MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Escherichia coli SE11 plasmid pSE11-3

Total Repeats: 29

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011416	TTTCTG	2	12	1226	1237	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	209921877
2	NC_011416	ATCAAA	2	12	6864	6875	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	209921883
3	NC_011416	AGCTGG	2	12	9455	9466	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_011416	TATCCA	2	12	10429	10440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209921887
5	NC_011416	GTGTCA	2	12	10627	10638	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	209921887
6	NC_011416	GCCGGA	2	12	12515	12526	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	209921889
7	NC_011416	CGCCAG	2	12	20018	20029	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	209921898
8	NC_011416	GGTGCA	2	12	23906	23917	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	209921901
9	NC_011416	TTGTTT	2	12	27101	27112	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	209921905
10	NC_011416	TTTCGT	2	12	28142	28153	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_011416	TGACAC	2	12	29087	29098	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	209921906
12	NC_011416	TACGGT	2	12	29344	29355	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	209921906
13	NC_011416	CGGTGG	2	12	30230	30241	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	209921906
14	NC_011416	ACGGAA	2	12	31236	31247	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	209921907
15	NC_011416	ATGGGA	2	12	32349	32360	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	209921909
16	NC_011416	TTACTG	2	12	32432	32443	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	209921909
17	NC_011416	TGGCAG	2	12	35004	35015	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	209921912
18	NC_011416	AGTCAT	2	12	37209	37220	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	209921915
19	NC_011416	AAAATA	2	12	40780	40791	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	209921919
20	NC_011416	CGGTAT	2	12	43384	43395	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	209921921
21	NC_011416	GCCGGA	2	12	46189	46200	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	209921926
22	NC_011416	CGGGCT	2	12	46818	46829	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	209921926
23	NC_011416	ACTGGA	2	12	46999	47010	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	209921926
24	NC_011416	AGTCAT	2	12	48542	48553	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	209921930
25	NC_011416	TACTTC	2	12	50193	50204	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011416	ACAGAA	2	12	50698	50709	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	209921933
27	NC_011416	GGATAT	2	12	51633	51644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209921934
28	NC_011416	AACAAA	2	12	59484	59495	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	209921940
29	NC_011416	TCTTTA	2	12	60325	60336	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.