MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli SE11 plasmid pSE11-2

Total Repeats: 176

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011413	TGT	2	6	6229	6234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011413	TTC	2	6	6237	6242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011413	TAC	2	6	6379	6384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011413	TTA	2	6	6393	6398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011413	TGA	2	6	6428	6433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011413	TAA	2	6	6440	6445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011413	ATG	2	6	6508	6513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011413	CCA	2	6	8046	8051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_011413	CAT	2	6	8054	8059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011413	TTC	2	6	8209	8214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011413	TCT	2	6	8224	8229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011413	GAT	2	6	8413	8418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011413	ATT	2	6	8539	8544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011413	AGG	2	6	9494	9499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011413	GCG	2	6	9748	9753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011413	TGT	2	6	9822	9827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011413	TGT	2	6	9839	9844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011413	CTT	2	6	12150	12155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011413	CAC	2	6	12196	12201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_011413	ACA	2	6	13399	13404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_011413	CAT	2	6	16711	16716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011413	AAC	2	6	16872	16877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011413	ACC	2	6	17018	17023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_011413	AAT	2	6	17147	17152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011413	ATC	2	6	17160	17165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011413	CAT	2	6	17188	17193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011413	AAT	2	6	18076	18081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011413	TCA	2	6	21620	21625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011413	GTC	2	6	22239	22244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011413	CAG	2	6	22260	22265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011413	GTT	2	6	22376	22381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011413	TAA	2	6	22511	22516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011413	ATT	2	6	22542	22547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011413	CTG	2	6	22591	22596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011413	CTG	2	6	22601	22606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011413	CCT	2	6	22724	22729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_011413	TCG	2	6	22744	22749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011413	TCC	2	6	22751	22756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_011413	CAC	2	6	24121	24126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_011413	CGC	2	6	25530	25535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_011413	GCG	2	6	25542	25547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011413	CGC	2	6	26409	26414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_011413	CGC	2	6	26542	26547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_011413	CCT	2	6	26563	26568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_011413	AAC	2	6	26742	26747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011413	GGA	2	6	26748	26753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011413	GGC	2	6	27197	27202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011413	GCC	2	6	27206	27211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_011413	TGT	4	12	28003	28014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011413	CTG	2	6	28023	28028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011413	ACT	2	6	28040	28045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011413	GGC	2	6	28092	28097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011413	GCG	2	6	28539	28544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011413	CAG	3	9	28584	28592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011413	AGG	2	6	28739	28744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011413	ACT	2	6	31353	31358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011413	TCG	2	6	31643	31648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011413	GCG	2	6	31651	31656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011413	GTT	2	6	31668	31673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011413	GCG	2	6	31853	31858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011413	AGG	2	6	31977	31982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011413	ATT	2	6	32861	32866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011413	CGC	2	6	34878	34883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_011413	CCG	2	6	34885	34890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_011413	GCA	2	6	34902	34907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011413	ATG	2	6	36412	36417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011413	GGT	2	6	36455	36460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011413	ACA	2	6	36541	36546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011413	GAA	2	6	36581	36586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011413	GCT	2	6	36830	36835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011413	GCG	2	6	37515	37520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_011413	AGG	2	6	37639	37644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011413	TTG	2	6	37961	37966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011413	TAA	3	9	37976	37984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011413	GAG	2	6	38037	38042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011413	TAT	2	6	38917	38922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011413	TTG	2	6	38935	38940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011413	GTC	2	6	38942	38947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011413	TCA	2	6	38963	38968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011413	GTC	2	6	38981	38986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_011413	ATT	2	6	39792	39797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011413	GCA	2	6	39831	39836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011413	AGC	2	6	39876	39881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011413	TTA	2	6	39901	39906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011413	GGA	2	6	40660	40665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011413	ATC	2	6	40740	40745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011413	ATG	2	6	40836	40841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011413	TTG	2	6	40952	40957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011413	ATA	2	6	41072	41077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011413	CTT	2	6	41790	41795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_011413	AGG	2	6	42690	42695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011413	CTG	2	6	51266	51271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011413	TAT	2	6	51305	51310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011413	AAG	2	6	51402	51407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011413	TAG	2	6	51414	51419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011413	GGT	2	6	51538	51543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011413	TGA	2	6	51655	51660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011413	GAT	2	6	52063	52068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011413	ATA	2	6	56425	56430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011413	GCA	2	6	56505	56510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_011413	TTA	2	6	56552	56557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011413	CTT	2	6	56771	56776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_011413	TAA	2	6	63930	63935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011413	TGA	2	6	72110	72115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011413	CAA	2	6	72764	72769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011413	AAG	2	6	72804	72809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011413	ATT	2	6	72822	72827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011413	ACC	2	6	73194	73199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_011413	GAA	2	6	73222	73227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011413	AAT	2	6	73368	73373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011413	GGT	2	6	73403	73408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011413	ACA	2	6	73492	73497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_011413	AAT	2	6	74131	74136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011413	TAT	2	6	74269	74274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011413	GAA	2	6	74330	74335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011413	ATT	2	6	74420	74425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011413	CGA	2	6	74437	74442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011413	GTG	2	6	74446	74451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011413	GTA	2	6	74733	74738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011413	GAG	2	6	74770	74775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011413	CAT	2	6	76373	76378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011413	ATC	2	6	76393	76398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011413	TCA	2	6	76507	76512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011413	GTT	2	6	76525	76530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011413	AAG	2	6	76567	76572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011413	CGC	2	6	76640	76645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_011413	GCG	2	6	76753	76758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_011413	ACA	2	6	76784	76789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_011413	GCC	2	6	76871	76876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_011413	AAC	2	6	76894	76899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_011413	TGT	2	6	76918	76923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011413	AGC	2	6	76929	76934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_011413	ATC	2	6	76935	76940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_011413	TCT	2	6	76949	76954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_011413	CGG	2	6	77158	77163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_011413	GCC	2	6	77196	77201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_011413	GTA	2	6	77256	77261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011413	TAG	2	6	77865	77870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011413	AGC	3	9	78134	78142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_011413	CAG	2	6	78145	78150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_011413	GGA	2	6	78632	78637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011413	TCC	2	6	78707	78712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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144	NC_011413	TTC	2	6	78982	78987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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147	NC_011413	AAT	2	6	79201	79206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_011413	TTC	2	6	79272	79277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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176	NC_011413	AGG	2	6	91145	91150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.