MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Escherichia coli SE11 plasmid pSE11-2

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011413	TTTCAA	2	12	2288	2299	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	209916831
2	NC_011413	ACTGCA	2	12	4022	4033	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	209916833
3	NC_011413	ATCTGA	2	12	4164	4175	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	209916833
4	NC_011413	ATTGTC	2	12	9250	9261	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	209916842
5	NC_011413	AGGGGA	2	12	9897	9908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011413	GCGATG	2	12	11186	11197	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	209916844
7	NC_011413	AAAAAT	2	12	12168	12179	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011413	ACCCCC	2	12	15953	15964	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	209916848
9	NC_011413	TTCATG	2	12	21049	21060	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	209916851
10	NC_011413	TCAGCA	2	12	29993	30004	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	209916866
11	NC_011413	GCAGAA	2	12	30399	30410	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	209916866
12	NC_011413	TACCGC	2	12	30423	30434	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	209916866
13	NC_011413	CTGCTA	3	18	31303	31320	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	209916868
14	NC_011413	TCAGCC	2	12	32378	32389	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	209916870
15	NC_011413	GGCGCT	2	12	33482	33493	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	209916872
16	NC_011413	CAGGTG	2	12	33513	33524	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	209916872
17	NC_011413	GCCGGA	2	12	33854	33865	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	209916872
18	NC_011413	CACTGG	2	12	35268	35279	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	209916873
19	NC_011413	TGGCAG	2	12	35944	35955	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	209916874
20	NC_011413	CGGGAA	2	12	36915	36926	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	209916877
21	NC_011413	TTCTGA	2	12	37030	37041	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	209916878
22	NC_011413	CTGTTC	2	12	41638	41649	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	209916886
23	NC_011413	CGCTGG	2	12	46833	46844	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	209916893
24	NC_011413	GCGGGC	2	12	47218	47229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209916893
25	NC_011413	ATCACC	2	12	48110	48121	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	209916893
26	NC_011413	CGGATA	2	12	49952	49963	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	209916897
27	NC_011413	AGAAAC	2	12	51222	51233	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	209916898
28	NC_011413	GCTGCA	2	12	55114	55125	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	209916902
29	NC_011413	GGCAGG	2	12	56965	56976	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	209916905
30	NC_011413	TCCTTT	2	12	57099	57110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209916905
31	NC_011413	TGGAGC	2	12	58090	58101	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	209916905
32	NC_011413	GCCAGT	2	12	60194	60205	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	209916906
33	NC_011413	GCTGTT	2	12	61470	61481	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	209916907
34	NC_011413	ATTTTT	2	12	63907	63918	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	209916910
35	NC_011413	GCAGGT	2	12	67591	67602	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	209916912
36	NC_011413	CTGACG	2	12	68240	68251	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	209916912
37	NC_011413	CAGGGA	2	12	70979	70990	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	209916912
38	NC_011413	CTTTGC	2	12	71399	71410	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	209916913
39	NC_011413	GTGAAA	2	12	76040	76051	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	209916920
40	NC_011413	ATTGTC	2	12	80777	80788	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	209916928
41	NC_011413	TAACTA	2	12	81664	81675	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	209916928
42	NC_011413	TTGTTT	2	12	89404	89415	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	209916938
43	NC_011413	TTTCGT	2	12	90445	90456	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.