MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli SE11 plasmid pSE11-5

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011408	GGT	2	6	31	36	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209916818
2	NC_011408	GAA	2	6	112	117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209916818
3	NC_011408	GAA	2	6	150	155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209916818
4	NC_011408	GCC	2	6	195	200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209916818
5	NC_011408	GGA	2	6	202	207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209916818
6	NC_011408	TAC	2	6	367	372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209916818
7	NC_011408	TCC	2	6	473	478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209916818
8	NC_011408	CGG	2	6	654	659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209916818
9	NC_011408	ACG	2	6	768	773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209916818
10	NC_011408	CAG	2	6	778	783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209916818
11	NC_011408	GGA	2	6	865	870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209916818
12	NC_011408	GAT	2	6	907	912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209916818
13	NC_011408	GCA	2	6	913	918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209916818
14	NC_011408	CGG	2	6	1018	1023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209916818
15	NC_011408	GAA	2	6	1043	1048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209916818
16	NC_011408	GAA	2	6	1122	1127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209916818
17	NC_011408	CAG	2	6	1155	1160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209916818
18	NC_011408	AGC	2	6	1251	1256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209916818
19	NC_011408	AGA	2	6	1314	1319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209916818
20	NC_011408	CAG	2	6	1379	1384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209916818
21	NC_011408	TGT	2	6	1685	1690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209916820
22	NC_011408	GCC	2	6	1706	1711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209916820
23	NC_011408	TCA	2	6	1862	1867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209916821
24	NC_011408	ATT	2	6	1892	1897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209916821
25	NC_011408	GTT	2	6	2236	2241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209916821
26	NC_011408	AAC	2	6	2422	2427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209916821
27	NC_011408	CAT	2	6	2625	2630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209916821
28	NC_011408	ATG	2	6	2778	2783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209916821
29	NC_011408	GTT	2	6	2788	2793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209916821
30	NC_011408	ATT	2	6	2892	2897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209916822
31	NC_011408	ATC	2	6	2903	2908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209916822
32	NC_011408	TGA	2	6	2924	2929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209916822
33	NC_011408	TAT	2	6	2984	2989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209916822
34	NC_011408	GAT	2	6	3051	3056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209916822
35	NC_011408	GTT	2	6	3075	3080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209916822
36	NC_011408	TCT	2	6	3087	3092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209916822
37	NC_011408	ATC	2	6	3107	3112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209916822
38	NC_011408	ACC	2	6	3120	3125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209916822
39	NC_011408	GCT	2	6	3185	3190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916822
40	NC_011408	TTG	2	6	3292	3297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209916822
41	NC_011408	TCT	2	6	3351	3356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209916822
42	NC_011408	TTC	2	6	4455	4460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209916823
43	NC_011408	CGC	2	6	4509	4514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209916823
44	NC_011408	CTG	2	6	4580	4585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916823
45	NC_011408	GCC	2	6	4596	4601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209916823

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.