MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Escherichia coli SE11 plasmid pSE11-3

Total Repeats: 121

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011416	T	7	7	519	525	0 %	100 %	0 %	0 %	209921876
2	NC_011416	A	6	6	611	616	100 %	0 %	0 %	0 %	209921876
3	NC_011416	C	6	6	626	631	0 %	0 %	0 %	100 %	209921876
4	NC_011416	A	6	6	1711	1716	100 %	0 %	0 %	0 %	209921877
5	NC_011416	A	6	6	1869	1874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011416	A	7	7	2609	2615	100 %	0 %	0 %	0 %	209921878
7	NC_011416	G	8	8	2997	3004	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011416	T	6	6	5957	5962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011416	T	7	7	6307	6313	0 %	100 %	0 %	0 %	209921883
10	NC_011416	A	8	8	6331	6338	100 %	0 %	0 %	0 %	209921883
11	NC_011416	A	6	6	6937	6942	100 %	0 %	0 %	0 %	209921883
12	NC_011416	A	7	7	7005	7011	100 %	0 %	0 %	0 %	209921883
13	NC_011416	A	6	6	7020	7025	100 %	0 %	0 %	0 %	209921883
14	NC_011416	A	6	6	7260	7265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011416	A	6	6	7516	7521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011416	A	7	7	7953	7959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011416	A	6	6	7970	7975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011416	T	6	6	9776	9781	0 %	100 %	0 %	0 %	209921887
19	NC_011416	T	8	8	10536	10543	0 %	100 %	0 %	0 %	209921887
20	NC_011416	T	6	6	10676	10681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011416	T	6	6	11179	11184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011416	T	6	6	12025	12030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011416	A	7	7	12305	12311	100 %	0 %	0 %	0 %	209921889
24	NC_011416	A	6	6	12479	12484	100 %	0 %	0 %	0 %	209921889
25	NC_011416	T	8	8	14825	14832	0 %	100 %	0 %	0 %	209921893
26	NC_011416	T	7	7	14870	14876	0 %	100 %	0 %	0 %	209921893
27	NC_011416	T	20	20	15478	15497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011416	G	6	6	15676	15681	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011416	A	7	7	15957	15963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011416	G	6	6	16296	16301	0 %	0 %	100 %	0 %	209921894
31	NC_011416	G	7	7	16327	16333	0 %	0 %	100 %	0 %	209921894
32	NC_011416	A	7	7	16428	16434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011416	A	6	6	17448	17453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011416	A	6	6	17602	17607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011416	A	6	6	17886	17891	100 %	0 %	0 %	0 %	209921896
36	NC_011416	T	7	7	18603	18609	0 %	100 %	0 %	0 %	209921897
37	NC_011416	T	6	6	18909	18914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011416	A	6	6	18970	18975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011416	A	7	7	19026	19032	100 %	0 %	0 %	0 %	209921898
40	NC_011416	T	6	6	19461	19466	0 %	100 %	0 %	0 %	209921898
41	NC_011416	C	7	7	19966	19972	0 %	0 %	0 %	100 %	209921898
42	NC_011416	A	6	6	20355	20360	100 %	0 %	0 %	0 %	209921898
43	NC_011416	A	6	6	20661	20666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011416	T	6	6	20779	20784	0 %	100 %	0 %	0 %	209921899
45	NC_011416	T	6	6	20826	20831	0 %	100 %	0 %	0 %	209921899
46	NC_011416	G	8	8	21012	21019	0 %	0 %	100 %	0 %	209921899
47	NC_011416	A	6	6	21845	21850	100 %	0 %	0 %	0 %	209921899
48	NC_011416	T	6	6	24542	24547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011416	C	6	6	24617	24622	0 %	0 %	0 %	100 %	209921902
50	NC_011416	G	6	6	24704	24709	0 %	0 %	100 %	0 %	209921902
51	NC_011416	A	6	6	27004	27009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011416	T	6	6	27149	27154	0 %	100 %	0 %	0 %	209921905
53	NC_011416	T	6	6	27196	27201	0 %	100 %	0 %	0 %	209921905
54	NC_011416	T	8	8	27396	27403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011416	T	7	7	27665	27671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011416	A	6	6	27689	27694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011416	T	8	8	27714	27721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011416	A	6	6	28246	28251	100 %	0 %	0 %	0 %	209921906
59	NC_011416	G	9	9	28377	28385	0 %	0 %	100 %	0 %	209921906
60	NC_011416	G	6	6	29873	29878	0 %	0 %	100 %	0 %	209921906
61	NC_011416	G	6	6	30507	30512	0 %	0 %	100 %	0 %	209921906
62	NC_011416	T	6	6	32052	32057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011416	T	6	6	33280	33285	0 %	100 %	0 %	0 %	209921910
64	NC_011416	T	6	6	34881	34886	0 %	100 %	0 %	0 %	209921912
65	NC_011416	T	6	6	36967	36972	0 %	100 %	0 %	0 %	209921914
66	NC_011416	A	7	7	39121	39127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011416	T	8	8	39421	39428	0 %	100 %	0 %	0 %	209921918
68	NC_011416	A	7	7	39821	39827	100 %	0 %	0 %	0 %	209921919
69	NC_011416	A	6	6	39837	39842	100 %	0 %	0 %	0 %	209921919
70	NC_011416	A	6	6	40379	40384	100 %	0 %	0 %	0 %	209921919
71	NC_011416	T	6	6	40648	40653	0 %	100 %	0 %	0 %	209921919
72	NC_011416	T	6	6	40982	40987	0 %	100 %	0 %	0 %	209921919
73	NC_011416	A	6	6	41017	41022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011416	G	7	7	41144	41150	0 %	0 %	100 %	0 %	209921920
75	NC_011416	T	6	6	41959	41964	0 %	100 %	0 %	0 %	209921920
76	NC_011416	C	6	6	42184	42189	0 %	0 %	0 %	100 %	209921920
77	NC_011416	A	6	6	42762	42767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011416	T	6	6	43329	43334	0 %	100 %	0 %	0 %	209921921
79	NC_011416	C	6	6	43353	43358	0 %	0 %	0 %	100 %	209921921
80	NC_011416	T	7	7	43395	43401	0 %	100 %	0 %	0 %	209921921
81	NC_011416	A	7	7	43863	43869	100 %	0 %	0 %	0 %	209921921
82	NC_011416	A	6	6	44188	44193	100 %	0 %	0 %	0 %	209921922
83	NC_011416	T	10	10	44199	44208	0 %	100 %	0 %	0 %	209921922
84	NC_011416	A	6	6	44325	44330	100 %	0 %	0 %	0 %	209921923
85	NC_011416	A	6	6	44978	44983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011416	T	6	6	45512	45517	0 %	100 %	0 %	0 %	209921924
87	NC_011416	T	6	6	45843	45848	0 %	100 %	0 %	0 %	209921925
88	NC_011416	A	6	6	46372	46377	100 %	0 %	0 %	0 %	209921926
89	NC_011416	A	6	6	46942	46947	100 %	0 %	0 %	0 %	209921926
90	NC_011416	T	6	6	48155	48160	0 %	100 %	0 %	0 %	209921929
91	NC_011416	A	6	6	48173	48178	100 %	0 %	0 %	0 %	209921929
92	NC_011416	T	6	6	48300	48305	0 %	100 %	0 %	0 %	209921929
93	NC_011416	T	6	6	49226	49231	0 %	100 %	0 %	0 %	209921932
94	NC_011416	A	6	6	49264	49269	100 %	0 %	0 %	0 %	209921932
95	NC_011416	T	6	6	49288	49293	0 %	100 %	0 %	0 %	209921932
96	NC_011416	C	7	7	49337	49343	0 %	0 %	0 %	100 %	209921932
97	NC_011416	T	6	6	49538	49543	0 %	100 %	0 %	0 %	209921932
98	NC_011416	C	6	6	49629	49634	0 %	0 %	0 %	100 %	209921932
99	NC_011416	T	6	6	49810	49815	0 %	100 %	0 %	0 %	209921932
100	NC_011416	A	6	6	50222	50227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011416	A	6	6	50357	50362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011416	A	7	7	50667	50673	100 %	0 %	0 %	0 %	209921933
103	NC_011416	C	6	6	50735	50740	0 %	0 %	0 %	100 %	209921933
104	NC_011416	A	6	6	50960	50965	100 %	0 %	0 %	0 %	209921933
105	NC_011416	A	6	6	50982	50987	100 %	0 %	0 %	0 %	209921933
106	NC_011416	T	6	6	51044	51049	0 %	100 %	0 %	0 %	209921933
107	NC_011416	T	6	6	51461	51466	0 %	100 %	0 %	0 %	209921934
108	NC_011416	A	7	7	51488	51494	100 %	0 %	0 %	0 %	209921934
109	NC_011416	A	9	9	51801	51809	100 %	0 %	0 %	0 %	209921934
110	NC_011416	T	6	6	51893	51898	0 %	100 %	0 %	0 %	209921934
111	NC_011416	T	6	6	52075	52080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011416	G	9	9	52217	52225	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011416	T	7	7	53107	53113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011416	T	7	7	53961	53967	0 %	100 %	0 %	0 %	209921935
115	NC_011416	C	6	6	54182	54187	0 %	0 %	0 %	100 %	209921935
116	NC_011416	T	7	7	56666	56672	0 %	100 %	0 %	0 %	209921936
117	NC_011416	T	6	6	58393	58398	0 %	100 %	0 %	0 %	209921939
118	NC_011416	T	6	6	59158	59163	0 %	100 %	0 %	0 %	209921940
119	NC_011416	A	6	6	59293	59298	100 %	0 %	0 %	0 %	209921940
120	NC_011416	T	6	6	60457	60462	0 %	100 %	0 %	0 %	209921942
121	NC_011416	A	9	9	60495	60503	100 %	0 %	0 %	0 %	209921942

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.