MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus pyogenes NZ131 chromosome

Total Repeats: 24853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011375	TTG	2	6	1	6	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011375	AAG	2	6	217	222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011375	ATG	2	6	320	325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209558588
4	NC_011375	CTG	2	6	421	426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209558588
5	NC_011375	GAA	2	6	471	476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209558588
6	NC_011375	AGC	2	6	523	528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209558588
7	NC_011375	TGC	2	6	623	628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209558588
8	NC_011375	TTA	2	6	711	716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209558588
9	NC_011375	TTA	2	6	787	792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209558588
10	NC_011375	TGA	2	6	872	877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209558588
11	NC_011375	AAG	2	6	916	921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209558588
12	NC_011375	ATA	3	9	949	957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209558588
13	NC_011375	ATC	2	6	994	999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209558588
14	NC_011375	AGA	2	6	1010	1015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209558588
15	NC_011375	CCT	2	6	1062	1067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209558588
16	NC_011375	TGC	2	6	1253	1258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209558588
17	NC_011375	GAA	2	6	1314	1319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209558588
18	NC_011375	CTA	2	6	1372	1377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209558588
19	NC_011375	TGG	2	6	1472	1477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209558588
20	NC_011375	TAA	2	6	1508	1513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209558588
21	NC_011375	AAC	2	6	1634	1639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011375	CTA	4	12	1695	1706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011375	TTA	3	9	1708	1716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011375	TTA	2	6	1720	1725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011375	ATT	2	6	1767	1772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209558589
26	NC_011375	TCA	2	6	1834	1839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209558589
27	NC_011375	TTA	2	6	1966	1971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209558589
28	NC_011375	ATT	2	6	1993	1998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209558589
29	NC_011375	AAC	2	6	2039	2044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209558589
30	NC_011375	GTT	2	6	2050	2055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209558589
31	NC_011375	AAG	2	6	2120	2125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209558589
32	NC_011375	ATT	2	6	2160	2165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209558589
33	NC_011375	TAT	2	6	2172	2177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209558589
34	NC_011375	GTC	2	6	2213	2218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209558589
35	NC_011375	CAG	2	6	2327	2332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209558589
36	NC_011375	CAG	2	6	2375	2380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209558589
37	NC_011375	GAT	2	6	2389	2394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209558589
38	NC_011375	TTA	2	6	2503	2508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209558589
39	NC_011375	GTT	2	6	2530	2535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209558589
40	NC_011375	CTT	2	6	2574	2579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209558589
41	NC_011375	GAA	2	6	2833	2838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209558589
42	NC_011375	TTA	2	6	2911	2916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011375	ATA	2	6	2929	2934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011375	ATG	2	6	3096	3101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209558590
45	NC_011375	AGA	2	6	3252	3257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011375	AAT	2	6	3330	3335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011375	TCT	2	6	3402	3407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011375	TCT	2	6	3424	3429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011375	TAA	2	6	3441	3446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011375	CAG	2	6	3489	3494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209558591
51	NC_011375	GCT	2	6	3563	3568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209558591
52	NC_011375	TGA	3	9	3799	3807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209558591
53	NC_011375	AGA	2	6	4045	4050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209558591
54	NC_011375	GTT	2	6	4061	4066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209558591
55	NC_011375	AAC	2	6	4084	4089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209558591
56	NC_011375	AGT	2	6	4198	4203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209558591
57	NC_011375	AGA	3	9	4222	4230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209558591
58	NC_011375	AGA	2	6	4258	4263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209558591
59	NC_011375	AGC	2	6	4315	4320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209558591
60	NC_011375	ATC	2	6	4323	4328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209558591
61	NC_011375	CAG	2	6	4353	4358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209558591
62	NC_011375	GCT	2	6	4412	4417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209558591
63	NC_011375	TAT	2	6	4420	4425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209558591
64	NC_011375	ATG	2	6	4473	4478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209558591
65	NC_011375	AAG	2	6	4512	4517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209558591
66	NC_011375	GAA	2	6	4532	4537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209558591
67	NC_011375	TGT	2	6	4549	4554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209558591
68	NC_011375	CAT	2	6	4567	4572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209558591
69	NC_011375	GAA	2	6	4622	4627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011375	TTG	2	6	4677	4682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209558592
71	NC_011375	GAT	2	6	4781	4786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209558592
72	NC_011375	TTA	2	6	4818	4823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209558592
73	NC_011375	CTA	2	6	4851	4856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209558592
74	NC_011375	AAT	2	6	4865	4870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209558592
75	NC_011375	CTA	2	6	4900	4905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209558592
76	NC_011375	ATG	2	6	4938	4943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209558592
77	NC_011375	CAG	2	6	4989	4994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209558592
78	NC_011375	GAC	2	6	5070	5075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209558592
79	NC_011375	TTA	2	6	5094	5099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209558592
80	NC_011375	ATA	2	6	5130	5135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209558592
81	NC_011375	ATT	2	6	5250	5255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011375	ACC	2	6	5296	5301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_011375	GAT	2	6	5371	5376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209558593
84	NC_011375	TGA	2	6	5451	5456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209558593
85	NC_011375	TGA	2	6	5702	5707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209558593
86	NC_011375	TTA	2	6	5735	5740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209558593
87	NC_011375	TGA	2	6	5826	5831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209558593
88	NC_011375	AAC	2	6	5879	5884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209558593
89	NC_011375	TTA	2	6	5897	5902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209558593
90	NC_011375	GAT	2	6	5986	5991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209558593
91	NC_011375	AGA	2	6	6006	6011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209558593
92	NC_011375	ATT	2	6	6069	6074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209558593
93	NC_011375	ATT	2	6	6093	6098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209558593
94	NC_011375	GAT	2	6	6133	6138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209558593
95	NC_011375	AGA	2	6	6198	6203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209558593
96	NC_011375	ACT	2	6	6236	6241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209558593
97	NC_011375	CTT	2	6	6285	6290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209558593
98	NC_011375	AAC	2	6	6423	6428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209558593
99	NC_011375	TGA	2	6	6585	6590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209558593
100	NC_011375	ACG	2	6	6639	6644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209558593
101	NC_011375	CTG	2	6	6869	6874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209558593
102	NC_011375	TAA	2	6	6894	6899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209558593
103	NC_011375	ATG	2	6	6905	6910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209558593
104	NC_011375	TGA	2	6	6963	6968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209558593
105	NC_011375	AAG	2	6	6990	6995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209558593
106	NC_011375	GAT	2	6	7024	7029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209558593
107	NC_011375	TGA	3	9	7047	7055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209558593
108	NC_011375	AGA	2	6	7074	7079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209558593
109	NC_011375	TAG	2	6	7145	7150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209558593
110	NC_011375	CAG	2	6	7255	7260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209558593
111	NC_011375	GTA	2	6	7328	7333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209558593
112	NC_011375	ATT	2	6	7384	7389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209558593
113	NC_011375	AAC	2	6	7460	7465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209558593
114	NC_011375	AAT	2	6	7645	7650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209558593
115	NC_011375	GGA	2	6	7693	7698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209558593
116	NC_011375	ATG	2	6	7853	7858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209558593
117	NC_011375	ATC	2	6	7876	7881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209558593
118	NC_011375	GAA	2	6	7979	7984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209558593
119	NC_011375	GAG	2	6	8126	8131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209558593
120	NC_011375	GAT	2	6	8296	8301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209558593
121	NC_011375	AAT	2	6	8500	8505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209558593
122	NC_011375	CTT	2	6	8531	8536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209558593
123	NC_011375	ATT	2	6	8558	8563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209558593
124	NC_011375	AGA	2	6	8667	8672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209558593
125	NC_011375	ATA	2	6	8736	8741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209558593
126	NC_011375	AAC	2	6	8748	8753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_011375	TGC	2	6	8827	8832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_011375	TTA	2	6	8935	8940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209558594
129	NC_011375	CGT	2	6	8943	8948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209558594
130	NC_011375	AAG	2	6	8959	8964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209558594
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132	NC_011375	AAT	2	6	9187	9192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209558595
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