MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli SE11 plasmid pSE11-2

Total Repeats: 1068

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011413	GCA	2	6	67	72	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209916830
2	NC_011413	TGA	2	6	216	221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209916830
3	NC_011413	GGC	2	6	234	239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209916830
4	NC_011413	GTC	2	6	247	252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916830
5	NC_011413	AAC	2	6	281	286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209916830
6	NC_011413	CCG	2	6	370	375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209916830
7	NC_011413	GAA	2	6	747	752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209916830
8	NC_011413	ATT	2	6	920	925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209916831
9	NC_011413	GAT	2	6	1260	1265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209916831
10	NC_011413	GCA	2	6	1304	1309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209916831
11	NC_011413	GTG	2	6	1609	1614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209916831
12	NC_011413	CAG	2	6	1644	1649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209916831
13	NC_011413	CAA	2	6	1767	1772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209916831
14	NC_011413	GAG	2	6	1843	1848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209916831
15	NC_011413	ATG	2	6	1864	1869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209916831
16	NC_011413	GCT	3	9	1968	1976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916831
17	NC_011413	TTA	2	6	1992	1997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209916831
18	NC_011413	CTG	2	6	2017	2022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916831
19	NC_011413	TGT	2	6	2024	2029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209916831
20	NC_011413	ACA	2	6	2268	2273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209916831
21	NC_011413	ACT	2	6	2314	2319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209916831
22	NC_011413	CAA	3	9	2332	2340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209916831
23	NC_011413	CTG	2	6	2350	2355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916831
24	NC_011413	GAA	2	6	2432	2437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209916831
25	NC_011413	ATA	2	6	2635	2640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209916831
26	NC_011413	CAG	2	6	2776	2781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209916831
27	NC_011413	ATA	2	6	2917	2922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209916831
28	NC_011413	GTT	2	6	2982	2987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209916831
29	NC_011413	GTT	2	6	3003	3008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209916831
30	NC_011413	TTA	2	6	3045	3050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209916831
31	NC_011413	ATA	2	6	3067	3072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209916831
32	NC_011413	TTG	2	6	3130	3135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209916831
33	NC_011413	AAG	2	6	3172	3177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209916831
34	NC_011413	TAT	2	6	3232	3237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209916831
35	NC_011413	ACG	2	6	3255	3260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209916831
36	NC_011413	CAG	2	6	3277	3282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209916831
37	NC_011413	CAA	2	6	3462	3467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209916832
38	NC_011413	TGC	2	6	3505	3510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916832
39	NC_011413	ACA	2	6	3539	3544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209916832
40	NC_011413	GGT	2	6	3656	3661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209916832
41	NC_011413	TTA	2	6	3885	3890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209916832
42	NC_011413	TGC	2	6	4003	4008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916833
43	NC_011413	CAC	2	6	4080	4085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209916833
44	NC_011413	CTG	2	6	4152	4157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916833
45	NC_011413	GGA	2	6	4256	4261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209916833
46	NC_011413	GCA	2	6	4286	4291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209916833
47	NC_011413	GCT	2	6	4541	4546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916834
48	NC_011413	TGC	2	6	4549	4554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916834
49	NC_011413	TAC	2	6	4574	4579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209916834
50	NC_011413	TTA	2	6	4675	4680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209916834
51	NC_011413	TGG	2	6	4832	4837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209916834
52	NC_011413	ACC	2	6	5204	5209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209916835
53	NC_011413	CTT	2	6	5214	5219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209916835
54	NC_011413	TGC	2	6	5241	5246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916835
55	NC_011413	CAC	2	6	5257	5262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209916835
56	NC_011413	CTG	2	6	5346	5351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916835
57	NC_011413	ACG	2	6	5369	5374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209916835
58	NC_011413	GGC	2	6	5403	5408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209916835
59	NC_011413	CAG	3	9	5419	5427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209916835
60	NC_011413	TCC	2	6	5513	5518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209916835
61	NC_011413	GAC	2	6	5520	5525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209916835
62	NC_011413	AGG	2	6	5529	5534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209916835
63	NC_011413	TCA	2	6	5624	5629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209916835
64	NC_011413	CGG	2	6	5675	5680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209916835
65	NC_011413	TCC	2	6	5701	5706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209916836
66	NC_011413	AGA	2	6	5807	5812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209916836
67	NC_011413	CGT	2	6	5887	5892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916836
68	NC_011413	GTT	2	6	5909	5914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209916836
69	NC_011413	ATA	2	6	5966	5971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209916837
70	NC_011413	ATA	2	6	6024	6029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209916837
71	NC_011413	ATT	2	6	6036	6041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209916837
72	NC_011413	TGG	2	6	6139	6144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209916838
73	NC_011413	GCC	2	6	6169	6174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209916838
74	NC_011413	AGC	2	6	6547	6552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209916839
75	NC_011413	ATG	2	6	6601	6606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209916839
76	NC_011413	CAC	2	6	6629	6634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209916839
77	NC_011413	CGT	2	6	6651	6656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916839
78	NC_011413	CGA	2	6	6740	6745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209916839
79	NC_011413	ATT	2	6	6832	6837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209916840
80	NC_011413	CTG	2	6	6883	6888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916840
81	NC_011413	GGT	2	6	6918	6923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209916840
82	NC_011413	ATG	2	6	6949	6954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209916840
83	NC_011413	ACC	2	6	6955	6960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209916840
84	NC_011413	GAA	2	6	6994	6999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209916840
85	NC_011413	TGT	2	6	7149	7154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209916841
86	NC_011413	ATG	2	6	7202	7207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209916841
87	NC_011413	CTG	2	6	7222	7227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916841
88	NC_011413	TGC	2	6	7280	7285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916841
89	NC_011413	AAC	2	6	7394	7399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209916841
90	NC_011413	AGC	2	6	7410	7415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209916841
91	NC_011413	GAA	2	6	7427	7432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209916841
92	NC_011413	CAG	2	6	7444	7449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209916841
93	NC_011413	TGG	2	6	7505	7510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209916841
94	NC_011413	TAA	2	6	7539	7544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209916841
95	NC_011413	GCC	2	6	7624	7629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209916841
96	NC_011413	GCT	3	9	7630	7638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916841
97	NC_011413	CAC	2	6	7667	7672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209916841
98	NC_011413	CAA	2	6	8576	8581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209916842
99	NC_011413	GTG	2	6	8630	8635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209916842
100	NC_011413	AGT	2	6	8745	8750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209916842
101	NC_011413	GTG	2	6	8845	8850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209916842
102	NC_011413	ACA	2	6	8992	8997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209916842
103	NC_011413	CAA	2	6	9083	9088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209916842
104	NC_011413	ATC	2	6	9120	9125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209916842
105	NC_011413	AGT	2	6	9185	9190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209916842
106	NC_011413	GCT	2	6	9193	9198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916842
107	NC_011413	GTT	2	6	9274	9279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209916842
108	NC_011413	CAA	2	6	9315	9320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209916842
109	NC_011413	ATC	2	6	10026	10031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209916843
110	NC_011413	GGA	2	6	10108	10113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209916843
111	NC_011413	GTC	2	6	10253	10258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916843
112	NC_011413	CAG	2	6	10434	10439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209916843
113	NC_011413	TAT	2	6	10501	10506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209916843
114	NC_011413	ATC	2	6	10520	10525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209916843
115	NC_011413	ATT	2	6	10625	10630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209916843
116	NC_011413	TCC	2	6	10692	10697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209916843
117	NC_011413	GAA	3	9	10811	10819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209916843
118	NC_011413	GTG	2	6	10971	10976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209916843
119	NC_011413	ATT	2	6	10991	10996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209916843
120	NC_011413	TTG	2	6	11282	11287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209916844
121	NC_011413	GCA	2	6	11364	11369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209916844
122	NC_011413	GCA	2	6	11665	11670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209916844
123	NC_011413	GAA	2	6	11752	11757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209916844
124	NC_011413	ACA	2	6	11762	11767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209916844
125	NC_011413	TTG	2	6	11987	11992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209916844
126	NC_011413	TCA	2	6	12370	12375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209916845
127	NC_011413	ATC	2	6	12404	12409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209916845
128	NC_011413	ATG	2	6	12525	12530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209916845
129	NC_011413	GTA	2	6	12581	12586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209916845
130	NC_011413	CGC	2	6	12652	12657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209916845
131	NC_011413	CTG	2	6	12741	12746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916845
132	NC_011413	CTG	2	6	12755	12760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916845
133	NC_011413	TCC	2	6	12777	12782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209916845
134	NC_011413	CTT	2	6	12911	12916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209916845
135	NC_011413	CTG	2	6	12924	12929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916845
136	NC_011413	TCC	2	6	12945	12950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209916845
137	NC_011413	CAG	2	6	12965	12970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209916845
138	NC_011413	CGG	2	6	12981	12986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209916845
139	NC_011413	CCA	2	6	13014	13019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209916845
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142	NC_011413	CTG	2	6	13444	13449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916846
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145	NC_011413	GCT	2	6	13597	13602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916846
146	NC_011413	GGT	2	6	13692	13697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209916846
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150	NC_011413	AGA	2	6	13929	13934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209916846
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152	NC_011413	GTT	2	6	14106	14111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209916846
153	NC_011413	AGT	2	6	14169	14174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209916846
154	NC_011413	TCA	2	6	14207	14212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209916846
155	NC_011413	TGC	2	6	14280	14285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916846
156	NC_011413	CGT	2	6	14299	14304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916846
157	NC_011413	AGT	2	6	14350	14355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209916846
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159	NC_011413	TAC	2	6	14402	14407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209916846
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163	NC_011413	AGG	2	6	14561	14566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209916847
164	NC_011413	CTT	2	6	14607	14612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209916847
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245	NC_011413	CCT	2	6	21373	21378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209916851
246	NC_011413	ACA	2	6	21398	21403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209916851
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248	NC_011413	TTG	2	6	21574	21579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209916851
249	NC_011413	CAG	2	6	21910	21915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209916853
250	NC_011413	CAG	2	6	21994	21999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209916853
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252	NC_011413	AAC	2	6	22157	22162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209916853
253	NC_011413	TGC	2	6	22221	22226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916853
254	NC_011413	GAG	2	6	22847	22852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209916854
255	NC_011413	CGC	2	6	22959	22964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209916854
256	NC_011413	GTG	2	6	23071	23076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209916854
257	NC_011413	CTG	2	6	23136	23141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916854
258	NC_011413	TGC	2	6	23161	23166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916854
259	NC_011413	CGC	2	6	23199	23204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209916854
260	NC_011413	GAT	2	6	23220	23225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209916854
261	NC_011413	GTG	2	6	23306	23311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209916854
262	NC_011413	CTG	2	6	23361	23366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916854
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265	NC_011413	GTG	2	6	23546	23551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209916854
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270	NC_011413	TGA	2	6	23992	23997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209916855
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272	NC_011413	CCG	2	6	24251	24256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209916856
273	NC_011413	TCG	2	6	24261	24266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916856
274	NC_011413	GCC	2	6	24413	24418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209916856
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280	NC_011413	GCA	2	6	24805	24810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209916856
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498	NC_011413	GTT	2	6	42070	42075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209916887
499	NC_011413	TGT	2	6	42080	42085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209916887
500	NC_011413	TAA	2	6	42086	42091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209916887

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