MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli SE11 plasmid pSE11-3

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011416	AC	3	6	53	58	50 %	0 %	0 %	50 %	209921876
2	NC_011416	CT	3	6	215	220	0 %	50 %	0 %	50 %	209921876
3	NC_011416	GC	3	6	1292	1297	0 %	0 %	50 %	50 %	209921877
4	NC_011416	TG	3	6	1504	1509	0 %	50 %	50 %	0 %	209921877
5	NC_011416	TG	3	6	2151	2156	0 %	50 %	50 %	0 %	209921878
6	NC_011416	TG	3	6	2432	2437	0 %	50 %	50 %	0 %	209921878
7	NC_011416	GA	3	6	3276	3281	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011416	AT	3	6	4230	4235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011416	CA	3	6	4693	4698	50 %	0 %	0 %	50 %	209921880
10	NC_011416	AG	3	6	5673	5678	50 %	0 %	50 %	0 %	209921881
11	NC_011416	AT	3	6	6891	6896	50 %	50 %	0 %	0 %	209921883
12	NC_011416	AT	4	8	7433	7440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011416	GA	3	6	7867	7872	50 %	0 %	50 %	0 %	209921884
14	NC_011416	AT	3	6	8096	8101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011416	CT	3	6	8378	8383	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_011416	TA	3	6	9419	9424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011416	TA	3	6	9467	9472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011416	CT	3	6	10029	10034	0 %	50 %	0 %	50 %	209921887
19	NC_011416	CA	3	6	10327	10332	50 %	0 %	0 %	50 %	209921887
20	NC_011416	CA	3	6	11061	11066	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_011416	TG	3	6	11268	11273	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011416	GC	3	6	11751	11756	0 %	0 %	50 %	50 %	209921888
23	NC_011416	TG	3	6	12384	12389	0 %	50 %	50 %	0 %	209921889
24	NC_011416	TC	3	6	12698	12703	0 %	50 %	0 %	50 %	209921890
25	NC_011416	GT	3	6	16321	16326	0 %	50 %	50 %	0 %	209921894
26	NC_011416	TC	4	8	16968	16975	0 %	50 %	0 %	50 %	209921895
27	NC_011416	AG	3	6	17406	17411	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011416	GT	3	6	17627	17632	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011416	AT	3	6	17704	17709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011416	AG	3	6	18396	18401	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011416	GT	3	6	18468	18473	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011416	TA	3	6	19088	19093	50 %	50 %	0 %	0 %	209921898
33	NC_011416	GC	3	6	20206	20211	0 %	0 %	50 %	50 %	209921898
34	NC_011416	AT	4	8	20735	20742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011416	GC	3	6	20846	20851	0 %	0 %	50 %	50 %	209921899
36	NC_011416	TG	3	6	20898	20903	0 %	50 %	50 %	0 %	209921899
37	NC_011416	CG	3	6	20997	21002	0 %	0 %	50 %	50 %	209921899
38	NC_011416	CG	3	6	21081	21086	0 %	0 %	50 %	50 %	209921899
39	NC_011416	CG	3	6	22635	22640	0 %	0 %	50 %	50 %	209921899
40	NC_011416	CA	3	6	22936	22941	50 %	0 %	0 %	50 %	209921899
41	NC_011416	GT	3	6	23262	23267	0 %	50 %	50 %	0 %	209921900
42	NC_011416	CT	3	6	23649	23654	0 %	50 %	0 %	50 %	209921901
43	NC_011416	TC	3	6	23883	23888	0 %	50 %	0 %	50 %	209921901
44	NC_011416	CG	3	6	24364	24369	0 %	0 %	50 %	50 %	209921901
45	NC_011416	CA	3	6	24440	24445	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_011416	GA	3	6	27512	27517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011416	GT	3	6	29327	29332	0 %	50 %	50 %	0 %	209921906
48	NC_011416	AC	3	6	30536	30541	50 %	0 %	0 %	50 %	209921906
49	NC_011416	AG	3	6	31816	31821	50 %	0 %	50 %	0 %	209921908
50	NC_011416	AG	3	6	33212	33217	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011416	GT	3	6	34710	34715	0 %	50 %	50 %	0 %	209921911
52	NC_011416	CG	3	6	35426	35431	0 %	0 %	50 %	50 %	209921912
53	NC_011416	TG	3	6	35657	35662	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011416	GC	3	6	35881	35886	0 %	0 %	50 %	50 %	209921913
55	NC_011416	CT	4	8	37300	37307	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_011416	GT	3	6	37693	37698	0 %	50 %	50 %	0 %	209921916
57	NC_011416	AC	3	6	38056	38061	50 %	0 %	0 %	50 %	209921917
58	NC_011416	AT	3	6	38105	38110	50 %	50 %	0 %	0 %	209921917
59	NC_011416	TA	3	6	38347	38352	50 %	50 %	0 %	0 %	209921917
60	NC_011416	AC	3	6	38519	38524	50 %	0 %	0 %	50 %	209921917
61	NC_011416	CT	3	6	39229	39234	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_011416	AT	3	6	39305	39310	50 %	50 %	0 %	0 %	209921918
63	NC_011416	GC	3	6	39500	39505	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_011416	AG	3	6	40047	40052	50 %	0 %	50 %	0 %	209921919
65	NC_011416	CA	3	6	40394	40399	50 %	0 %	0 %	50 %	209921919
66	NC_011416	GA	3	6	40795	40800	50 %	0 %	50 %	0 %	209921919
67	NC_011416	TA	3	6	41023	41028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011416	GA	3	6	41403	41408	50 %	0 %	50 %	0 %	209921920
69	NC_011416	GA	3	6	41640	41645	50 %	0 %	50 %	0 %	209921920
70	NC_011416	AT	3	6	42104	42109	50 %	50 %	0 %	0 %	209921920
71	NC_011416	CT	3	6	42619	42624	0 %	50 %	0 %	50 %	209921920
72	NC_011416	GT	4	8	42694	42701	0 %	50 %	50 %	0 %	209921920
73	NC_011416	AG	3	6	44715	44720	50 %	0 %	50 %	0 %	209921923
74	NC_011416	TG	3	6	45027	45032	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011416	TG	3	6	45246	45251	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011416	GT	4	8	45606	45613	0 %	50 %	50 %	0 %	209921924
77	NC_011416	GT	3	6	48057	48062	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011416	TG	3	6	48085	48090	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011416	CT	4	8	48633	48640	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_011416	AT	3	6	49157	49162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011416	CT	3	6	49169	49174	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_011416	AT	3	6	49314	49319	50 %	50 %	0 %	0 %	209921932
83	NC_011416	AT	3	6	49461	49466	50 %	50 %	0 %	0 %	209921932
84	NC_011416	TC	3	6	49772	49777	0 %	50 %	0 %	50 %	209921932
85	NC_011416	TA	3	6	50158	50163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011416	CA	3	6	50292	50297	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_011416	GT	3	6	50300	50305	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011416	AT	3	6	50530	50535	50 %	50 %	0 %	0 %	209921933
89	NC_011416	TA	3	6	50946	50951	50 %	50 %	0 %	0 %	209921933
90	NC_011416	CA	3	6	51100	51105	50 %	0 %	0 %	50 %	209921933
91	NC_011416	GA	3	6	51787	51792	50 %	0 %	50 %	0 %	209921934
92	NC_011416	TC	3	6	51847	51852	0 %	50 %	0 %	50 %	209921934
93	NC_011416	TA	3	6	51982	51987	50 %	50 %	0 %	0 %	209921934
94	NC_011416	AC	3	6	52167	52172	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_011416	GT	3	6	53816	53821	0 %	50 %	50 %	0 %	209921935
96	NC_011416	AC	3	6	54592	54597	50 %	0 %	0 %	50 %	209921935
97	NC_011416	AT	4	8	55997	56004	50 %	50 %	0 %	0 %	209921935
98	NC_011416	AT	3	6	56010	56015	50 %	50 %	0 %	0 %	209921935
99	NC_011416	CT	3	6	57277	57282	0 %	50 %	0 %	50 %	209921937
100	NC_011416	TC	3	6	58039	58044	0 %	50 %	0 %	50 %	209921938
101	NC_011416	TA	3	6	59584	59589	50 %	50 %	0 %	0 %	209921941

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.