922018
91	NC_011419	CA	3	6	46435	46440	50 %	0 %	0 %	50 %	209922021
92	NC_011419	GT	3	6	46925	46930	0 %	50 %	50 %	0 %	209922022
93	NC_011419	TC	3	6	46957	46962	0 %	50 %	0 %	50 %	209922022
94	NC_011419	GA	3	6	47050	47055	50 %	0 %	50 %	0 %	209922022
95	NC_011419	GC	3	6	47402	47407	0 %	0 %	50 %	50 %	209922023
96	NC_011419	TC	3	6	48320	48325	0 %	50 %	0 %	50 %	209922024
97	NC_011419	TC	3	6	48539	48544	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_011419	TC	3	6	48830	48835	0 %	50 %	0 %	50 %	209922025
99	NC_011419	CA	3	6	50614	50619	50 %	0 %	0 %	50 %	209922026
100	NC_011419	CA	3	6	51057	51062	50 %	0 %	0 %	50 %	209922026
101	NC_011419	GA	3	6	53100	53105	50 %	0 %	50 %	0 %	209922027
102	NC_011419	CA	3	6	53318	53323	50 %	0 %	0 %	50 %	209922027
103	NC_011419	CA	3	6	54410	54415	50 %	0 %	0 %	50 %	209922028
104	NC_011419	AG	3	6	54847	54852	50 %	0 %	50 %	0 %	209922028
105	NC_011419	CT	3	6	55634	55639	0 %	50 %	0 %	50 %	209922029
106	NC_011419	TG	3	6	56033	56038	0 %	50 %	50 %	0 %	209922029
107	NC_011419	TG	3	6	56754	56759	0 %	50 %	50 %	0 %	209922030
108	NC_011419	AT	3	6	58142	58147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011419	TA	4	8	59662	59669	50 %	50 %	0 %	0 %	209922036
110	NC_011419	TA	4	8	59984	59991	50 %	50 %	0 %	0 %	209922036
111	NC_011419	CA	3	6	61452	61457	50 %	0 %	0 %	50 %	209922036
112	NC_011419	AT	3	6	62396	62401	50 %	50 %	0 %	0 %	209922038
113	NC_011419	GT	3	6	62709	62714	0 %	50 %	50 %	0 %	209922038
114	NC_011419	AG	3	6	64321	64326	50 %	0 %	50 %	0 %	209922040
115	NC_011419	AG	3	6	65158	65163	50 %	0 %	50 %	0 %	209922040
116	NC_011419	CA	3	6	65164	65169	50 %	0 %	0 %	50 %	209922040
117	NC_011419	GC	3	6	65661	65666	0 %	0 %	50 %	50 %	209922040
118	NC_011419	TG	3	6	66063	66068	0 %	50 %	50 %	0 %	209922040
119	NC_011419	AG	3	6	66761	66766	50 %	0 %	50 %	0 %	209922040
120	NC_011419	AG	3	6	67222	67227	50 %	0 %	50 %	0 %	209922041
121	NC_011419	GT	3	6	67644	67649	0 %	50 %	50 %	0 %	209922041
122	NC_011419	AT	3	6	68499	68504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011419	AT	3	6	70433	70438	50 %	50 %	0 %	0 %	209922046
124	NC_011419	AG	3	6	71701	71706	50 %	0 %	50 %	0 %	209922047
125	NC_011419	GA	3	6	73122	73127	50 %	0 %	50 %	0 %	209922050
126	NC_011419	CT	3	6	73974	73979	0 %	50 %	0 %	50 %	209922050
127	NC_011419	CT	3	6	74034	74039	0 %	50 %	0 %	50 %	209922050
128	NC_011419	TG	3	6	74169	74174	0 %	50 %	50 %	0 %	209922050
129	NC_011419	GT	3	6	76774	76779	0 %	50 %	50 %	0 %	209922050
130	NC_011419	GA	3	6	77082	77087	50 %	0 %	50 %	0 %	209922051
131	NC_011419	AT	3	6	77192	77197	50 %	50 %	0 %	0 %	209922051
132	NC_011419	AT	3	6	78003	78008	50 %	50 %	0 %	0 %	209922053
133	NC_011419	AT	3	6	78363	78368	50 %	50 %	0 %	0 %	209922053
134	NC_011419	GA	3	6	78537	78542	50 %	0 %	50 %	0 %	209922053
135	NC_011419	GA	3	6	79756	79761	50 %	0 %	50 %	0 %	209922054
136	NC_011419	AC	3	6	80075	80080	50 %	0 %	0 %	50 %	209922055
137	NC_011419	GA	3	6	81359	81364	50 %	0 %	50 %	0 %	209922057
138	NC_011419	AT	3	6	82747	82752	50 %	50 %	0 %	0 %	209922058
139	NC_011419	AC	3	6	83786	83791	50 %	0 %	0 %	50 %	209922059
140	NC_011419	AT	3	6	84623	84628	50 %	50 %	0 %	0 %	209922059
141	NC_011419	TA	3	6	84892	84897	50 %	50 %	0 %	0 %	209922059
142	NC_011419	AC	4	8	85208	85215	50 %	0 %	0 %	50 %	209922060
143	NC_011419	TA	3	6	85226	85231	50 %	50 %	0 %	0 %	209922060
144	NC_011419	AT	3	6	85367	85372	50 %	50 %	0 %	0 %	209922060
145	NC_011419	GT	3	6	85581	85586	0 %	50 %	50 %	0 %	209922060
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.