MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli SE11 chromosome

Total Repeats: 133

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011415	GAAAAT	2	12	10612	10623	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011415	AAAGGA	2	12	18834	18845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011415	AAGGGA	2	12	86015	86026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011415	TCTCCC	2	12	165908	165919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_011415	TCACCC	2	12	165959	165970	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_011415	GTAGTG	2	12	200905	200916	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011415	GTGCAG	2	12	328305	328316	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_011415	TAAGGG	2	12	342653	342664	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011415	TGTGGA	2	12	343800	343811	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011415	CTATTT	2	12	355224	355235	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_011415	AATTTC	2	12	361953	361964	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_011415	TGTCTG	2	12	371866	371877	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_011415	TTTATT	2	12	389046	389057	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011415	TATTGA	2	12	428046	428057	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011415	AACAAT	2	12	449057	449068	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_011415	TATTGA	2	12	451903	451914	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011415	TTTTCA	2	12	516310	516321	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_011415	CAGGCG	2	12	535151	535162	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011415	GCTATT	2	12	615521	615532	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_011415	TATTGC	2	12	615548	615559	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_011415	TTATAT	2	12	620641	620652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011415	CGTTCT	2	12	622508	622519	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011415	AATATG	2	12	655511	655522	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011415	ATTTTT	2	12	793707	793718	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011415	TTTACC	2	12	804618	804629	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011415	CAGAAA	2	12	915766	915777	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_011415	TAACCG	2	12	1006759	1006770	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011415	AAATAA	2	12	1038562	1038573	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011415	AAAGAT	2	12	1071092	1071103	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011415	TGTCCA	2	12	1091891	1091902	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011415	TAAGGA	2	12	1114158	1114169	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011415	ATAATG	2	12	1115572	1115583	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011415	CAAAAA	2	12	1204087	1204098	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_011415	TTTTGT	2	12	1287232	1287243	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011415	ACGCTT	2	12	1307869	1307880	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011415	ACTCGA	2	12	1307889	1307900	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011415	CAGGCT	2	12	1308021	1308032	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011415	CTTATT	2	12	1359729	1359740	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_011415	CAAAAG	2	12	1365625	1365636	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_011415	CTATAA	2	12	1420330	1420341	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_011415	ATTTAA	2	12	1481933	1481944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011415	GTAAAA	2	12	1624210	1624221	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011415	AAAAAC	2	12	1652828	1652839	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_011415	ACCGTT	2	12	1667702	1667713	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011415	TTTCAT	2	12	1676520	1676531	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_011415	GGTTAT	2	12	1676533	1676544	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011415	CAAAAA	2	12	1736214	1736225	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_011415	TAAATA	2	12	1738014	1738025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011415	TTCATA	2	12	1773829	1773840	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_011415	ATACTT	2	12	1874627	1874638	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_011415	AAAATA	2	12	1888284	1888295	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011415	TGTTTT	2	12	1888917	1888928	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011415	AAGACT	2	12	1889177	1889188	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_011415	TATTAC	2	12	2041012	2041023	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_011415	TTTCTT	2	12	2061000	2061011	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_011415	ATAACC	2	12	2064944	2064955	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011415	ACTGTC	2	12	2108600	2108611	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011415	AAAACA	2	12	2149664	2149675	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_011415	TTAATG	2	12	2194627	2194638	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011415	AATTCA	2	12	2201752	2201763	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_011415	TCTTAT	2	12	2215568	2215579	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_011415	ATATTT	2	12	2251824	2251835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011415	ACCGGA	2	12	2281787	2281798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011415	TGGCTG	2	12	2302223	2302234	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_011415	ATTTTT	2	12	2324455	2324466	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011415	TTTTGT	2	12	2378631	2378642	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011415	TCCCCC	2	12	2408218	2408229	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
68	NC_011415	CCTTAC	2	12	2458562	2458573	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_011415	CCTTAC	2	12	2459170	2459181	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_011415	CCTGTT	2	12	2470660	2470671	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011415	ACGCAG	2	12	2489049	2489060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_011415	TCTTCC	2	12	2518712	2518723	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_011415	CCACTA	2	12	2595181	2595192	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_011415	TAAATG	2	12	2643974	2643985	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011415	TGTCAC	2	12	2657608	2657619	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011415	GTTTTT	2	12	2696743	2696754	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011415	AGAAAA	2	12	2704557	2704568	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011415	GTTAAC	2	12	2744285	2744296	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_011415	GTTAAC	2	12	2744349	2744360	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_011415	CTGATG	2	12	2763110	2763121	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_011415	GTTATG	2	12	2780951	2780962	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011415	CAAGTG	2	12	2798063	2798074	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_011415	TCCTTC	2	12	2898677	2898688	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_011415	TGGACA	2	12	2948341	2948352	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_011415	CAGTTT	2	12	2962946	2962957	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_011415	ATCTTA	2	12	3091274	3091285	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_011415	GGTTTT	2	12	3156962	3156973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011415	TTTGTT	2	12	3186067	3186078	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011415	ATCGCG	2	12	3286700	3286711	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_011415	GTAAGG	2	12	3302393	3302404	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011415	GTAAGG	2	12	3302785	3302796	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011415	TTTTCG	2	12	3387242	3387253	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_011415	ATTTAA	2	12	3400443	3400454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011415	TTATAT	2	12	3449496	3449507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011415	CACCCC	2	12	3465990	3466001	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
96	NC_011415	AGTTGT	2	12	3473778	3473789	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011415	CTTTTT	2	12	3478454	3478465	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_011415	AATGAT	2	12	3479289	3479300	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011415	GTAACC	2	12	3534085	3534096	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_011415	AGACAA	2	12	3535705	3535716	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_011415	TGCATT	2	12	3544737	3544748	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_011415	TTTTAT	2	12	3546634	3546645	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011415	ATATAA	2	12	3557402	3557413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011415	AGCGTT	2	12	3681420	3681431	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_011415	AATTTA	2	12	3794914	3794925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011415	AGATGC	2	12	3899683	3899694	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_011415	TGAAAA	2	12	3914552	3914563	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011415	AGGGAG	2	12	3921295	3921306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011415	TTTATC	2	12	4021700	4021711	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_011415	CTTTTT	2	12	4195488	4195499	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_011415	AGGGAG	2	12	4213576	4213587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011415	GCGTAA	2	12	4320585	4320596	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_011415	GGGAGT	2	12	4347605	4347616	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011415	GGGTGA	2	12	4356148	4356159	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011415	ATAAAA	2	12	4363045	4363056	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011415	TTTTCT	2	12	4399271	4399282	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_011415	ATTTTT	2	12	4425129	4425140	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011415	TCATTT	2	12	4492445	4492456	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_011415	CTTTTA	2	12	4507524	4507535	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_011415	GTCTTT	2	12	4549813	4549824	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_011415	GGGAGA	2	12	4585518	4585529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011415	CTGATA	2	12	4611479	4611490	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_011415	TTCAAT	2	12	4646606	4646617	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_011415	TTTTTA	2	12	4664400	4664411	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011415	TTTAAT	2	12	4696940	4696951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011415	TTTCAC	2	12	4752323	4752334	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_011415	AATAAA	2	12	4758905	4758916	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011415	AACAGG	2	12	4793249	4793260	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_011415	AAATAA	2	12	4812863	4812874	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011415	TTTTCA	2	12	4843199	4843210	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_011415	AATGAT	2	12	4852942	4852953	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011415	TTATCA	2	12	4853035	4853046	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_011415	AGTAAA	2	12	4876588	4876599	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.