MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli SE11 plasmid pSE11-3

Total Repeats: 143

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011416	TAT	3	9	2935	2943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011416	GAA	2	6	2963	2968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011416	CAC	2	6	3239	3244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_011416	GCT	2	6	3295	3300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011416	AAC	2	6	3380	3385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011416	GTC	3	9	3426	3434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011416	GTA	2	6	3535	3540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011416	CTC	2	6	3623	3628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_011416	CCT	2	6	3630	3635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_011416	TTG	2	6	3992	3997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011416	GTG	2	6	4000	4005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011416	AAT	2	6	4112	4117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011416	CCA	2	6	4184	4189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_011416	GAA	2	6	4272	4277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011416	TTC	2	6	4293	4298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011416	CCA	2	6	4379	4384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_011416	TCA	2	6	4440	4445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011416	ACT	2	6	5905	5910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011416	CTT	2	6	6137	6142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011416	TTC	2	6	6151	6156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_011416	TAA	2	6	6286	6291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011416	AAG	2	6	7316	7321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011416	ATA	2	6	7403	7408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011416	GAT	2	6	7429	7434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011416	ATA	2	6	7482	7487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011416	TTA	2	6	7527	7532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011416	TGT	2	6	7546	7551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011416	GCC	2	6	7558	7563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_011416	GGA	2	6	8042	8047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011416	ACC	2	6	8065	8070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_011416	CCA	2	6	8302	8307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_011416	ATC	2	6	8408	8413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011416	AAT	2	6	8536	8541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011416	TGC	2	6	8570	8575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011416	GCA	2	6	9575	9580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011416	ATA	2	6	9632	9637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011416	CCT	2	6	10710	10715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_011416	TAT	2	6	11071	11076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011416	GCG	2	6	11166	11171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011416	GGT	2	6	11327	11332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011416	GCT	2	6	11335	11340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011416	CGC	2	6	11438	11443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_011416	AAT	2	6	12011	12016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011416	CAT	2	6	12020	12025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011416	GAA	2	6	12091	12096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011416	ATT	2	6	14738	14743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011416	GAA	2	6	15537	15542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011416	AGT	2	6	15605	15610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011416	TTG	2	6	15644	15649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011416	TGT	2	6	15702	15707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011416	GTG	2	6	15721	15726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011416	CAT	2	6	15824	15829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011416	GTC	2	6	15915	15920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011416	TTA	2	6	16400	16405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011416	GCA	2	6	16503	16508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011416	GCT	2	6	17214	17219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011416	TCC	2	6	17223	17228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_011416	GCA	2	6	17233	17238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011416	ATG	2	6	17329	17334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011416	GTC	2	6	17369	17374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011416	CTC	2	6	17421	17426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_011416	TCC	2	6	17562	17567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_011416	CCT	2	6	17659	17664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_011416	AGG	2	6	17733	17738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011416	ACA	2	6	17739	17744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011416	TGC	2	6	18203	18208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011416	GAA	2	6	18255	18260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011416	AGG	2	6	18309	18314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011416	TAC	2	6	18328	18333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_011416	CGG	2	6	18355	18360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011416	AAT	2	6	18960	18965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011416	TTA	2	6	20458	20463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011416	TGT	2	6	24502	24507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011416	TAA	2	6	24523	24528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011416	GCT	2	6	26116	26121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011416	CTG	2	6	26150	26155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011416	TGA	2	6	26640	26645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011416	GAA	2	6	26676	26681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011416	TCA	2	6	26890	26895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011416	ATT	2	6	26899	26904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011416	TAT	2	6	26946	26951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011416	TGC	2	6	27342	27347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011416	GAA	2	6	27447	27452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011416	GCT	2	6	27461	27466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011416	GTC	2	6	27569	27574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_011416	TTA	2	6	27641	27646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011416	TTA	2	6	27701	27706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011416	GTG	2	6	27779	27784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011416	TGG	3	9	27801	27809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011416	CCG	2	6	27881	27886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_011416	TGT	2	6	28213	28218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011416	AGT	2	6	28227	28232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011416	TAA	2	6	31479	31484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011416	ACA	2	6	31990	31995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_011416	TAT	2	6	32183	32188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011416	TGA	2	6	33062	33067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011416	TAT	2	6	33078	33083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011416	TAA	2	6	33169	33174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011416	AGG	2	6	34819	34824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011416	TGG	2	6	35639	35644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011416	TGG	2	6	35723	35728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011416	ATT	2	6	36023	36028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011416	TTG	2	6	39076	39081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011416	TTC	2	6	39203	39208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_011416	CCT	2	6	39481	39486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_011416	AGG	2	6	41030	41035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011416	ATA	2	6	42728	42733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011416	TTA	2	6	44243	44248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011416	ATT	2	6	44288	44293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011416	TGA	2	6	45011	45016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011416	TGC	2	6	45020	45025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_011416	ATT	2	6	45119	45124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011416	ATG	2	6	45150	45155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011416	TCT	2	6	45172	45177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_011416	TTA	2	6	45199	45204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011416	TTC	2	6	45227	45232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_011416	GGA	2	6	45240	45245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011416	TCA	2	6	45408	45413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_011416	CGG	2	6	45448	45453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011416	GCC	2	6	47204	47209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_011416	AGC	2	6	48702	48707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011416	TAT	2	6	49053	49058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011416	TCC	2	6	50098	50103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_011416	CAA	2	6	50135	50140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011416	GAA	2	6	50242	50247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011416	AAT	2	6	50308	50313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011416	ACA	2	6	52451	52456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_011416	TAC	2	6	52815	52820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_011416	TGG	3	9	52936	52944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011416	AGT	2	6	53016	53021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011416	CCA	2	6	53198	53203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_011416	GTA	2	6	53225	53230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011416	TTG	2	6	53245	53250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011416	TAG	2	6	53282	53287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011416	TCA	2	6	53297	53302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_011416	CCT	2	6	53357	53362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_011416	TAT	2	6	53430	53435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011416	TAT	2	6	53550	53555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011416	TAA	2	6	58219	58224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011416	TCA	2	6	59546	59551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_011416	ATA	2	6	60217	60222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011416	ACT	2	6	60364	60369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_011416	GCC	2	6	60397	60402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.