MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes NZ131 chromosome

Total Repeats: 302

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011375	ACATT	2	10	16521	16530	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_011375	TCGTG	2	10	18141	18150	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_011375	GTTAA	2	10	19038	19047	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011375	GGGAG	2	10	19557	19566	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011375	AGGGA	2	10	21768	21777	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011375	GCTTA	2	10	22134	22143	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_011375	TCGTG	2	10	24143	24152	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_011375	GTTAA	2	10	25039	25048	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011375	GGGAG	2	10	25558	25567	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011375	AGGGA	2	10	27769	27778	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011375	GCTTA	2	10	28135	28144	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_011375	TTCTT	2	10	29969	29978	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_011375	CTTTT	2	10	30075	30084	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_011375	TATAA	2	10	32485	32494	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011375	AGCGA	2	10	40610	40619	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_011375	ATTTT	2	10	61391	61400	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011375	AAATA	2	10	62658	62667	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011375	TATAT	2	10	62743	62752	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011375	AAGGA	2	10	70602	70611	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011375	GTTTC	2	10	77871	77880	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_011375	TCGTG	2	10	81129	81138	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_011375	GTTAA	2	10	82025	82034	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011375	GGGAG	2	10	82544	82553	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011375	AGGGA	2	10	84763	84772	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011375	GCTTA	2	10	85129	85138	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_011375	ATTAT	2	10	85419	85428	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011375	TATAT	2	10	85502	85511	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011375	TAGTT	2	10	111016	111025	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011375	TTTAG	2	10	119056	119065	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011375	TTGGC	2	10	138220	138229	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_011375	CTTAA	2	10	138419	138428	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_011375	AAGCT	2	10	157669	157678	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_011375	AAGCA	2	10	157716	157725	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_011375	CTTTT	2	10	158860	158869	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_011375	CGTCA	2	10	164044	164053	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_011375	AAAAG	2	10	180265	180274	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011375	CCAAA	2	10	184400	184409	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_011375	TCCCA	2	10	184602	184611	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
39	NC_011375	TCTAA	2	10	194506	194515	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_011375	TTAAA	2	10	199286	199295	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011375	TAAGA	2	10	209923	209932	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011375	GTAAA	2	10	213067	213076	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011375	CCTTT	2	10	222186	222195	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_011375	GTTCA	2	10	230285	230294	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_011375	TCATT	2	10	259896	259905	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_011375	TTGTA	2	10	266519	266528	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011375	TCGTG	2	10	268525	268534	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_011375	GTTAA	2	10	269421	269430	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011375	GGGAG	2	10	269940	269949	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011375	AGGGA	2	10	272154	272163	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011375	AAAAG	2	10	272830	272839	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011375	TTATC	2	10	273629	273638	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_011375	GTTAT	2	10	281976	281985	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011375	TAGCA	2	10	282118	282127	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_011375	ATTAT	2	10	286558	286567	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011375	ATTAT	2	10	286696	286705	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011375	TGTGT	2	10	299948	299957	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011375	AAAAG	2	10	308345	308354	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011375	TTATG	2	10	311110	311119	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011375	TGCTA	2	10	319576	319585	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_011375	CAGGG	2	10	319596	319605	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
62	NC_011375	TAAAA	2	10	325243	325252	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011375	ACAAG	2	10	342973	342982	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_011375	TTGAT	2	10	349706	349715	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011375	AGTAG	2	10	353512	353521	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011375	TCAAA	2	10	353528	353537	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_011375	TGAAA	2	10	358661	358670	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011375	GCTAT	2	10	359352	359361	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_011375	AGAAA	2	10	359458	359467	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011375	TGAAA	2	10	361275	361284	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011375	AATTA	3	15	361891	361905	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011375	AGAAA	2	10	362889	362898	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011375	TCATA	2	10	365491	365500	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_011375	TTGAT	2	10	366358	366367	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011375	TTAAA	2	10	369603	369612	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011375	TTATT	2	10	369640	369649	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011375	TTAAT	2	10	373520	373529	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011375	AAAAT	2	10	375277	375286	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011375	TATAG	2	10	376980	376989	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011375	TGAGA	2	10	379450	379459	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011375	TTGAT	2	10	379473	379482	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011375	TTTAT	2	10	389032	389041	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011375	AAATC	2	10	392787	392796	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_011375	AGAAA	2	10	394573	394582	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011375	AAGGA	2	10	403246	403255	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011375	ACTCT	2	10	405493	405502	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_011375	AGAGT	2	10	406289	406298	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011375	AAAGC	2	10	412553	412562	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_011375	TTTAA	2	10	424808	424817	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011375	AGCTT	2	10	437215	437224	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_011375	TTTTC	2	10	437259	437268	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_011375	AAAAG	2	10	448876	448885	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011375	TTATT	2	10	470291	470300	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011375	TCCTT	2	10	489436	489445	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_011375	GTTAT	2	10	492686	492695	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011375	TTTCC	2	10	494253	494262	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_011375	AGAAA	2	10	494391	494400	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011375	TTAGT	2	10	498806	498815	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011375	TATAA	2	10	499836	499845	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011375	TTATC	2	10	506489	506498	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_011375	GAAAA	2	10	506511	506520	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011375	CTGCT	2	10	506625	506634	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_011375	CTTTT	2	10	509130	509139	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_011375	ATGGG	2	10	512536	512545	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011375	TTTAG	2	10	512579	512588	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011375	CTGCT	2	10	512687	512696	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_011375	TAGAA	2	10	514278	514287	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011375	TAAAA	2	10	514885	514894	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011375	TTTCC	2	10	520654	520663	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
110	NC_011375	AAAAG	2	10	520664	520673	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011375	TTAAT	2	10	524810	524819	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011375	AGCTG	2	10	529388	529397	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_011375	ATAAA	2	10	530767	530776	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011375	TTTTG	2	10	533635	533644	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011375	AAGCC	2	10	534623	534632	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_011375	TGATA	2	10	544256	544265	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011375	AGGAA	2	10	554808	554817	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011375	AAAAG	2	10	578518	578527	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011375	ATAAA	2	10	582354	582363	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011375	GAATA	2	10	585712	585721	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011375	ATAGA	2	10	594833	594842	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011375	AGCAC	2	10	601466	601475	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_011375	TATAA	2	10	602551	602560	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011375	AGCAT	2	10	611236	611245	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_011375	GAAAG	2	10	614489	614498	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011375	TGTCA	2	10	639627	639636	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_011375	AAAGA	2	10	651255	651264	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011375	TCTTT	2	10	651309	651318	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_011375	AAATA	2	10	651336	651345	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011375	TTCGG	2	10	662442	662451	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
131	NC_011375	AAAAG	2	10	664339	664348	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011375	TGAAA	2	10	664963	664972	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011375	AGATT	2	10	664973	664982	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011375	CACTT	2	10	665495	665504	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NC_011375	TTTTA	2	10	683399	683408	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011375	ATGTT	2	10	688294	688303	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011375	AAAGG	2	10	712085	712094	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011375	ATTGA	2	10	712112	712121	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011375	ATGTT	2	10	717177	717186	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011375	TCTTA	2	10	718865	718874	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_011375	AGAAT	2	10	728004	728013	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011375	CTAAT	2	10	729540	729549	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_011375	CATCT	2	10	731865	731874	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
144	NC_011375	ATAAA	2	10	733885	733894	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011375	TACTA	2	10	750891	750900	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_011375	AGAAA	2	10	753283	753292	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011375	AATTA	2	10	755038	755047	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011375	ATATA	2	10	785776	785785	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011375	GGAAA	2	10	787654	787663	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011375	TAAGG	2	10	800943	800952	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011375	CACCT	2	10	803166	803175	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
152	NC_011375	ATATA	2	10	813355	813364	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011375	TAGAA	2	10	820808	820817	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
154	NC_011375	ATTTA	2	10	821170	821179	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_011375	ATAAA	2	10	833307	833316	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_011375	TAAAA	2	10	843165	843174	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_011375	TGAAA	2	10	843211	843220	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_011375	AATAA	2	10	907125	907134	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_011375	CTTGT	2	10	913169	913178	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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168	NC_011375	AATTG	2	10	940151	940160	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_011375	CTTTG	2	10	969663	969672	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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173	NC_011375	ATTTA	2	10	998025	998034	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_011375	CTTTT	2	10	1085777	1085786	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
187	NC_011375	CTTTT	2	10	1085793	1085802	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
188	NC_011375	AGTTA	2	10	1089205	1089214	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
189	NC_011375	AATAG	2	10	1107872	1107881	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_011375	TAGAA	2	10	1137206	1137215	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_011375	TTATT	2	10	1772497	1772506	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_011375	ATTTC	2	10	1781128	1781137	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
291	NC_011375	GCGAG	2	10	1783791	1783800	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
292	NC_011375	TGTTT	2	10	1787531	1787540	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
293	NC_011375	CAATT	2	10	1795486	1795495	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
294	NC_011375	TAAAT	2	10	1802225	1802234	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_011375	TATCA	2	10	1803782	1803791	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
296	NC_011375	TTATC	2	10	1803987	1803996	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
297	NC_011375	ACTTC	2	10	1804052	1804061	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
298	NC_011375	AGAAC	2	10	1811043	1811052	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
299	NC_011375	GTCAA	2	10	1811481	1811490	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
300	NC_011375	TAAAC	2	10	1811764	1811773	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
301	NC_011375	AAAAG	2	10	1813527	1813536	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
302	NC_011375	CTTTT	2	10	1813558	1813567	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.