MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Escherichia coli SE11 plasmid pSE11-2

Total Repeats: 244

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011413	AAAG	2	8	334	341	75 %	0 %	25 %	0 %	209916830
2	NC_011413	CTAA	2	8	1068	1075	50 %	25 %	0 %	25 %	209916831
3	NC_011413	TCAA	2	8	2030	2037	50 %	25 %	0 %	25 %	209916831
4	NC_011413	TCAG	2	8	2260	2267	25 %	25 %	25 %	25 %	209916831
5	NC_011413	CATG	2	8	2549	2556	25 %	25 %	25 %	25 %	209916831
6	NC_011413	ATTC	2	8	3741	3748	25 %	50 %	0 %	25 %	209916832
7	NC_011413	AGTA	2	8	3835	3842	50 %	25 %	25 %	0 %	209916832
8	NC_011413	AACA	2	8	5040	5047	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011413	CGTC	2	8	5451	5458	0 %	25 %	25 %	50 %	209916835
10	NC_011413	CAGC	2	8	5500	5507	25 %	0 %	25 %	50 %	209916835
11	NC_011413	CAGC	2	8	5634	5641	25 %	0 %	25 %	50 %	209916835
12	NC_011413	CATT	2	8	5768	5775	25 %	50 %	0 %	25 %	209916836
13	NC_011413	CATC	2	8	5942	5949	25 %	25 %	0 %	50 %	209916836
14	NC_011413	AGTC	2	8	6254	6261	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_011413	GGCA	2	8	6673	6680	25 %	0 %	50 %	25 %	209916839
16	NC_011413	AGTG	2	8	7236	7243	25 %	25 %	50 %	0 %	209916841
17	NC_011413	TCGC	2	8	7351	7358	0 %	25 %	25 %	50 %	209916841
18	NC_011413	CAGC	2	8	7488	7495	25 %	0 %	25 %	50 %	209916841
19	NC_011413	CAGG	2	8	7550	7557	25 %	0 %	50 %	25 %	209916841
20	NC_011413	TGTC	2	8	8131	8138	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_011413	TCCT	2	8	8176	8183	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_011413	AAAC	2	8	8550	8557	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_011413	CTGG	2	8	8853	8860	0 %	25 %	50 %	25 %	209916842
24	NC_011413	CAGC	2	8	8939	8946	25 %	0 %	25 %	50 %	209916842
25	NC_011413	TCGC	2	8	9721	9728	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_011413	TCGA	2	8	10532	10539	25 %	25 %	25 %	25 %	209916843
27	NC_011413	GCCA	2	8	10553	10560	25 %	0 %	25 %	50 %	209916843
28	NC_011413	AGTC	2	8	11330	11337	25 %	25 %	25 %	25 %	209916844
29	NC_011413	GAAG	2	8	11601	11608	50 %	0 %	50 %	0 %	209916844
30	NC_011413	AAGA	2	8	11958	11965	75 %	0 %	25 %	0 %	209916844
31	NC_011413	GCCT	2	8	12461	12468	0 %	25 %	25 %	50 %	209916845
32	NC_011413	GGTG	2	8	13490	13497	0 %	25 %	75 %	0 %	209916846
33	NC_011413	ATGC	2	8	14640	14647	25 %	25 %	25 %	25 %	209916847
34	NC_011413	CAGC	2	8	14930	14937	25 %	0 %	25 %	50 %	209916847
35	NC_011413	CTGT	2	8	15351	15358	0 %	50 %	25 %	25 %	209916848
36	NC_011413	CTTT	2	8	15518	15525	0 %	75 %	0 %	25 %	209916848
37	NC_011413	GGAT	2	8	15544	15551	25 %	25 %	50 %	0 %	209916848
38	NC_011413	TCTG	2	8	15851	15858	0 %	50 %	25 %	25 %	209916848
39	NC_011413	AATA	2	8	16890	16897	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011413	AACC	2	8	17082	17089	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_011413	AGAT	2	8	17139	17146	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011413	ATAG	2	8	17382	17389	50 %	25 %	25 %	0 %	209916849
43	NC_011413	ATCA	2	8	17681	17688	50 %	25 %	0 %	25 %	209916849
44	NC_011413	GGCT	2	8	17725	17732	0 %	25 %	50 %	25 %	209916849
45	NC_011413	ACCC	2	8	17742	17749	25 %	0 %	0 %	75 %	209916849
46	NC_011413	TCTT	2	8	18026	18033	0 %	75 %	0 %	25 %	209916849
47	NC_011413	TGAT	2	8	18290	18297	25 %	50 %	25 %	0 %	209916850
48	NC_011413	CTGG	2	8	18462	18469	0 %	25 %	50 %	25 %	209916850
49	NC_011413	TGGT	2	8	19227	19234	0 %	50 %	50 %	0 %	209916850
50	NC_011413	AAAT	2	8	19516	19523	75 %	25 %	0 %	0 %	209916851
51	NC_011413	TTCT	2	8	19681	19688	0 %	75 %	0 %	25 %	209916851
52	NC_011413	GCCA	2	8	19892	19899	25 %	0 %	25 %	50 %	209916851
53	NC_011413	AATG	2	8	20106	20113	50 %	25 %	25 %	0 %	209916851
54	NC_011413	CTTA	2	8	20204	20211	25 %	50 %	0 %	25 %	209916851
55	NC_011413	CCCT	2	8	20692	20699	0 %	25 %	0 %	75 %	209916851
56	NC_011413	AATG	2	8	20750	20757	50 %	25 %	25 %	0 %	209916851
57	NC_011413	AGAC	2	8	20894	20901	50 %	0 %	25 %	25 %	209916851
58	NC_011413	AGTG	2	8	20952	20959	25 %	25 %	50 %	0 %	209916851
59	NC_011413	GATG	2	8	21149	21156	25 %	25 %	50 %	0 %	209916851
60	NC_011413	TGCG	2	8	21664	21671	0 %	25 %	50 %	25 %	209916852
61	NC_011413	GTGA	2	8	21814	21821	25 %	25 %	50 %	0 %	209916853
62	NC_011413	AGAA	2	8	22049	22056	75 %	0 %	25 %	0 %	209916853
63	NC_011413	CAGC	2	8	22230	22237	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_011413	GTAT	2	8	22882	22889	25 %	50 %	25 %	0 %	209916854
65	NC_011413	GCTG	2	8	23107	23114	0 %	25 %	50 %	25 %	209916854
66	NC_011413	TTCA	2	8	23520	23527	25 %	50 %	0 %	25 %	209916854
67	NC_011413	TGGC	2	8	23642	23649	0 %	25 %	50 %	25 %	209916854
68	NC_011413	CGGG	2	8	23800	23807	0 %	0 %	75 %	25 %	209916855
69	NC_011413	TGGT	2	8	24441	24448	0 %	50 %	50 %	0 %	209916856
70	NC_011413	GCAG	2	8	24683	24690	25 %	0 %	50 %	25 %	209916856
71	NC_011413	ATGA	2	8	24932	24939	50 %	25 %	25 %	0 %	209916857
72	NC_011413	CAGT	2	8	25826	25833	25 %	25 %	25 %	25 %	209916859
73	NC_011413	ACGG	2	8	27189	27196	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_011413	CTGC	2	8	28061	28068	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_011413	ATTT	2	8	28658	28665	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011413	GTCA	2	8	28697	28704	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_011413	CGCT	2	8	29410	29417	0 %	25 %	25 %	50 %	209916866
78	NC_011413	CCCG	2	8	29522	29529	0 %	0 %	25 %	75 %	209916866
79	NC_011413	GAAG	2	8	29898	29905	50 %	0 %	50 %	0 %	209916866
80	NC_011413	CGGG	2	8	30100	30107	0 %	0 %	75 %	25 %	209916866
81	NC_011413	GCCA	2	8	30282	30289	25 %	0 %	25 %	50 %	209916866
82	NC_011413	CAGT	2	8	30565	30572	25 %	25 %	25 %	25 %	209916867
83	NC_011413	GTCT	2	8	30998	31005	0 %	50 %	25 %	25 %	209916867
84	NC_011413	GTCG	2	8	32022	32029	0 %	25 %	50 %	25 %	209916870
85	NC_011413	CAGA	2	8	32142	32149	50 %	0 %	25 %	25 %	209916870
86	NC_011413	GACT	2	8	32531	32538	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_011413	TAAG	2	8	32817	32824	50 %	25 %	25 %	0 %	209916871
88	NC_011413	ACTA	2	8	32882	32889	50 %	25 %	0 %	25 %	209916872
89	NC_011413	CCTG	2	8	33128	33135	0 %	25 %	25 %	50 %	209916872
90	NC_011413	GAAC	2	8	33899	33906	50 %	0 %	25 %	25 %	209916872
91	NC_011413	ACGC	2	8	34196	34203	25 %	0 %	25 %	50 %	209916872
92	NC_011413	TCAG	2	8	34465	34472	25 %	25 %	25 %	25 %	209916872
93	NC_011413	GCAG	2	8	34799	34806	25 %	0 %	50 %	25 %	209916872
94	NC_011413	GGCG	2	8	35408	35415	0 %	0 %	75 %	25 %	209916874
95	NC_011413	CCGT	2	8	36017	36024	0 %	25 %	25 %	50 %	209916874
96	NC_011413	GTCT	2	8	36210	36217	0 %	50 %	25 %	25 %	209916875
97	NC_011413	AGTG	2	8	36379	36386	25 %	25 %	50 %	0 %	209916875
98	NC_011413	GGCG	2	8	36762	36769	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
99	NC_011413	GGAA	2	8	37990	37997	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011413	GAAA	2	8	38557	38564	75 %	0 %	25 %	0 %	209916880
101	NC_011413	ATTT	2	8	38589	38596	25 %	75 %	0 %	0 %	209916880
102	NC_011413	ATGC	2	8	39598	39605	25 %	25 %	25 %	25 %	209916882
103	NC_011413	ATCT	2	8	40695	40702	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_011413	GCTA	2	8	41432	41439	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_011413	GGCT	2	8	42142	42149	0 %	25 %	50 %	25 %	209916887
106	NC_011413	ATCT	2	8	42276	42283	25 %	50 %	0 %	25 %	209916887
107	NC_011413	TATT	2	8	42322	42329	25 %	75 %	0 %	0 %	209916887
108	NC_011413	TGAA	2	8	43251	43258	50 %	25 %	25 %	0 %	209916889
109	NC_011413	CCAG	2	8	43652	43659	25 %	0 %	25 %	50 %	209916890
110	NC_011413	CCGG	2	8	43803	43810	0 %	0 %	50 %	50 %	209916890
111	NC_011413	GCGT	2	8	43930	43937	0 %	25 %	50 %	25 %	209916890
112	NC_011413	TGAT	2	8	44870	44877	25 %	50 %	25 %	0 %	209916891
113	NC_011413	CAGC	2	8	45991	45998	25 %	0 %	25 %	50 %	209916893
114	NC_011413	GCGG	2	8	46285	46292	0 %	0 %	75 %	25 %	209916893
115	NC_011413	GCGG	2	8	46327	46334	0 %	0 %	75 %	25 %	209916893
116	NC_011413	GGGC	2	8	46966	46973	0 %	0 %	75 %	25 %	209916893
117	NC_011413	ACCA	2	8	46991	46998	50 %	0 %	0 %	50 %	209916893
118	NC_011413	CTGC	2	8	47275	47282	0 %	25 %	25 %	50 %	209916893
119	NC_011413	CAAC	2	8	47308	47315	50 %	0 %	0 %	50 %	209916893
120	NC_011413	GTCT	2	8	48002	48009	0 %	50 %	25 %	25 %	209916893
121	NC_011413	TTCC	2	8	48349	48356	0 %	50 %	0 %	50 %	209916893
122	NC_011413	GCCG	2	8	48852	48859	0 %	0 %	50 %	50 %	209916894
123	NC_011413	CAGA	2	8	49379	49386	50 %	0 %	25 %	25 %	209916896
124	NC_011413	ATTT	2	8	49649	49656	25 %	75 %	0 %	0 %	209916896
125	NC_011413	AAGA	2	8	49776	49783	75 %	0 %	25 %	0 %	209916897
126	NC_011413	GACG	2	8	50052	50059	25 %	0 %	50 %	25 %	209916897
127	NC_011413	AGAC	2	8	50145	50152	50 %	0 %	25 %	25 %	209916897
128	NC_011413	TCTG	2	8	50265	50272	0 %	50 %	25 %	25 %	209916897
129	NC_011413	TGGC	2	8	51002	51009	0 %	25 %	50 %	25 %	209916898
130	NC_011413	GATT	2	8	51258	51265	25 %	50 %	25 %	0 %	209916898
131	NC_011413	GCTG	2	8	51510	51517	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_011413	AATA	2	8	51664	51671	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011413	AACA	2	8	52081	52088	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_011413	TCTG	2	8	52181	52188	0 %	50 %	25 %	25 %	209916900
135	NC_011413	CCGC	2	8	52389	52396	0 %	0 %	25 %	75 %	209916900
136	NC_011413	GAAG	2	8	52714	52721	50 %	0 %	50 %	0 %	209916900
137	NC_011413	GCTG	2	8	52791	52798	0 %	25 %	50 %	25 %	209916901
138	NC_011413	CAGC	2	8	52985	52992	25 %	0 %	25 %	50 %	209916901
139	NC_011413	GTGG	2	8	53766	53773	0 %	25 %	75 %	0 %	209916901
140	NC_011413	GCTG	2	8	54156	54163	0 %	25 %	50 %	25 %	209916901
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.