MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli SE11 plasmid pSE11-3

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011416	GCCA	2	8	3410	3417	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_011416	CGAT	2	8	3485	3492	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011416	CCAC	2	8	4351	4358	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4	NC_011416	CATG	2	8	7491	7498	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011416	TCTG	2	8	7646	7653	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_011416	CAAA	2	8	8552	8559	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_011416	CACT	2	8	9617	9624	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_011416	ACTG	2	8	10768	10775	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011416	ACTT	2	8	10841	10848	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_011416	TCAT	2	8	10992	10999	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_011416	TGTC	2	8	11189	11196	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011416	AGTC	2	8	14770	14777	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_011416	TCTT	2	8	14794	14801	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_011416	ACGT	2	8	15263	15270	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_011416	AGGA	2	8	15445	15452	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011416	GGTG	2	8	16391	16398	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011416	GCAG	2	8	16445	16452	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_011416	ACCC	2	8	17609	17616	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
19	NC_011416	GTAT	2	8	18431	18438	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011416	CCTG	2	8	18935	18942	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_011416	GGCC	2	8	20590	20597	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_011416	ACGT	2	8	24481	24488	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_011416	TAAT	2	8	27034	27041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011416	TGGT	2	8	35646	35653	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011416	AATA	2	8	39050	39057	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011416	ATAA	2	8	42742	42749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011416	CGTT	2	8	42781	42788	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_011416	AAAC	2	8	43912	43919	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_011416	AAAG	2	8	45294	45301	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011416	TTCT	2	8	47998	48005	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_011416	ATAC	2	8	49186	49193	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_011416	TGAA	2	8	52478	52485	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011416	GTAG	2	8	53152	53159	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011416	CTGT	2	8	53447	53454	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_011416	TAAT	2	8	60139	60146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011416	TAAT	2	8	60176	60183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011416	CATG	2	8	60295	60302	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.