MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Escherichia coli SE11 chromosome

Total Repeats: 70018

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011415	AGC	2	6	65	70	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011415	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011415	CAC	2	6	204	209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209917192
4	NC_011415	ACC	3	9	214	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209917192
5	NC_011415	AAC	2	6	329	334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011415	CGG	2	6	353	358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209917193
7	NC_011415	TGG	2	6	475	480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209917193
8	NC_011415	GAT	2	6	482	487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209917193
9	NC_011415	CGC	3	9	569	577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209917193
10	NC_011415	TCG	2	6	613	618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209917193
11	NC_011415	TTG	2	6	663	668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209917193
12	NC_011415	CTG	2	6	795	800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209917193
13	NC_011415	CCG	2	6	848	853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209917193
14	NC_011415	CCG	2	6	907	912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209917193
15	NC_011415	TGG	2	6	931	936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209917193
16	NC_011415	ACT	2	6	958	963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209917193
17	NC_011415	CGG	2	6	967	972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209917193
18	NC_011415	TTG	2	6	998	1003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209917193
19	NC_011415	GTT	2	6	1067	1072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209917193
20	NC_011415	TTC	2	6	1126	1131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209917193
21	NC_011415	TGA	2	6	1232	1237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209917193
22	NC_011415	GGC	2	6	1328	1333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209917193
23	NC_011415	GTG	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209917193
24	NC_011415	ATC	2	6	1388	1393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209917193
25	NC_011415	AAG	2	6	1483	1488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209917193
26	NC_011415	GGT	2	6	1535	1540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209917193
27	NC_011415	TCT	2	6	1635	1640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209917193
28	NC_011415	GAT	2	6	1671	1676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209917193
29	NC_011415	TCA	2	6	1700	1705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209917193
30	NC_011415	GCT	2	6	1772	1777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209917193
31	NC_011415	CAA	2	6	1794	1799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209917193
32	NC_011415	GAA	2	6	1902	1907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209917193
33	NC_011415	ATC	2	6	1966	1971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209917193
34	NC_011415	TTG	2	6	1987	1992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209917193
35	NC_011415	CTT	2	6	2033	2038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209917193
36	NC_011415	TCG	2	6	2085	2090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209917193
37	NC_011415	TAC	2	6	2097	2102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209917193
38	NC_011415	GCG	2	6	2118	2123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209917193
39	NC_011415	TGA	2	6	2213	2218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209917193
40	NC_011415	TGA	2	6	2221	2226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209917193
41	NC_011415	ACT	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209917193
42	NC_011415	GAT	2	6	2349	2354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209917193
43	NC_011415	TGC	2	6	2446	2451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209917193
44	NC_011415	CGA	2	6	2510	2515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209917193
45	NC_011415	TGA	2	6	2546	2551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209917193
46	NC_011415	TGA	2	6	2582	2587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209917193
47	NC_011415	TAT	2	6	2685	2690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209917193
48	NC_011415	TGC	2	6	2707	2712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209917193
49	NC_011415	GCG	2	6	2863	2868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209917194
50	NC_011415	GGC	2	6	2916	2921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209917194
51	NC_011415	CAA	2	6	2937	2942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209917194
52	NC_011415	GGT	2	6	3105	3110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209917194
53	NC_011415	GCA	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209917194
54	NC_011415	TGG	2	6	3243	3248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209917194
55	NC_011415	TGA	2	6	3257	3262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209917194
56	NC_011415	GAA	2	6	3265	3270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209917194
57	NC_011415	CAT	2	6	3276	3281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209917194
58	NC_011415	TGA	2	6	3303	3308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209917194
59	NC_011415	CGC	2	6	3385	3390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209917194
60	NC_011415	TGA	2	6	3473	3478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209917194
61	NC_011415	CGG	2	6	3704	3709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209917194
62	NC_011415	TGA	2	6	3861	3866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209917195
63	NC_011415	TGA	2	6	3924	3929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209917195
64	NC_011415	CGG	2	6	4059	4064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209917195
65	NC_011415	GGC	2	6	4252	4257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209917195
66	NC_011415	TGA	3	9	4323	4331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209917195
67	NC_011415	CTA	2	6	4404	4409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209917195
68	NC_011415	CGG	2	6	4493	4498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209917195
69	NC_011415	CTG	2	6	4501	4506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209917195
70	NC_011415	TGC	2	6	4542	4547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209917195
71	NC_011415	ACG	2	6	4583	4588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209917195
72	NC_011415	AAC	2	6	4651	4656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209917195
73	NC_011415	GTT	2	6	4674	4679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209917195
74	NC_011415	CCG	2	6	4680	4685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209917195
75	NC_011415	GAT	2	6	4726	4731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209917195
76	NC_011415	CGC	2	6	4791	4796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209917195
77	NC_011415	CCG	2	6	4973	4978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209917195
78	NC_011415	TGC	2	6	4983	4988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209917195
79	NC_011415	TGA	3	9	5000	5008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209917195
80	NC_011415	ATC	2	6	5009	5014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209917195
81	NC_011415	GAA	2	6	5078	5083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011415	AAC	2	6	5162	5167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011415	CGT	2	6	5168	5173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011415	GCA	2	6	5290	5295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209917196
85	NC_011415	TGG	2	6	5398	5403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209917196
86	NC_011415	ACA	2	6	5406	5411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209917196
87	NC_011415	CCG	2	6	5449	5454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209917196
88	NC_011415	CCG	2	6	5458	5463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209917196
89	NC_011415	CCA	2	6	5466	5471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209917196
90	NC_011415	CTC	2	6	5480	5485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209917196
91	NC_011415	ATC	2	6	5489	5494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209917196
92	NC_011415	CGG	2	6	5496	5501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209917196
93	NC_011415	CGC	2	6	5656	5661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_011415	GCT	2	6	5687	5692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209917197
95	NC_011415	GGA	2	6	5724	5729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209917197
96	NC_011415	TCA	2	6	5734	5739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209917197
97	NC_011415	AAG	2	6	5740	5745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209917197
98	NC_011415	AAT	2	6	5799	5804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209917197
99	NC_011415	TCA	2	6	5813	5818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209917197
100	NC_011415	TTC	2	6	5866	5871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209917197
101	NC_011415	TTC	2	6	5911	5916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209917197
102	NC_011415	CAC	2	6	5958	5963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209917197
103	NC_011415	TGC	2	6	5976	5981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209917197
104	NC_011415	TTG	2	6	5998	6003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209917197
105	NC_011415	TGA	2	6	6005	6010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209917197
106	NC_011415	CTG	2	6	6360	6365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209917197
107	NC_011415	GTG	2	6	6400	6405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209917197
108	NC_011415	CAT	2	6	6542	6547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209917198
109	NC_011415	GCC	2	6	6759	6764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209917198
110	NC_011415	GTT	2	6	6813	6818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209917198
111	NC_011415	AGA	2	6	6830	6835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209917198
112	NC_011415	ATC	2	6	7057	7062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209917198
113	NC_011415	GCT	2	6	7111	7116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209917198
114	NC_011415	CGC	2	6	7203	7208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209917198
115	NC_011415	GCC	2	6	7209	7214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209917198
116	NC_011415	CAG	2	6	7386	7391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209917198
117	NC_011415	AAT	2	6	7407	7412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209917198
118	NC_011415	TCC	2	6	7575	7580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209917198
119	NC_011415	CGG	2	6	7700	7705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209917198
120	NC_011415	CAA	2	6	7879	7884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209917198
121	NC_011415	TAA	2	6	7934	7939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209917198
122	NC_011415	AAG	2	6	8018	8023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011415	CGG	2	6	8150	8155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011415	CGT	2	6	8170	8175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011415	ATC	2	6	8179	8184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_011415	ACC	2	6	8270	8275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209917199
127	NC_011415	CAG	2	6	8417	8422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209917199
128	NC_011415	CAG	2	6	8438	8443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209917199
129	NC_011415	TGC	2	6	8659	8664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209917199
130	NC_011415	AAG	2	6	8679	8684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209917199
131	NC_011415	CTG	2	6	8705	8710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209917199
132	NC_011415	TTG	2	6	8769	8774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209917199
133	NC_011415	AGA	2	6	8830	8835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209917199
134	NC_011415	TAC	2	6	8870	8875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209917199
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136	NC_011415	GCA	2	6	9085	9090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209917199
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154	NC_011415	ATC	3	9	10506	10514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_011415	AAT	2	6	10528	10533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_011415	ATA	2	6	10569	10574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_011415	ATG	2	6	12130	12135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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242	NC_011415	ATT	2	6	15832	15837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
243	NC_011415	GAC	2	6	15838	15843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
244	NC_011415	ATT	2	6	15851	15856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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255	NC_011415	CGG	2	6	16524	16529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209917207
256	NC_011415	TAT	2	6	16618	16623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209917207
257	NC_011415	CGA	2	6	16624	16629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209917207
258	NC_011415	CAT	2	6	16639	16644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209917207
259	NC_011415	ATC	2	6	16646	16651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209917207
260	NC_011415	CGC	2	6	16745	16750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209917207
261	NC_011415	CTT	2	6	16840	16845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209917207
262	NC_011415	ATC	2	6	17012	17017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209917207
263	NC_011415	CTG	2	6	17059	17064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209917207
264	NC_011415	CGG	2	6	17253	17258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209917207
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266	NC_011415	ATT	2	6	17517	17522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209917208
267	NC_011415	CGC	2	6	17709	17714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209917208
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270	NC_011415	GCA	2	6	17835	17840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209917208
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274	NC_011415	TGA	2	6	18050	18055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209917208
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279	NC_011415	ATT	2	6	18363	18368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209917209
280	NC_011415	AGT	2	6	18434	18439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209917209
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283	NC_011415	ATT	2	6	18669	18674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209917209
284	NC_011415	TAA	2	6	18766	18771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_011415	TAT	2	6	18793	18798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_011415	AAC	2	6	18828	18833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
287	NC_011415	TCT	2	6	18933	18938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_011415	TAA	2	6	19000	19005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_011415	GAC	2	6	19012	19017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_011415	CGG	2	6	19128	19133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_011415	GTT	2	6	19179	19184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
292	NC_011415	TAA	2	6	19249	19254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_011415	TCA	2	6	19349	19354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209917210
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298	NC_011415	ACC	2	6	19780	19785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209917210
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315	NC_011415	ATT	2	6	20500	20505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
316	NC_011415	TAC	2	6	20511	20516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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324	NC_011415	ATT	2	6	20777	20782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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352	NC_011415	TGA	2	6	22295	22300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
353	NC_011415	ACT	2	6	22333	22338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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358	NC_011415	AGC	2	6	22699	22704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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365	NC_011415	GCA	2	6	23212	23217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209917213
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372	NC_011415	TGA	2	6	23725	23730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209917214
373	NC_011415	TTA	2	6	23768	23773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209917214
374	NC_011415	CAG	2	6	23845	23850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209917214
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377	NC_011415	AGT	2	6	24172	24177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209917214
378	NC_011415	AGC	2	6	24201	24206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209917214
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381	NC_011415	TGA	3	9	24436	24444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209917215
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383	NC_011415	ATG	2	6	24498	24503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209917215
384	NC_011415	CCT	2	6	24506	24511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209917215
385	NC_011415	GCA	2	6	24522	24527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209917215
386	NC_011415	CCG	3	9	24690	24698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209917215
387	NC_011415	CAT	2	6	24829	24834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209917215
388	NC_011415	ATC	2	6	24851	24856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209917215
389	NC_011415	TGC	2	6	25245	25250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209917215
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392	NC_011415	GCT	2	6	25492	25497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209917215
393	NC_011415	TGC	2	6	25515	25520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209917215
394	NC_011415	GCA	2	6	25534	25539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209917215
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396	NC_011415	ATC	2	6	25574	25579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209917215
397	NC_011415	CGC	2	6	25590	25595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209917215
398	NC_011415	GAA	2	6	25817	25822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209917215
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400	NC_011415	TGT	2	6	25966	25971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209917215
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404	NC_011415	TGC	2	6	26278	26283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209917215
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493	NC_011415	CCG	2	6	33110	33115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209917224
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496	NC_011415	ATT	2	6	33225	33230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209917224
497	NC_011415	GCG	3	9	33256	33264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209917224
498	NC_011415	GAA	2	6	33291	33296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209917224
499	NC_011415	GTG	2	6	33384	33389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209917224
500	NC_011415	CAT	2	6	33410	33415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209917224

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