MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 plasmid pRLG204

Total Repeats: 165

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011371	CGGCT	2	10	147	156	0 %	20 %	40 %	40 %	209552196
2	NC_011371	CATGC	2	10	4965	4974	20 %	20 %	20 %	40 %	209552200
3	NC_011371	TGACG	2	10	5349	5358	20 %	20 %	40 %	20 %	209552200
4	NC_011371	CGGCG	2	10	7658	7667	0 %	0 %	60 %	40 %	209552202
5	NC_011371	TGGCT	2	10	7872	7881	0 %	40 %	40 %	20 %	209552202
6	NC_011371	GCCTG	2	10	8547	8556	0 %	20 %	40 %	40 %	209552203
7	NC_011371	CGCGG	2	10	9023	9032	0 %	0 %	60 %	40 %	209552204
8	NC_011371	TGAGG	2	10	9688	9697	20 %	20 %	60 %	0 %	209552204
9	NC_011371	CTGCG	2	10	10712	10721	0 %	20 %	40 %	40 %	209552206
10	NC_011371	TTTCC	2	10	11317	11326	0 %	60 %	0 %	40 %	209552207
11	NC_011371	GATCG	2	10	15757	15766	20 %	20 %	40 %	20 %	209552212
12	NC_011371	GTGAC	2	10	16560	16569	20 %	20 %	40 %	20 %	209552213
13	NC_011371	GCCGC	2	10	16919	16928	0 %	0 %	40 %	60 %	209552213
14	NC_011371	GGGCA	2	10	18609	18618	20 %	0 %	60 %	20 %	209552215
15	NC_011371	GGCAA	2	10	19561	19570	40 %	0 %	40 %	20 %	209552216
16	NC_011371	GCAGG	2	10	20211	20220	20 %	0 %	60 %	20 %	209552216
17	NC_011371	GCCGC	2	10	24928	24937	0 %	0 %	40 %	60 %	209552220
18	NC_011371	CATCG	2	10	28063	28072	20 %	20 %	20 %	40 %	209552221
19	NC_011371	CGGCG	2	10	32678	32687	0 %	0 %	60 %	40 %	209552225
20	NC_011371	TGATC	2	10	38918	38927	20 %	40 %	20 %	20 %	209552231
21	NC_011371	ATGCC	2	10	39767	39776	20 %	20 %	20 %	40 %	209552231
22	NC_011371	TGCGC	2	10	40529	40538	0 %	20 %	40 %	40 %	209552232
23	NC_011371	CGGCG	2	10	43592	43601	0 %	0 %	60 %	40 %	209552234
24	NC_011371	GATCG	2	10	45684	45693	20 %	20 %	40 %	20 %	209552237
25	NC_011371	ATGCT	2	10	47457	47466	20 %	40 %	20 %	20 %	209552240
26	NC_011371	ATGAA	2	10	47768	47777	60 %	20 %	20 %	0 %	209552240
27	NC_011371	GAACG	2	10	49215	49224	40 %	0 %	40 %	20 %	209552242
28	NC_011371	ATTTC	2	10	49866	49875	20 %	60 %	0 %	20 %	209552243
29	NC_011371	CCCTT	2	10	52089	52098	0 %	40 %	0 %	60 %	209552244
30	NC_011371	CACGC	2	10	52926	52935	20 %	0 %	20 %	60 %	209552245
31	NC_011371	GCTGC	2	10	53853	53862	0 %	20 %	40 %	40 %	209552245
32	NC_011371	TCTCC	2	10	54821	54830	0 %	40 %	0 %	60 %	209552247
33	NC_011371	GCACG	2	10	55383	55392	20 %	0 %	40 %	40 %	209552247
34	NC_011371	CCGTT	2	10	57441	57450	0 %	40 %	20 %	40 %	209552248
35	NC_011371	CGTCC	2	10	57886	57895	0 %	20 %	20 %	60 %	209552248
36	NC_011371	CATCG	2	10	58252	58261	20 %	20 %	20 %	40 %	209552248
37	NC_011371	GTGCC	2	10	63500	63509	0 %	20 %	40 %	40 %	209552250
38	NC_011371	GCCGT	2	10	64180	64189	0 %	20 %	40 %	40 %	209552250
39	NC_011371	GTGCC	2	10	64520	64529	0 %	20 %	40 %	40 %	209552250
40	NC_011371	GTGCC	2	10	65345	65354	0 %	20 %	40 %	40 %	209552250
41	NC_011371	GCCGT	2	10	66025	66034	0 %	20 %	40 %	40 %	209552250
42	NC_011371	GTGCC	2	10	66365	66374	0 %	20 %	40 %	40 %	209552250
43	NC_011371	ACATC	2	10	66572	66581	40 %	20 %	0 %	40 %	209552250
44	NC_011371	GCCGA	2	10	68655	68664	20 %	0 %	40 %	40 %	209552250
45	NC_011371	CGATA	2	10	68672	68681	40 %	20 %	20 %	20 %	209552250
46	NC_011371	CCTTT	2	10	69783	69792	0 %	60 %	0 %	40 %	209552250
47	NC_011371	CAGCG	2	10	76340	76349	20 %	0 %	40 %	40 %	209552256
48	NC_011371	CGAGC	2	10	77339	77348	20 %	0 %	40 %	40 %	209552256
49	NC_011371	GCCTC	2	10	77430	77439	0 %	20 %	20 %	60 %	209552257
50	NC_011371	CCCTG	2	10	81220	81229	0 %	20 %	20 %	60 %	209552260
51	NC_011371	GGAAA	2	10	81992	82001	60 %	0 %	40 %	0 %	209552260
52	NC_011371	CAGCG	2	10	82904	82913	20 %	0 %	40 %	40 %	209552261
53	NC_011371	CCATC	2	10	87436	87445	20 %	20 %	0 %	60 %	209552264
54	NC_011371	ACCCG	2	10	88943	88952	20 %	0 %	20 %	60 %	209552265
55	NC_011371	GGCAA	2	10	89516	89525	40 %	0 %	40 %	20 %	209552265
56	NC_011371	CGAAC	2	10	91213	91222	40 %	0 %	20 %	40 %	209552267
57	NC_011371	TGCCG	2	10	91395	91404	0 %	20 %	40 %	40 %	209552268
58	NC_011371	GCCGT	2	10	91588	91597	0 %	20 %	40 %	40 %	209552268
59	NC_011371	AGTGA	2	10	94079	94088	40 %	20 %	40 %	0 %	209552270
60	NC_011371	GCTTC	2	10	99517	99526	0 %	40 %	20 %	40 %	209552274
61	NC_011371	ATCCG	2	10	99532	99541	20 %	20 %	20 %	40 %	209552274
62	NC_011371	TATGT	2	10	102182	102191	20 %	60 %	20 %	0 %	209552278
63	NC_011371	GCCCT	2	10	104245	104254	0 %	20 %	20 %	60 %	209552280
64	NC_011371	CGGTG	2	10	104513	104522	0 %	20 %	60 %	20 %	209552280
65	NC_011371	GCAGC	2	10	105312	105321	20 %	0 %	40 %	40 %	209552281
66	NC_011371	GATCG	2	10	105429	105438	20 %	20 %	40 %	20 %	209552281
67	NC_011371	TCAGC	2	10	106666	106675	20 %	20 %	20 %	40 %	209552282
68	NC_011371	TCGCC	2	10	106714	106723	0 %	20 %	20 %	60 %	209552282
69	NC_011371	GATCG	2	10	109880	109889	20 %	20 %	40 %	20 %	209552285
70	NC_011371	GATCG	2	10	111208	111217	20 %	20 %	40 %	20 %	209552286
71	NC_011371	CGCAT	2	10	113992	114001	20 %	20 %	20 %	40 %	209552288
72	NC_011371	ACGAG	2	10	116698	116707	40 %	0 %	40 %	20 %	209552291
73	NC_011371	GGCAC	2	10	117002	117011	20 %	0 %	40 %	40 %	209552291
74	NC_011371	AAATG	2	10	118950	118959	60 %	20 %	20 %	0 %	209552292
75	NC_011371	ATTTA	2	10	120526	120535	40 %	60 %	0 %	0 %	209552293
76	NC_011371	GCGCT	2	10	121053	121062	0 %	20 %	40 %	40 %	209552294
77	NC_011371	CATCC	2	10	122055	122064	20 %	20 %	0 %	60 %	209552296
78	NC_011371	AATGG	2	10	122352	122361	40 %	20 %	40 %	0 %	209552296
79	NC_011371	CCGGC	2	10	122616	122625	0 %	0 %	40 %	60 %	209552296
80	NC_011371	CGCGC	2	10	128171	128180	0 %	0 %	40 %	60 %	209552301
81	NC_011371	ACCGG	2	10	130129	130138	20 %	0 %	40 %	40 %	209552302
82	NC_011371	TCGTT	2	10	132397	132406	0 %	60 %	20 %	20 %	209552304
83	NC_011371	GTTCC	2	10	133138	133147	0 %	40 %	20 %	40 %	209552305
84	NC_011371	GCGGA	2	10	136337	136346	20 %	0 %	60 %	20 %	209552308
85	NC_011371	CGGCG	2	10	140411	140420	0 %	0 %	60 %	40 %	209552313
86	NC_011371	GCAGA	2	10	140758	140767	40 %	0 %	40 %	20 %	209552313
87	NC_011371	GGCGA	2	10	142548	142557	20 %	0 %	60 %	20 %	209552313
88	NC_011371	GATGC	2	10	142752	142761	20 %	20 %	40 %	20 %	209552313
89	NC_011371	CGATG	2	10	146326	146335	20 %	20 %	40 %	20 %	209552317
90	NC_011371	AGAAC	2	10	147740	147749	60 %	0 %	20 %	20 %	209552319
91	NC_011371	GGCCT	2	10	147941	147950	0 %	20 %	40 %	40 %	209552320
92	NC_011371	GAAGG	2	10	148108	148117	40 %	0 %	60 %	0 %	209552320
93	NC_011371	TGCCG	2	10	152583	152592	0 %	20 %	40 %	40 %	209552325
94	NC_011371	GTTCA	2	10	154299	154308	20 %	40 %	20 %	20 %	209552326
95	NC_011371	GACCA	2	10	156904	156913	40 %	0 %	20 %	40 %	209552328
96	NC_011371	CTGGA	2	10	159349	159358	20 %	20 %	40 %	20 %	209552332
97	NC_011371	CGCTG	2	10	159540	159549	0 %	20 %	40 %	40 %	209552332
98	NC_011371	GCCGG	3	15	160144	160158	0 %	0 %	60 %	40 %	209552332
99	NC_011371	CAGGA	2	10	160568	160577	40 %	0 %	40 %	20 %	209552333
100	NC_011371	CGCGC	2	10	161132	161141	0 %	0 %	40 %	60 %	209552333
101	NC_011371	CGAAA	2	10	162175	162184	60 %	0 %	20 %	20 %	209552333
102	NC_011371	GATCA	2	10	162726	162735	40 %	20 %	20 %	20 %	209552334
103	NC_011371	CGGCG	2	10	164201	164210	0 %	0 %	60 %	40 %	209552336
104	NC_011371	TGCCC	2	10	164248	164257	0 %	20 %	20 %	60 %	209552336
105	NC_011371	GCCTC	2	10	165269	165278	0 %	20 %	20 %	60 %	209552336
106	NC_011371	CAGGG	2	10	166376	166385	20 %	0 %	60 %	20 %	209552337
107	NC_011371	GACAT	2	10	167007	167016	40 %	20 %	20 %	20 %	209552338
108	NC_011371	GGGGA	2	10	169659	169668	20 %	0 %	80 %	0 %	209552340
109	NC_011371	CTCGG	2	10	172094	172103	0 %	20 %	40 %	40 %	209552342
110	NC_011371	CGCGC	2	10	173564	173573	0 %	0 %	40 %	60 %	209552344
111	NC_011371	ATCAC	2	10	173858	173867	40 %	20 %	0 %	40 %	209552344
112	NC_011371	AGCGA	2	10	175291	175300	40 %	0 %	40 %	20 %	209552345
113	NC_011371	GGCCG	2	10	176776	176785	0 %	0 %	60 %	40 %	209552347
114	NC_011371	CTTGC	2	10	177393	177402	0 %	40 %	20 %	40 %	209552347
115	NC_011371	TGCTC	2	10	182487	182496	0 %	40 %	20 %	40 %	209552351
116	NC_011371	GCCGT	2	10	182882	182891	0 %	20 %	40 %	40 %	209552351
117	NC_011371	GCTCG	2	10	183094	183103	0 %	20 %	40 %	40 %	209552351
118	NC_011371	CGCGG	2	10	185712	185721	0 %	0 %	60 %	40 %	209552353
119	NC_011371	CCCGG	2	10	185864	185873	0 %	0 %	40 %	60 %	209552354
120	NC_011371	TCGAT	2	10	185931	185940	20 %	40 %	20 %	20 %	209552354
121	NC_011371	CCGGC	2	10	187957	187966	0 %	0 %	40 %	60 %	209552354
122	NC_011371	ATGCC	2	10	195415	195424	20 %	20 %	20 %	40 %	209552361
123	NC_011371	CGCTT	2	10	196676	196685	0 %	40 %	20 %	40 %	209552362
124	NC_011371	GAAAT	2	10	197230	197239	60 %	20 %	20 %	0 %	209552362
125	NC_011371	GCGAT	2	10	200110	200119	20 %	20 %	40 %	20 %	209552365
126	NC_011371	TGCCA	2	10	202164	202173	20 %	20 %	20 %	40 %	209552366
127	NC_011371	TGCCC	2	10	203363	203372	0 %	20 %	20 %	60 %	209552368
128	NC_011371	CAGGC	2	10	203443	203452	20 %	0 %	40 %	40 %	209552368
129	NC_011371	CAGGG	2	10	205621	205630	20 %	0 %	60 %	20 %	209552371
130	NC_011371	GAGGC	2	10	206245	206254	20 %	0 %	60 %	20 %	209552371
131	NC_011371	CGAGC	2	10	206523	206532	20 %	0 %	40 %	40 %	209552371
132	NC_011371	GCGTC	2	10	208420	208429	0 %	20 %	40 %	40 %	209552372
133	NC_011371	CGCTG	2	10	210319	210328	0 %	20 %	40 %	40 %	209552373
134	NC_011371	CGGCG	2	10	214036	214045	0 %	0 %	60 %	40 %	209552377
135	NC_011371	CCGGC	2	10	214118	214127	0 %	0 %	40 %	60 %	209552377
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152	NC_011371	TGCGA	2	10	238109	238118	20 %	20 %	40 %	20 %	209552399
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162	NC_011371	CGGCT	2	10	251901	251910	0 %	20 %	40 %	40 %	209552412
163	NC_011371	ATGCG	2	10	253834	253843	20 %	20 %	40 %	20 %	209552414
164	NC_011371	GTCGT	2	10	255762	255771	0 %	40 %	40 %	20 %	209552416
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.