MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Escherichia coli SE11 plasmid pSE11-4

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011407	GAA	2	6	220	225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209916807
2	NC_011407	ATT	2	6	259	264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209916807
3	NC_011407	TGG	2	6	338	343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011407	TGG	2	6	436	441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011407	ATT	2	6	521	526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209916808
6	NC_011407	AAT	2	6	545	550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209916808
7	NC_011407	TCA	3	9	561	569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209916808
8	NC_011407	TTA	2	6	844	849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209916808
9	NC_011407	ACA	2	6	879	884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209916808
10	NC_011407	ATC	2	6	1031	1036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209916808
11	NC_011407	TCA	2	6	1158	1163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209916808
12	NC_011407	AAT	2	6	1326	1331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209916809
13	NC_011407	CGC	2	6	1447	1452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209916809
14	NC_011407	GGC	2	6	1459	1464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209916809
15	NC_011407	CAA	3	9	1478	1486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209916809
16	NC_011407	TGC	2	6	1778	1783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916810
17	NC_011407	CTG	2	6	1786	1791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916810
18	NC_011407	TCT	2	6	1851	1856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209916810
19	NC_011407	GCT	2	6	1914	1919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916810
20	NC_011407	CTG	2	6	2010	2015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916810
21	NC_011407	TTC	2	6	2043	2048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209916810
22	NC_011407	TTC	2	6	2122	2127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209916810
23	NC_011407	TCC	2	6	2142	2147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209916810
24	NC_011407	TGC	2	6	2252	2257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916810
25	NC_011407	ATC	2	6	2258	2263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209916810
26	NC_011407	CTG	2	6	2387	2392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916810
27	NC_011407	TCG	2	6	2396	2401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916810
28	NC_011407	TCC	2	6	2506	2511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209916810
29	NC_011407	GTA	2	6	2798	2803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209916810
30	NC_011407	TCC	2	6	2963	2968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209916810
31	NC_011407	CGG	2	6	2969	2974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209916810
32	NC_011407	TTC	2	6	3015	3020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209916810
33	NC_011407	CTT	2	6	3052	3057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209916810
34	NC_011407	CAG	2	6	3107	3112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209916810
35	NC_011407	ATC	2	6	3165	3170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209916810
36	NC_011407	GAC	2	6	3189	3194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209916812
37	NC_011407	CCA	2	6	3239	3244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209916812
38	NC_011407	CGG	2	6	3339	3344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209916812
39	NC_011407	CGC	2	6	3397	3402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209916812
40	NC_011407	GTT	2	6	3416	3421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209916812
41	NC_011407	TCA	3	9	3454	3462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209916812
42	NC_011407	GCT	2	6	3610	3615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916813
43	NC_011407	TGA	2	6	3682	3687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209916813
44	NC_011407	TGA	2	6	3718	3723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209916813
45	NC_011407	GCA	2	6	3961	3966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011407	GCG	2	6	4022	4027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011407	CGC	2	6	4133	4138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209916814
48	NC_011407	TGG	2	6	4247	4252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011407	GCA	2	6	4491	4496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011407	TAG	2	6	4527	4532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011407	GTG	2	6	4555	4560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011407	GAA	2	6	4628	4633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011407	ACC	2	6	4665	4670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_011407	GGT	2	6	4680	4685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011407	ACG	2	6	4711	4716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011407	AAG	2	6	4733	4738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011407	ACT	2	6	4869	4874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209916815
58	NC_011407	CAC	2	6	5006	5011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209916815
59	NC_011407	TCT	2	6	5062	5067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209916815
60	NC_011407	GTT	2	6	5080	5085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209916815
61	NC_011407	GGA	2	6	5101	5106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209916815
62	NC_011407	AGT	2	6	5147	5152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209916815
63	NC_011407	ATT	2	6	5161	5166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209916815
64	NC_011407	CAG	2	6	5264	5269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209916815
65	NC_011407	AGT	2	6	5317	5322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209916815
66	NC_011407	TTC	2	6	5325	5330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209916815
67	NC_011407	AAC	2	6	5465	5470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011407	AGA	2	6	5743	5748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011407	TCT	2	6	5877	5882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209916816
70	NC_011407	TGG	2	6	5945	5950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209916816
71	NC_011407	TCA	2	6	6008	6013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209916816
72	NC_011407	GAA	2	6	6102	6107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209916816
73	NC_011407	CGT	2	6	6216	6221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_011407	TAA	2	6	6366	6371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011407	CTT	2	6	6472	6477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011407	ACC	2	6	6497	6502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_011407	AAT	2	6	6868	6873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.