MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Escherichia coli SE11 plasmid pSE11-3

Total Repeats: 179

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011416	GGCA	2	8	1019	1026	25 %	0 %	50 %	25 %	209921876
2	NC_011416	TGGA	2	8	2709	2716	25 %	25 %	50 %	0 %	209921878
3	NC_011416	GCCA	2	8	3410	3417	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_011416	CGAT	2	8	3485	3492	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011416	CCAG	2	8	3826	3833	25 %	0 %	25 %	50 %	209921879
6	NC_011416	CCAC	2	8	4351	4358	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
7	NC_011416	AGGA	2	8	4812	4819	50 %	0 %	50 %	0 %	209921880
8	NC_011416	TGGA	2	8	5086	5093	25 %	25 %	50 %	0 %	209921881
9	NC_011416	GAAA	2	8	5340	5347	75 %	0 %	25 %	0 %	209921881
10	NC_011416	TCGC	2	8	5797	5804	0 %	25 %	25 %	50 %	209921882
11	NC_011416	AATG	2	8	6487	6494	50 %	25 %	25 %	0 %	209921883
12	NC_011416	AGAT	2	8	6709	6716	50 %	25 %	25 %	0 %	209921883
13	NC_011416	CCAG	2	8	6837	6844	25 %	0 %	25 %	50 %	209921883
14	NC_011416	CATG	2	8	7491	7498	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_011416	TCTG	2	8	7646	7653	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011416	CAAA	2	8	8552	8559	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011416	AGTG	2	8	8807	8814	25 %	25 %	50 %	0 %	209921886
18	NC_011416	TGGA	2	8	8926	8933	25 %	25 %	50 %	0 %	209921886
19	NC_011416	GTGC	2	8	8967	8974	0 %	25 %	50 %	25 %	209921886
20	NC_011416	CGCC	2	8	8985	8992	0 %	0 %	25 %	75 %	209921886
21	NC_011416	CTGG	2	8	9258	9265	0 %	25 %	50 %	25 %	209921886
22	NC_011416	CGGG	2	8	9353	9360	0 %	0 %	75 %	25 %	209921886
23	NC_011416	CACT	2	8	9617	9624	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_011416	GACT	2	8	9769	9776	25 %	25 %	25 %	25 %	209921887
25	NC_011416	GAAT	2	8	10395	10402	50 %	25 %	25 %	0 %	209921887
26	NC_011416	CCCA	2	8	10407	10414	25 %	0 %	0 %	75 %	209921887
27	NC_011416	ACTG	2	8	10768	10775	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_011416	ACTT	2	8	10841	10848	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_011416	TCAT	2	8	10992	10999	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_011416	TGTC	2	8	11189	11196	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_011416	TGCC	2	8	12227	12234	0 %	25 %	25 %	50 %	209921889
32	NC_011416	GCCG	2	8	12605	12612	0 %	0 %	50 %	50 %	209921889
33	NC_011416	CTGG	2	8	12721	12728	0 %	25 %	50 %	25 %	209921890
34	NC_011416	CGCC	2	8	13085	13092	0 %	0 %	25 %	75 %	209921891
35	NC_011416	CCGG	2	8	13430	13437	0 %	0 %	50 %	50 %	209921891
36	NC_011416	CCTG	2	8	13452	13459	0 %	25 %	25 %	50 %	209921891
37	NC_011416	ATCC	2	8	13974	13981	25 %	25 %	0 %	50 %	209921891
38	NC_011416	TGCA	2	8	14113	14120	25 %	25 %	25 %	25 %	209921891
39	NC_011416	AGTC	2	8	14770	14777	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_011416	TCTT	2	8	14794	14801	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_011416	AATG	2	8	14924	14931	50 %	25 %	25 %	0 %	209921893
42	NC_011416	CTGG	2	8	14960	14967	0 %	25 %	50 %	25 %	209921893
43	NC_011416	GAGT	2	8	15003	15010	25 %	25 %	50 %	0 %	209921893
44	NC_011416	ACGT	2	8	15263	15270	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_011416	AGGA	2	8	15445	15452	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011416	CAAA	2	8	15976	15983	75 %	0 %	0 %	25 %	209921894
47	NC_011416	ACAG	2	8	16077	16084	50 %	0 %	25 %	25 %	209921894
48	NC_011416	AAAT	2	8	16111	16118	75 %	25 %	0 %	0 %	209921894
49	NC_011416	TGGG	2	8	16174	16181	0 %	25 %	75 %	0 %	209921894
50	NC_011416	GGTG	2	8	16391	16398	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011416	GCAG	2	8	16445	16452	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_011416	GAAC	2	8	16819	16826	50 %	0 %	25 %	25 %	209921895
53	NC_011416	ACCC	2	8	17609	17616	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
54	NC_011416	GTAT	2	8	18431	18438	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011416	GCCA	2	8	18589	18596	25 %	0 %	25 %	50 %	209921897
56	NC_011416	CTGC	2	8	18741	18748	0 %	25 %	25 %	50 %	209921897
57	NC_011416	CCTG	2	8	18935	18942	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_011416	AAGC	2	8	20035	20042	50 %	0 %	25 %	25 %	209921898
59	NC_011416	GGCC	2	8	20590	20597	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_011416	AATG	2	8	21145	21152	50 %	25 %	25 %	0 %	209921899
61	NC_011416	ACCT	2	8	22199	22206	25 %	25 %	0 %	50 %	209921899
62	NC_011416	CTGG	2	8	22813	22820	0 %	25 %	50 %	25 %	209921899
63	NC_011416	GCGT	2	8	23461	23468	0 %	25 %	50 %	25 %	209921900
64	NC_011416	CAGT	2	8	23579	23586	25 %	25 %	25 %	25 %	209921900
65	NC_011416	TGTT	2	8	23842	23849	0 %	75 %	25 %	0 %	209921901
66	NC_011416	TGGG	2	8	23949	23956	0 %	25 %	75 %	0 %	209921901
67	NC_011416	TATG	2	8	24146	24153	25 %	50 %	25 %	0 %	209921901
68	NC_011416	ATCT	2	8	24282	24289	25 %	50 %	0 %	25 %	209921901
69	NC_011416	ACGT	2	8	24481	24488	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_011416	AGCC	2	8	24657	24664	25 %	0 %	25 %	50 %	209921902
71	NC_011416	AAAC	2	8	24981	24988	75 %	0 %	0 %	25 %	209921903
72	NC_011416	CAGC	2	8	25045	25052	25 %	0 %	25 %	50 %	209921903
73	NC_011416	ACGC	2	8	25224	25231	25 %	0 %	25 %	50 %	209921903
74	NC_011416	GCTG	2	8	25236	25243	0 %	25 %	50 %	25 %	209921903
75	NC_011416	TCCG	2	8	26200	26207	0 %	25 %	25 %	50 %	209921904
76	NC_011416	TAAT	2	8	27034	27041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011416	GGAC	2	8	29358	29365	25 %	0 %	50 %	25 %	209921906
78	NC_011416	TCAG	2	8	29681	29688	25 %	25 %	25 %	25 %	209921906
79	NC_011416	TCAG	2	8	31535	31542	25 %	25 %	25 %	25 %	209921908
80	NC_011416	GCTG	2	8	32241	32248	0 %	25 %	50 %	25 %	209921909
81	NC_011416	TGAG	2	8	32396	32403	25 %	25 %	50 %	0 %	209921909
82	NC_011416	ACGG	2	8	33553	33560	25 %	0 %	50 %	25 %	209921910
83	NC_011416	AAGG	2	8	33573	33580	50 %	0 %	50 %	0 %	209921910
84	NC_011416	CTTT	2	8	33657	33664	0 %	75 %	0 %	25 %	209921910
85	NC_011416	TCAG	2	8	33767	33774	25 %	25 %	25 %	25 %	209921910
86	NC_011416	GTCT	2	8	33802	33809	0 %	50 %	25 %	25 %	209921910
87	NC_011416	GGCA	2	8	33985	33992	25 %	0 %	50 %	25 %	209921910
88	NC_011416	TGTT	2	8	34074	34081	0 %	75 %	25 %	0 %	209921911
89	NC_011416	GGAC	2	8	34501	34508	25 %	0 %	50 %	25 %	209921911
90	NC_011416	GTCC	2	8	34626	34633	0 %	25 %	25 %	50 %	209921911
91	NC_011416	CAGT	2	8	34650	34657	25 %	25 %	25 %	25 %	209921911
92	NC_011416	GAGT	2	8	34668	34675	25 %	25 %	50 %	0 %	209921911
93	NC_011416	CTGG	2	8	34937	34944	0 %	25 %	50 %	25 %	209921912
94	NC_011416	TGGT	2	8	35646	35653	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011416	CCTC	2	8	35777	35784	0 %	25 %	0 %	75 %	209921913
96	NC_011416	CCAC	2	8	36184	36191	25 %	0 %	0 %	75 %	209921914
97	NC_011416	GATG	2	8	36391	36398	25 %	25 %	50 %	0 %	209921914
98	NC_011416	CCAC	2	8	36565	36572	25 %	0 %	0 %	75 %	209921914
99	NC_011416	CAGC	2	8	36901	36908	25 %	0 %	25 %	50 %	209921914
100	NC_011416	TGCT	2	8	37604	37611	0 %	50 %	25 %	25 %	209921916
101	NC_011416	GAAA	2	8	37662	37669	75 %	0 %	25 %	0 %	209921916
102	NC_011416	GTCT	2	8	38655	38662	0 %	50 %	25 %	25 %	209921917
103	NC_011416	AATA	2	8	38856	38863	75 %	25 %	0 %	0 %	209921917
104	NC_011416	AATA	2	8	39050	39057	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011416	AATG	2	8	39404	39411	50 %	25 %	25 %	0 %	209921918
106	NC_011416	CCAT	2	8	39753	39760	25 %	25 %	0 %	50 %	209921919
107	NC_011416	AGAA	2	8	40349	40356	75 %	0 %	25 %	0 %	209921919
108	NC_011416	ATGT	2	8	41209	41216	25 %	50 %	25 %	0 %	209921920
109	NC_011416	TCTG	2	8	41535	41542	0 %	50 %	25 %	25 %	209921920
110	NC_011416	TGTC	2	8	41860	41867	0 %	50 %	25 %	25 %	209921920
111	NC_011416	GGCA	2	8	41877	41884	25 %	0 %	50 %	25 %	209921920
112	NC_011416	TTGT	2	8	42134	42141	0 %	75 %	25 %	0 %	209921920
113	NC_011416	GGCA	2	8	42161	42168	25 %	0 %	50 %	25 %	209921920
114	NC_011416	GCAG	2	8	42190	42197	25 %	0 %	50 %	25 %	209921920
115	NC_011416	GTCA	2	8	42274	42281	25 %	25 %	25 %	25 %	209921920
116	NC_011416	ATAA	2	8	42742	42749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011416	CGTT	2	8	42781	42788	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_011416	AATC	2	8	42796	42803	50 %	25 %	0 %	25 %	209921921
119	NC_011416	ATCA	2	8	42884	42891	50 %	25 %	0 %	25 %	209921921
120	NC_011416	ATCA	2	8	42944	42951	50 %	25 %	0 %	25 %	209921921
121	NC_011416	CGAA	2	8	43174	43181	50 %	0 %	25 %	25 %	209921921
122	NC_011416	CAGA	2	8	43687	43694	50 %	0 %	25 %	25 %	209921921
123	NC_011416	TGTA	2	8	43776	43783	25 %	50 %	25 %	0 %	209921921
124	NC_011416	AAAC	2	8	43912	43919	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_011416	AAAG	2	8	44087	44094	75 %	0 %	25 %	0 %	209921922
126	NC_011416	TCAG	2	8	44103	44110	25 %	25 %	25 %	25 %	209921922
127	NC_011416	AAAG	2	8	45294	45301	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011416	AAGG	2	8	45486	45493	50 %	0 %	50 %	0 %	209921924
129	NC_011416	ACTG	2	8	45878	45885	25 %	25 %	25 %	25 %	209921925
130	NC_011416	ACCG	2	8	46243	46250	25 %	0 %	25 %	50 %	209921926
131	NC_011416	GCCG	2	8	46276	46283	0 %	0 %	50 %	50 %	209921926
132	NC_011416	AGTC	2	8	46539	46546	25 %	25 %	25 %	25 %	209921926
133	NC_011416	ATCT	2	8	46703	46710	25 %	50 %	0 %	25 %	209921926
134	NC_011416	GGCG	2	8	47559	47566	0 %	0 %	75 %	25 %	209921927
135	NC_011416	GCTC	2	8	47912	47919	0 %	25 %	25 %	50 %	209921928
136	NC_011416	TTCT	2	8	47998	48005	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_011416	TTTC	2	8	48147	48154	0 %	75 %	0 %	25 %	209921929
138	NC_011416	CAGC	2	8	48234	48241	25 %	0 %	25 %	50 %	209921929
139	NC_011416	GCTG	2	8	48974	48981	0 %	25 %	50 %	25 %	209921931
140	NC_011416	ATAC	2	8	49186	49193	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_011416	AAGT	2	8	49427	49434	50 %	25 %	25 %	0 %	209921932
142	NC_011416	TCTT	2	8	49483	49490	0 %	75 %	0 %	25 %	209921932
143	NC_011416	ACAT	2	8	49895	49902	50 %	25 %	0 %	25 %	209921932
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.