MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes NZ131 chromosome

Total Repeats: 819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011375	ATTT	2	8	121	128	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011375	ACTA	2	8	147	154	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011375	TTTA	2	8	1662	1669	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011375	TAAA	2	8	3159	3166	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011375	TTGA	2	8	3449	3456	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011375	GAAC	2	8	8783	8790	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_011375	TACT	2	8	16576	16583	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_011375	AAAT	2	8	17018	17025	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011375	ACCT	2	8	17193	17200	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_011375	GTGA	2	8	17474	17481	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011375	TAAC	2	8	17557	17564	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011375	AGCG	2	8	17645	17652	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_011375	TGGT	2	8	18310	18317	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011375	AGCC	2	8	18527	18534	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_011375	AGCG	2	8	18873	18880	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011375	GTAA	2	8	19124	19131	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011375	GAAG	2	8	19206	19213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011375	GCGA	2	8	19280	19287	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_011375	ATTC	2	8	20146	20153	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_011375	CTAA	2	8	20502	20509	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_011375	TAGG	2	8	21157	21164	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011375	TTGG	2	8	21340	21347	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011375	AATC	2	8	21349	21356	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_011375	AAAT	2	8	23021	23028	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011375	ACCT	2	8	23195	23202	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_011375	GTGA	2	8	23476	23483	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011375	TAAC	2	8	23559	23566	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_011375	AGCG	2	8	23647	23654	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_011375	TGGT	2	8	24312	24319	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011375	AGCC	2	8	24529	24536	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_011375	AGCG	2	8	24875	24882	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_011375	GTAA	2	8	25125	25132	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011375	GAAG	2	8	25207	25214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011375	GCGA	2	8	25281	25288	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_011375	ATTC	2	8	26147	26154	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_011375	CTAA	2	8	26503	26510	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_011375	TAGG	2	8	27158	27165	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011375	TTGG	2	8	27341	27348	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011375	AATC	2	8	27350	27357	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_011375	GCGT	2	8	29197	29204	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_011375	TAAA	2	8	29748	29755	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011375	GTTA	2	8	30091	30098	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011375	ATTC	2	8	30863	30870	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_011375	ATTA	2	8	33648	33655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011375	GGAA	2	8	36729	36736	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011375	TAGT	2	8	43338	43345	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011375	AAAG	2	8	44092	44099	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011375	AGAA	2	8	48517	48524	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011375	TGAT	2	8	50383	50390	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011375	GATT	2	8	55695	55702	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011375	AAAG	2	8	58485	58492	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011375	ATTT	2	8	61538	61545	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011375	TATT	2	8	67508	67515	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011375	TAAA	2	8	71170	71177	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011375	TTAA	2	8	71410	71417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011375	TATT	2	8	75922	75929	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011375	AAAT	2	8	80007	80014	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011375	ACCT	2	8	80181	80188	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_011375	GTGA	2	8	80462	80469	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011375	TAAC	2	8	80545	80552	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_011375	AGCG	2	8	80633	80640	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_011375	TGGT	2	8	81298	81305	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011375	AGCC	2	8	81515	81522	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_011375	AGCG	2	8	81861	81868	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_011375	GTAA	2	8	82111	82118	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011375	ACTA	2	8	82153	82160	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_011375	GAAG	2	8	82193	82200	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011375	GCGA	2	8	82267	82274	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_011375	ATTC	2	8	83133	83140	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_011375	CTAA	2	8	83489	83496	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_011375	TAGG	2	8	84146	84153	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011375	TTGG	2	8	84329	84336	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011375	AATC	2	8	84338	84345	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_011375	GCGT	2	8	85573	85580	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_011375	TGAT	2	8	86914	86921	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011375	GTTC	2	8	86926	86933	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_011375	AAAT	2	8	86953	86960	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011375	CAAT	2	8	87088	87095	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_011375	CAAT	2	8	97931	97938	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_011375	ATTC	2	8	103225	103232	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_011375	GTTA	2	8	108264	108271	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011375	TAAG	2	8	110725	110732	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011375	ATCA	2	8	111139	111146	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_011375	TTCA	2	8	112118	112125	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_011375	ATCA	2	8	112277	112284	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_011375	TGAT	2	8	112316	112323	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011375	ATTA	2	8	118874	118881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011375	AAGG	2	8	119066	119073	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011375	CTTG	2	8	124306	124313	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_011375	TGAT	2	8	124365	124372	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011375	AAAG	2	8	125806	125813	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011375	AAAT	2	8	125854	125861	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011375	ATCG	2	8	129528	129535	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_011375	CTTT	2	8	130409	130416	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_011375	GTCA	2	8	135816	135823	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_011375	TATC	2	8	136583	136590	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_011375	TTAG	2	8	143555	143562	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011375	GCTT	2	8	147539	147546	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_011375	GAAA	2	8	149810	149817	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011375	CCTG	2	8	150030	150037	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_011375	TAGT	2	8	151524	151531	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011375	ACAA	2	8	153609	153616	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_011375	TAAA	2	8	153843	153850	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011375	TAGC	2	8	158802	158809	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_011375	AAAT	2	8	159692	159699	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011375	AAAT	2	8	159761	159768	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011375	GGAT	2	8	169329	169336	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011375	AGTC	2	8	171148	171155	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_011375	ATAG	2	8	178715	178722	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011375	CGTG	2	8	179196	179203	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_011375	TAAA	2	8	179716	179723	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011375	ATCA	2	8	179840	179847	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_011375	ATAA	2	8	180210	180217	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011375	AATC	2	8	182202	182209	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_011375	TTGA	2	8	182899	182906	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011375	CAAC	2	8	182951	182958	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_011375	AGAC	2	8	182985	182992	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_011375	GGGT	2	8	184839	184846	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011375	TTAG	2	8	185119	185126	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011375	AACT	2	8	186213	186220	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_011375	AATC	2	8	186445	186452	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_011375	TGAT	2	8	186618	186625	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011375	ATGG	2	8	186718	186725	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011375	TGTT	2	8	187605	187612	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011375	TTTA	2	8	187638	187645	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011375	ATCA	2	8	187716	187723	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_011375	ATGG	2	8	187913	187920	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011375	ATTT	2	8	187924	187931	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011375	AAGA	2	8	191347	191354	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011375	TTTA	2	8	194860	194867	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011375	AGTA	2	8	195669	195676	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011375	TAGA	2	8	196008	196015	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011375	GATT	2	8	199408	199415	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011375	AGGG	2	8	199536	199543	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011375	AGTG	2	8	200638	200645	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011375	CTTT	2	8	206966	206973	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_011375	AGCA	2	8	206990	206997	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_011375	TGAT	2	8	207028	207035	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011375	ACCG	2	8	209877	209884	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_011375	ACAA	2	8	210592	210599	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_011375	TAAA	2	8	216806	216813	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011375	CAAT	2	8	216841	216848	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_011375	TCAA	2	8	216856	216863	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_011375	TTTG	2	8	216945	216952	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011375	TAGT	2	8	219353	219360	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011375	GTTT	2	8	219398	219405	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011375	AAAT	2	8	219534	219541	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011375	ATAG	2	8	224019	224026	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011375	TTTG	2	8	224081	224088	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011375	AAAG	2	8	229329	229336	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011375	CAAA	2	8	239874	239881	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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