MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes NZ131 chromosome

Total Repeats: 92

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011375	AGTGTA	2	12	21881	21892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011375	ACTAAT	2	12	21909	21920	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_011375	AGTGTA	2	12	27882	27893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011375	ACTAAT	2	12	27910	27921	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_011375	TATTTT	2	12	64901	64912	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011375	AGCTGA	2	12	66591	66602	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_011375	AGTGTA	2	12	84876	84887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011375	ACTAAT	2	12	84904	84915	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_011375	TTCGGG	2	12	85846	85857	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_011375	ATAAAA	2	12	114330	114341	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011375	AGATAA	2	12	125769	125780	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011375	AGATAA	2	12	138593	138604	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011375	CTTTAT	2	12	164281	164292	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_011375	CTCTTT	2	12	166145	166156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011375	GGTGTT	2	12	169212	169223	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011375	TGACAC	2	12	193002	193013	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011375	TTTAAA	2	12	199488	199499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011375	TGGCGG	2	12	248532	248543	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_011375	AGTGTA	2	12	272267	272278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011375	ACTAAT	2	12	272295	272306	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_011375	GGGTTA	2	12	286764	286775	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011375	TTAAAA	2	12	292657	292668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011375	TTTAAT	2	12	309732	309743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011375	TTTTAG	2	12	321088	321099	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011375	AAAGGA	2	12	341576	341587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011375	AGCTTA	2	12	358559	358570	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_011375	ACTATA	2	12	358686	358697	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_011375	TTTAAA	2	12	368742	368753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011375	ATTTAA	2	12	384638	384649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011375	AGAAAT	2	12	418633	418644	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011375	ATTTTA	2	12	449917	449928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011375	GAGTAA	2	12	455706	455717	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011375	AGGACT	2	12	476649	476660	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_011375	TAAAAA	2	12	496078	496089	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011375	AAAAGA	2	12	496261	496272	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011375	GAAAAA	2	12	524591	524602	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011375	CCTTGT	2	12	569706	569717	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011375	TAAATA	2	12	683698	683709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011375	AGGTAA	2	12	694501	694512	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011375	TTCGGG	2	12	729497	729508	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_011375	TTTTTA	2	12	753264	753275	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011375	TAAAAA	2	12	761525	761536	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011375	TAAATA	2	12	761717	761728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011375	GATGTG	2	12	763913	763924	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011375	GAAAAA	2	12	821091	821102	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011375	GAAAAG	2	12	852236	852247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011375	TTAAAA	2	12	883675	883686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011375	TAACAA	2	12	936125	936136	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_011375	TTTAAA	2	12	998052	998063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011375	AGTCTT	2	12	1000912	1000923	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_011375	TTGTTT	2	12	1027472	1027483	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011375	ATATGA	2	12	1052659	1052670	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011375	ATATGA	2	12	1054436	1054447	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011375	TTCCAC	2	12	1056446	1056457	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_011375	AGTCTT	2	12	1074371	1074382	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_011375	TCTTTT	2	12	1101545	1101556	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_011375	CTCAGT	2	12	1104679	1104690	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011375	GATTTT	2	12	1112943	1112954	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011375	TGACTT	2	12	1156693	1156704	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_011375	ATGATA	2	12	1163200	1163211	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011375	AATGTT	2	12	1246368	1246379	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011375	TATTAG	2	12	1248182	1248193	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011375	TACACT	2	12	1248211	1248222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011375	GAAAAA	2	12	1253678	1253689	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011375	CAATTC	2	12	1272760	1272771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011375	TATTTT	2	12	1273834	1273845	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011375	GTTATT	2	12	1277352	1277363	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011375	AATACC	2	12	1282853	1282864	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011375	TAGCAA	2	12	1282916	1282927	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_011375	CTTCAG	2	12	1327173	1327184	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011375	AACAAT	2	12	1355390	1355401	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_011375	TACAAT	2	12	1380348	1380359	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_011375	CTAGTC	2	12	1435004	1435015	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_011375	AATATT	2	12	1452962	1452973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011375	GCTACA	2	12	1506839	1506850	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011375	TTGCTT	2	12	1517526	1517537	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_011375	TATAAT	2	12	1520361	1520372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011375	TAACAA	2	12	1531454	1531465	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_011375	AGAAAA	2	12	1536536	1536547	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011375	TATTAG	2	12	1542870	1542881	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011375	TACACT	2	12	1542899	1542910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011375	GAACTT	2	12	1549557	1549568	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_011375	GTTAAA	2	12	1557979	1557990	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011375	TGTCAG	2	12	1602950	1602961	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_011375	CCTTTA	2	12	1689667	1689678	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_011375	GCTGGC	2	12	1699272	1699283	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011375	ATTTTA	2	12	1744204	1744215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011375	TTCAAT	2	12	1744350	1744361	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_011375	ATCTAA	2	12	1744368	1744379	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_011375	TTTTCA	2	12	1751398	1751409	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_011375	TAAAAA	2	12	1763378	1763389	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011375	GAAAAA	2	12	1811268	1811279	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.