MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli SE11 chromosome

Total Repeats: 3179

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011415	CGCTG	2	10	692	701	0 %	20 %	40 %	40 %	209917193
2	NC_011415	ATTGC	2	10	3395	3404	20 %	40 %	20 %	20 %	209917194
3	NC_011415	CGCAG	2	10	8359	8368	20 %	0 %	40 %	40 %	209917199
4	NC_011415	CGTAC	2	10	9787	9796	20 %	20 %	20 %	40 %	209917200
5	NC_011415	CGCGC	2	10	10774	10783	0 %	0 %	40 %	60 %	209917202
6	NC_011415	TCAGG	2	10	14665	14674	20 %	20 %	40 %	20 %	209917205
7	NC_011415	CCGAT	2	10	16491	16500	20 %	20 %	20 %	40 %	209917207
8	NC_011415	AGCGA	2	10	16879	16888	40 %	0 %	40 %	20 %	209917207
9	NC_011415	GTTTT	2	10	19295	19304	0 %	80 %	20 %	0 %	209917210
10	NC_011415	ATTGC	2	10	21673	21682	20 %	40 %	20 %	20 %	209917211
11	NC_011415	TTAAT	2	10	22308	22317	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011415	CAGTA	2	10	28583	28592	40 %	20 %	20 %	20 %	209917218
13	NC_011415	ATTTA	2	10	31140	31149	40 %	60 %	0 %	0 %	209917221
14	NC_011415	GCGAA	2	10	34378	34387	40 %	0 %	40 %	20 %	209917224
15	NC_011415	CCGTT	2	10	35272	35281	0 %	40 %	20 %	40 %	209917224
16	NC_011415	CACGG	2	10	35649	35658	20 %	0 %	40 %	40 %	209917224
17	NC_011415	CGAAT	2	10	38358	38367	40 %	20 %	20 %	20 %	209917229
18	NC_011415	CCATG	2	10	39896	39905	20 %	20 %	20 %	40 %	209917230
19	NC_011415	CCGTA	2	10	41542	41551	20 %	20 %	20 %	40 %	209917231
20	NC_011415	TTAAA	2	10	42280	42289	60 %	40 %	0 %	0 %	209917231
21	NC_011415	ACCCA	2	10	43023	43032	40 %	0 %	0 %	60 %	209917232
22	NC_011415	TTTGA	2	10	44650	44659	20 %	60 %	20 %	0 %	209917233
23	NC_011415	CGGCG	2	10	44901	44910	0 %	0 %	60 %	40 %	209917233
24	NC_011415	AATCA	2	10	45183	45192	60 %	20 %	0 %	20 %	209917234
25	NC_011415	CGGTT	2	10	46138	46147	0 %	40 %	40 %	20 %	209917235
26	NC_011415	TGGCG	2	10	47829	47838	0 %	20 %	60 %	20 %	209917237
27	NC_011415	TGCAC	2	10	49591	49600	20 %	20 %	20 %	40 %	209917238
28	NC_011415	AGGGC	2	10	50676	50685	20 %	0 %	60 %	20 %	209917239
29	NC_011415	GGCGC	2	10	50710	50719	0 %	0 %	60 %	40 %	209917239
30	NC_011415	GAAAC	2	10	51523	51532	60 %	0 %	20 %	20 %	209917239
31	NC_011415	AACGT	2	10	53435	53444	40 %	20 %	20 %	20 %	209917242
32	NC_011415	GCGTC	2	10	56419	56428	0 %	20 %	40 %	40 %	209917245
33	NC_011415	ATGTT	2	10	57233	57242	20 %	60 %	20 %	0 %	209917246
34	NC_011415	CTTCG	2	10	57666	57675	0 %	40 %	20 %	40 %	209917246
35	NC_011415	TGCGT	2	10	57952	57961	0 %	40 %	40 %	20 %	209917246
36	NC_011415	ACGCC	2	10	60246	60255	20 %	0 %	20 %	60 %	209917248
37	NC_011415	CCTTT	2	10	60315	60324	0 %	60 %	0 %	40 %	209917248
38	NC_011415	AAAGT	2	10	64965	64974	60 %	20 %	20 %	0 %	209917250
39	NC_011415	AGTCG	2	10	65934	65943	20 %	20 %	40 %	20 %	209917251
40	NC_011415	GGTGA	2	10	67213	67222	20 %	20 %	60 %	0 %	209917251
41	NC_011415	TCGCG	2	10	69820	69829	0 %	20 %	40 %	40 %	209917253
42	NC_011415	TAGTG	2	10	77298	77307	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011415	TTGCT	2	10	77450	77459	0 %	60 %	20 %	20 %	209917260
44	NC_011415	GATGG	2	10	78186	78195	20 %	20 %	60 %	0 %	209917260
45	NC_011415	ATTTT	2	10	79014	79023	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011415	CTGGA	2	10	80086	80095	20 %	20 %	40 %	20 %	209917261
47	NC_011415	CCTGG	2	10	81660	81669	0 %	20 %	40 %	40 %	209917263
48	NC_011415	CTGGT	2	10	83379	83388	0 %	40 %	40 %	20 %	209917264
49	NC_011415	GACCG	2	10	83927	83936	20 %	0 %	40 %	40 %	209917265
50	NC_011415	ATGTT	2	10	86476	86485	20 %	60 %	20 %	0 %	209917268
51	NC_011415	TGCAT	2	10	87418	87427	20 %	40 %	20 %	20 %	209917270
52	NC_011415	ATTCC	2	10	87588	87597	20 %	40 %	0 %	40 %	209917270
53	NC_011415	AGTTC	2	10	92681	92690	20 %	40 %	20 %	20 %	209917275
54	NC_011415	CGTGG	2	10	94054	94063	0 %	20 %	60 %	20 %	209917277
55	NC_011415	TATCG	2	10	94561	94570	20 %	40 %	20 %	20 %	209917277
56	NC_011415	GCCTG	2	10	98893	98902	0 %	20 %	40 %	40 %	209917281
57	NC_011415	GTTTG	2	10	99337	99346	0 %	60 %	40 %	0 %	209917281
58	NC_011415	ACCGT	2	10	100806	100815	20 %	20 %	20 %	40 %	209917282
59	NC_011415	ATCAG	2	10	102579	102588	40 %	20 %	20 %	20 %	209917284
60	NC_011415	AGCCG	2	10	104347	104356	20 %	0 %	40 %	40 %	209917285
61	NC_011415	GCGCA	2	10	106675	106684	20 %	0 %	40 %	40 %	209917287
62	NC_011415	TGGCG	2	10	107669	107678	0 %	20 %	60 %	20 %	209917288
63	NC_011415	CCGGC	2	10	110639	110648	0 %	0 %	40 %	60 %	209917291
64	NC_011415	CGCGG	2	10	113848	113857	0 %	0 %	60 %	40 %	209917294
65	NC_011415	ATCCC	2	10	116092	116101	20 %	20 %	0 %	60 %	209917297
66	NC_011415	CATCG	2	10	116105	116114	20 %	20 %	20 %	40 %	209917297
67	NC_011415	TAACG	2	10	116799	116808	40 %	20 %	20 %	20 %	209917297
68	NC_011415	ATGCC	2	10	117258	117267	20 %	20 %	20 %	40 %	209917297
69	NC_011415	AATGC	2	10	118541	118550	40 %	20 %	20 %	20 %	209917298
70	NC_011415	TCTGT	2	10	119487	119496	0 %	60 %	20 %	20 %	209917300
71	NC_011415	GCATG	2	10	120580	120589	20 %	20 %	40 %	20 %	209917301
72	NC_011415	AGCAG	2	10	121918	121927	40 %	0 %	40 %	20 %	209917303
73	NC_011415	TCAGC	2	10	122786	122795	20 %	20 %	20 %	40 %	209917303
74	NC_011415	CGAAG	2	10	123833	123842	40 %	0 %	40 %	20 %	209917304
75	NC_011415	ACACG	2	10	123966	123975	40 %	0 %	20 %	40 %	209917304
76	NC_011415	TCGCG	2	10	124227	124236	0 %	20 %	40 %	40 %	209917304
77	NC_011415	GCATC	2	10	124317	124326	20 %	20 %	20 %	40 %	209917304
78	NC_011415	GACTG	2	10	125635	125644	20 %	20 %	40 %	20 %	209917305
79	NC_011415	AGAGC	2	10	126045	126054	40 %	0 %	40 %	20 %	209917305
80	NC_011415	AGGCG	2	10	131317	131326	20 %	0 %	60 %	20 %	209917308
81	NC_011415	GGTTG	2	10	131974	131983	0 %	40 %	60 %	0 %	209917308
82	NC_011415	TCTGG	2	10	134620	134629	0 %	40 %	40 %	20 %	209917309
83	NC_011415	GGGCA	2	10	136031	136040	20 %	0 %	60 %	20 %	209917310
84	NC_011415	CAGCG	2	10	136310	136319	20 %	0 %	40 %	40 %	209917311
85	NC_011415	ACGAC	2	10	137590	137599	40 %	0 %	20 %	40 %	209917312
86	NC_011415	CCGTC	2	10	143140	143149	0 %	20 %	20 %	60 %	209917316
87	NC_011415	GTGAA	2	10	143150	143159	40 %	20 %	40 %	0 %	209917316
88	NC_011415	GGCAT	2	10	143312	143321	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_011415	GTTCA	2	10	143537	143546	20 %	40 %	20 %	20 %	209917317
90	NC_011415	ATCCA	2	10	143863	143872	40 %	20 %	0 %	40 %	209917317
91	NC_011415	GTAAG	2	10	144076	144085	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011415	CTTTA	2	10	145126	145135	20 %	60 %	0 %	20 %	209917319
93	NC_011415	TGGCG	2	10	145353	145362	0 %	20 %	60 %	20 %	209917319
94	NC_011415	TCCTC	2	10	145796	145805	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
95	NC_011415	CGGGC	2	10	146541	146550	0 %	0 %	60 %	40 %	209917321
96	NC_011415	TTTCA	2	10	147666	147675	20 %	60 %	0 %	20 %	209917322
97	NC_011415	GGGAG	2	10	148991	149000	20 %	0 %	80 %	0 %	209917323
98	NC_011415	TGAAG	2	10	150889	150898	40 %	20 %	40 %	0 %	209917325
99	NC_011415	ACCGC	2	10	150994	151003	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
100	NC_011415	GCGGT	2	10	151013	151022	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
101	NC_011415	TTTGC	2	10	157979	157988	0 %	60 %	20 %	20 %	209917332
102	NC_011415	AAATT	2	10	158420	158429	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011415	GCGAG	2	10	159787	159796	20 %	0 %	60 %	20 %	209917334
104	NC_011415	GGCGT	2	10	160225	160234	0 %	20 %	60 %	20 %	209917334
105	NC_011415	ATCAG	2	10	160863	160872	40 %	20 %	20 %	20 %	209917335
106	NC_011415	ACCAC	2	10	163128	163137	40 %	0 %	0 %	60 %	209917338
107	NC_011415	GGCGT	2	10	164831	164840	0 %	20 %	60 %	20 %	209917339
108	NC_011415	CGACG	2	10	165870	165879	20 %	0 %	40 %	40 %	209917339
109	NC_011415	TTATC	2	10	168782	168791	20 %	60 %	0 %	20 %	209917341
110	NC_011415	AAAAC	2	10	169857	169866	80 %	0 %	0 %	20 %	209917342
111	NC_011415	TGGTT	2	10	170114	170123	0 %	60 %	40 %	0 %	209917342
112	NC_011415	AACCT	2	10	172195	172204	40 %	20 %	0 %	40 %	209917344
113	NC_011415	TGGTC	2	10	172237	172246	0 %	40 %	40 %	20 %	209917344
114	NC_011415	TGGCG	2	10	173482	173491	0 %	20 %	60 %	20 %	209917345
115	NC_011415	TTCCA	2	10	174723	174732	20 %	40 %	0 %	40 %	209917345
116	NC_011415	GGTCC	2	10	179046	179055	0 %	20 %	40 %	40 %	209917350
117	NC_011415	ACGGG	2	10	180963	180972	20 %	0 %	60 %	20 %	209917352
118	NC_011415	GTGAT	2	10	183122	183131	20 %	40 %	40 %	0 %	209917353
119	NC_011415	GTGAT	2	10	183413	183422	20 %	40 %	40 %	0 %	209917353
120	NC_011415	TACGT	2	10	183658	183667	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_011415	TGGCC	2	10	185383	185392	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
122	NC_011415	GCCAG	2	10	187129	187138	20 %	0 %	40 %	40 %	209917357
123	NC_011415	GTTCT	2	10	188570	188579	0 %	60 %	20 %	20 %	209917357
124	NC_011415	CTGAA	2	10	190562	190571	40 %	20 %	20 %	20 %	209917359
125	NC_011415	AAGCG	2	10	190626	190635	40 %	0 %	40 %	20 %	209917359
126	NC_011415	TGGTG	2	10	192532	192541	0 %	40 %	60 %	0 %	209917361
127	NC_011415	TGCAC	2	10	192658	192667	20 %	20 %	20 %	40 %	209917361
128	NC_011415	TGCGC	2	10	193051	193060	0 %	20 %	40 %	40 %	209917361
129	NC_011415	AAATA	2	10	193273	193282	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011415	GTCTG	2	10	193358	193367	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
131	NC_011415	CATGG	2	10	194894	194903	20 %	20 %	40 %	20 %	209917363
132	NC_011415	CAGAT	2	10	195933	195942	40 %	20 %	20 %	20 %	209917364
133	NC_011415	ACTTT	2	10	196066	196075	20 %	60 %	0 %	20 %	209917364
134	NC_011415	GACGT	2	10	199986	199995	20 %	20 %	40 %	20 %	209917367
135	NC_011415	CGACG	2	10	201813	201822	20 %	0 %	40 %	40 %	209917369
136	NC_011415	ATGCC	2	10	204381	204390	20 %	20 %	20 %	40 %	209917372
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139	NC_011415	ACCGC	2	10	205720	205729	20 %	0 %	20 %	60 %	209917374
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142	NC_011415	GGTGG	2	10	207187	207196	0 %	20 %	80 %	0 %	209917374
143	NC_011415	TTAAC	2	10	215330	215339	40 %	40 %	0 %	20 %	209917381
144	NC_011415	TGCGC	2	10	216542	216551	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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148	NC_011415	TGATT	2	10	222318	222327	20 %	60 %	20 %	0 %	209917390
149	NC_011415	CGGTT	2	10	225281	225290	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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153	NC_011415	ACTGG	2	10	237268	237277	20 %	20 %	40 %	20 %	209917400
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156	NC_011415	TGATC	2	10	242048	242057	20 %	40 %	20 %	20 %	209917405
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173	NC_011415	ACGCG	2	10	267078	267087	20 %	0 %	40 %	40 %	209917425
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177	NC_011415	GGGCA	2	10	270161	270170	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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199	NC_011415	GGGAT	2	10	303098	303107	20 %	20 %	60 %	0 %	209917460
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239	NC_011415	AATGC	2	10	358156	358165	40 %	20 %	20 %	20 %	209917516
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241	NC_011415	ATAAA	2	10	359396	359405	80 %	20 %	0 %	0 %	209917517
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261	NC_011415	CGCTT	2	10	390025	390034	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
262	NC_011415	CACGG	2	10	391623	391632	20 %	0 %	40 %	40 %	209917545
263	NC_011415	CAGTT	2	10	391752	391761	20 %	40 %	20 %	20 %	209917546
264	NC_011415	GTGGC	2	10	393720	393729	0 %	20 %	60 %	20 %	209917547
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