MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli SE11 chromosome

Total Repeats: 1504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011415	CAGA	2	8	156	163	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011415	GGCG	2	8	8086	8093	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011415	CTGT	2	8	9239	9246	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_011415	GAAT	2	8	10515	10522	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011415	GGAT	2	8	11815	11822	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011415	ATTC	2	8	11911	11918	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_011415	AGTG	2	8	12053	12060	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011415	GACA	2	8	15683	15690	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011415	AACA	2	8	15873	15880	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_011415	AATT	2	8	15897	15904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011415	TAAT	2	8	15916	15923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011415	GTTG	2	8	19070	19077	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011415	TCAT	2	8	30143	30150	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_011415	TCCC	2	8	30173	30180	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
15	NC_011415	TGGC	2	8	30214	30221	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011415	GGGC	2	8	39767	39774	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011415	ATTT	2	8	43867	43874	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011415	GTTT	2	8	43884	43891	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011415	TGTT	2	8	51578	51585	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011415	AACC	2	8	61197	61204	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_011415	GCAG	2	8	61334	61341	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_011415	TCCA	2	8	71741	71748	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_011415	ATTA	2	8	85761	85768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011415	ATTA	2	8	87095	87102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011415	AGGC	2	8	87305	87312	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_011415	CCCG	2	8	90838	90845	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
27	NC_011415	TTAA	2	8	90846	90853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011415	TTGG	2	8	119135	119142	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011415	CCGC	2	8	119286	119293	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
30	NC_011415	GAAT	2	8	123360	123367	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011415	TCAA	2	8	123551	123558	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_011415	GATA	2	8	124566	124573	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011415	CGGC	2	8	129174	129181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_011415	TAAG	2	8	129385	129392	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011415	AATT	2	8	142580	142587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011415	GAAT	2	8	142645	142652	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011415	TTAA	2	8	157577	157584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011415	ATTC	2	8	157633	157640	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_011415	AAAT	2	8	158452	158459	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011415	GAAA	2	8	158563	158570	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011415	ATAA	2	8	158608	158615	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011415	TTAC	2	8	162134	162141	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_011415	GGTT	2	8	165899	165906	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011415	GGAT	2	8	185494	185501	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011415	GAGC	2	8	191218	191225	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_011415	GAAA	2	8	192371	192378	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011415	ATAA	2	8	193118	193125	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011415	AGTT	2	8	198425	198432	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011415	AAGG	2	8	210178	210185	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011415	AAAC	2	8	216520	216527	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_011415	CTGC	2	8	216604	216611	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_011415	GGTT	2	8	216741	216748	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011415	GGCT	2	8	217927	217934	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_011415	ATCA	2	8	224504	224511	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_011415	GCTT	2	8	225608	225615	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_011415	CCGG	2	8	226662	226669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_011415	GTAG	2	8	226961	226968	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011415	TAAA	2	8	227345	227352	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011415	GAAA	2	8	227491	227498	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011415	CTGA	2	8	227950	227957	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_011415	GTAC	2	8	228034	228041	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_011415	CGTC	2	8	228475	228482	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_011415	AAAG	2	8	228598	228605	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011415	GCTG	2	8	229276	229283	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_011415	CCTG	2	8	230710	230717	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_011415	CCGT	2	8	230745	230752	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_011415	ATTT	2	8	232673	232680	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011415	CCTG	2	8	238934	238941	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_011415	CCGT	2	8	238969	238976	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_011415	TGTT	2	8	239227	239234	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011415	TGTT	2	8	240215	240222	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011415	GTAA	2	8	240498	240505	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011415	GAAA	2	8	240681	240688	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011415	ATCG	2	8	261917	261924	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_011415	GATT	2	8	262099	262106	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011415	TGTA	2	8	262333	262340	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011415	AAAG	2	8	263028	263035	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011415	CTGT	2	8	263148	263155	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_011415	ATAC	2	8	270129	270136	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_011415	AGAA	2	8	271343	271350	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011415	ATAA	2	8	271491	271498	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011415	AATC	2	8	277544	277551	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_011415	TATT	2	8	279791	279798	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011415	AGTA	2	8	289857	289864	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011415	CGTT	2	8	292922	292929	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_011415	TACT	2	8	297204	297211	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_011415	TGAA	2	8	301567	301574	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011415	GCCT	2	8	301777	301784	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_011415	ATCA	2	8	304118	304125	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_011415	GCGA	2	8	305425	305432	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_011415	TTTA	2	8	310342	310349	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011415	TAAC	2	8	310374	310381	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_011415	GGCG	2	8	310527	310534	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
94	NC_011415	GTCA	2	8	314235	314242	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_011415	TTCC	2	8	314683	314690	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_011415	TTTA	2	8	314790	314797	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011415	ATTG	2	8	314979	314986	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011415	CATA	2	8	315107	315114	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_011415	CAGG	2	8	316999	317006	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_011415	AGCT	2	8	318399	318406	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_011415	TTAG	2	8	321351	321358	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011415	TTCC	2	8	321432	321439	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_011415	AGAT	2	8	321642	321649	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011415	ACAA	2	8	325330	325337	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_011415	AATT	2	8	334776	334783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011415	AACT	2	8	341668	341675	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_011415	TTAC	2	8	344013	344020	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_011415	AAAT	2	8	344094	344101	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011415	ATAC	2	8	344515	344522	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_011415	CCAG	2	8	344672	344679	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_011415	AGGC	2	8	344978	344985	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_011415	ATAA	2	8	345090	345097	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011415	TAAA	2	8	355291	355298	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011415	TAAA	2	8	355322	355329	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011415	GAAA	2	8	355509	355516	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011415	GCAG	2	8	359566	359573	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_011415	GTGG	2	8	362857	362864	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011415	TTTG	2	8	363783	363790	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011415	TTTA	2	8	363924	363931	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011415	TATT	2	8	364714	364721	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011415	AAAT	2	8	364779	364786	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011415	GTAA	2	8	365019	365026	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011415	ATTA	2	8	365257	365264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011415	AAAT	2	8	365276	365283	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011415	ATTG	2	8	369449	369456	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011415	ATTG	2	8	371885	371892	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011415	TGGG	2	8	371962	371969	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011415	GAGC	2	8	372286	372293	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_011415	AGAT	2	8	374567	374574	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011415	AATG	2	8	382373	382380	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011415	CTCC	2	8	388959	388966	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
132	NC_011415	GTTA	2	8	388986	388993	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011415	ATAA	2	8	391208	391215	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011415	CTGA	2	8	391306	391313	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_011415	GTGG	2	8	391339	391346	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011415	CTGC	2	8	399314	399321	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_011415	GGTT	2	8	399451	399458	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011415	TCAT	2	8	400604	400611	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_011415	AGAC	2	8	404275	404282	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_011415	ATTG	2	8	406710	406717	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011415	TGAG	2	8	411188	411195	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011415	GCGG	2	8	424440	424447	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
143	NC_011415	TATT	2	8	427686	427693	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011415	GTAT	2	8	427862	427869	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011415	AATT	2	8	427916	427923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011415	AATG	2	8	428226	428233	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011415	TGAA	2	8	438095	438102	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011415	CAAA	2	8	443058	443065	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_011415	AAGT	2	8	449145	449152	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011415	TATT	2	8	458804	458811	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011415	AGCC	2	8	460898	460905	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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