MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli SE11 plasmid pSE11-3

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011416	AC	3	6	53	58	50 %	0 %	0 %	50 %	209921876
2	NC_011416	CT	3	6	215	220	0 %	50 %	0 %	50 %	209921876
3	NC_011416	GC	3	6	1292	1297	0 %	0 %	50 %	50 %	209921877
4	NC_011416	TG	3	6	1504	1509	0 %	50 %	50 %	0 %	209921877
5	NC_011416	TG	3	6	2151	2156	0 %	50 %	50 %	0 %	209921878
6	NC_011416	TG	3	6	2432	2437	0 %	50 %	50 %	0 %	209921878
7	NC_011416	CA	3	6	4693	4698	50 %	0 %	0 %	50 %	209921880
8	NC_011416	AG	3	6	5673	5678	50 %	0 %	50 %	0 %	209921881
9	NC_011416	AT	3	6	6891	6896	50 %	50 %	0 %	0 %	209921883
10	NC_011416	GA	3	6	7867	7872	50 %	0 %	50 %	0 %	209921884
11	NC_011416	CT	3	6	10029	10034	0 %	50 %	0 %	50 %	209921887
12	NC_011416	CA	3	6	10327	10332	50 %	0 %	0 %	50 %	209921887
13	NC_011416	GC	3	6	11751	11756	0 %	0 %	50 %	50 %	209921888
14	NC_011416	TG	3	6	12384	12389	0 %	50 %	50 %	0 %	209921889
15	NC_011416	TC	3	6	12698	12703	0 %	50 %	0 %	50 %	209921890
16	NC_011416	GT	3	6	16321	16326	0 %	50 %	50 %	0 %	209921894
17	NC_011416	TC	4	8	16968	16975	0 %	50 %	0 %	50 %	209921895
18	NC_011416	TA	3	6	19088	19093	50 %	50 %	0 %	0 %	209921898
19	NC_011416	GC	3	6	20206	20211	0 %	0 %	50 %	50 %	209921898
20	NC_011416	GC	3	6	20846	20851	0 %	0 %	50 %	50 %	209921899
21	NC_011416	TG	3	6	20898	20903	0 %	50 %	50 %	0 %	209921899
22	NC_011416	CG	3	6	20997	21002	0 %	0 %	50 %	50 %	209921899
23	NC_011416	CG	3	6	21081	21086	0 %	0 %	50 %	50 %	209921899
24	NC_011416	CG	3	6	22635	22640	0 %	0 %	50 %	50 %	209921899
25	NC_011416	CA	3	6	22936	22941	50 %	0 %	0 %	50 %	209921899
26	NC_011416	GT	3	6	23262	23267	0 %	50 %	50 %	0 %	209921900
27	NC_011416	CT	3	6	23649	23654	0 %	50 %	0 %	50 %	209921901
28	NC_011416	TC	3	6	23883	23888	0 %	50 %	0 %	50 %	209921901
29	NC_011416	CG	3	6	24364	24369	0 %	0 %	50 %	50 %	209921901
30	NC_011416	GT	3	6	29327	29332	0 %	50 %	50 %	0 %	209921906
31	NC_011416	AC	3	6	30536	30541	50 %	0 %	0 %	50 %	209921906
32	NC_011416	AG	3	6	31816	31821	50 %	0 %	50 %	0 %	209921908
33	NC_011416	GT	3	6	34710	34715	0 %	50 %	50 %	0 %	209921911
34	NC_011416	CG	3	6	35426	35431	0 %	0 %	50 %	50 %	209921912
35	NC_011416	GC	3	6	35881	35886	0 %	0 %	50 %	50 %	209921913
36	NC_011416	GT	3	6	37693	37698	0 %	50 %	50 %	0 %	209921916
37	NC_011416	AC	3	6	38056	38061	50 %	0 %	0 %	50 %	209921917
38	NC_011416	AT	3	6	38105	38110	50 %	50 %	0 %	0 %	209921917
39	NC_011416	TA	3	6	38347	38352	50 %	50 %	0 %	0 %	209921917
40	NC_011416	AC	3	6	38519	38524	50 %	0 %	0 %	50 %	209921917
41	NC_011416	AT	3	6	39305	39310	50 %	50 %	0 %	0 %	209921918
42	NC_011416	AG	3	6	40047	40052	50 %	0 %	50 %	0 %	209921919
43	NC_011416	CA	3	6	40394	40399	50 %	0 %	0 %	50 %	209921919
44	NC_011416	GA	3	6	40795	40800	50 %	0 %	50 %	0 %	209921919
45	NC_011416	GA	3	6	41403	41408	50 %	0 %	50 %	0 %	209921920
46	NC_011416	GA	3	6	41640	41645	50 %	0 %	50 %	0 %	209921920
47	NC_011416	AT	3	6	42104	42109	50 %	50 %	0 %	0 %	209921920
48	NC_011416	CT	3	6	42619	42624	0 %	50 %	0 %	50 %	209921920
49	NC_011416	GT	4	8	42694	42701	0 %	50 %	50 %	0 %	209921920
50	NC_011416	AG	3	6	44715	44720	50 %	0 %	50 %	0 %	209921923
51	NC_011416	GT	4	8	45606	45613	0 %	50 %	50 %	0 %	209921924
52	NC_011416	AT	3	6	49314	49319	50 %	50 %	0 %	0 %	209921932
53	NC_011416	AT	3	6	49461	49466	50 %	50 %	0 %	0 %	209921932
54	NC_011416	TC	3	6	49772	49777	0 %	50 %	0 %	50 %	209921932
55	NC_011416	AT	3	6	50530	50535	50 %	50 %	0 %	0 %	209921933
56	NC_011416	TA	3	6	50946	50951	50 %	50 %	0 %	0 %	209921933
57	NC_011416	CA	3	6	51100	51105	50 %	0 %	0 %	50 %	209921933
58	NC_011416	GA	3	6	51787	51792	50 %	0 %	50 %	0 %	209921934
59	NC_011416	TC	3	6	51847	51852	0 %	50 %	0 %	50 %	209921934
60	NC_011416	TA	3	6	51982	51987	50 %	50 %	0 %	0 %	209921934
61	NC_011416	GT	3	6	53816	53821	0 %	50 %	50 %	0 %	209921935
62	NC_011416	AC	3	6	54592	54597	50 %	0 %	0 %	50 %	209921935
63	NC_011416	AT	4	8	55997	56004	50 %	50 %	0 %	0 %	209921935
64	NC_011416	AT	3	6	56010	56015	50 %	50 %	0 %	0 %	209921935
65	NC_011416	CT	3	6	57277	57282	0 %	50 %	0 %	50 %	209921937
66	NC_011416	TC	3	6	58039	58044	0 %	50 %	0 %	50 %	209921938
67	NC_011416	TA	3	6	59584	59589	50 %	50 %	0 %	0 %	209921941

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.