MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 plasmid pRLG204

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011371	CGGC	2	8	7	14	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_011371	CGGA	2	8	11620	11627	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011371	GCGG	2	8	14292	14299	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4	NC_011371	CTCG	2	8	23201	23208	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_011371	GTAA	2	8	23571	23578	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011371	CAAT	2	8	28503	28510	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_011371	TTTG	2	8	32196	32203	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011371	CATA	2	8	33307	33314	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011371	GGCC	2	8	39931	39938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_011371	CTTC	2	8	47202	47209	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_011371	TCGG	2	8	47274	47281	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011371	CATA	2	8	49351	49358	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_011371	CGGG	2	8	49428	49435	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14	NC_011371	GAGG	2	8	61405	61412	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011371	ACCG	2	8	61448	61455	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_011371	CGGG	2	8	61528	61535	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011371	ATTG	2	8	73399	73406	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011371	TTCC	2	8	79055	79062	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_011371	GATC	2	8	79324	79331	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_011371	ATTA	2	8	79392	79399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011371	TCTT	2	8	80321	80328	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_011371	AAGT	2	8	85908	85915	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011371	CGCA	2	8	85986	85993	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_011371	CGAT	2	8	86277	86284	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_011371	GGGC	2	8	89931	89938	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
26	NC_011371	ACAT	2	8	99712	99719	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_011371	ATCC	2	8	102100	102107	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_011371	TCCC	2	8	111756	111763	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
29	NC_011371	GACC	2	8	120702	120709	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_011371	AGCC	2	8	120860	120867	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_011371	ATCC	2	8	120884	120891	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_011371	CCGG	2	8	129387	129394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_011371	AAAG	2	8	137953	137960	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011371	GGAT	2	8	138142	138149	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011371	ACGG	2	8	147326	147333	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_011371	CGGA	2	8	147585	147592	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_011371	CGGC	2	8	147916	147923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_011371	GAAG	2	8	148573	148580	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011371	CCGA	2	8	149025	149032	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_011371	GCCG	2	8	149037	149044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_011371	CATG	2	8	150767	150774	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_011371	GCGG	2	8	150815	150822	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
43	NC_011371	GCTT	2	8	150838	150845	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_011371	CCTT	2	8	157105	157112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_011371	GTTG	2	8	157987	157994	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011371	TATC	2	8	162501	162508	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_011371	GTAG	2	8	162513	162520	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011371	CTCG	2	8	163238	163245	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_011371	CAGG	2	8	163942	163949	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_011371	GCCC	2	8	168013	168020	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
51	NC_011371	TGCC	2	8	170471	170478	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_011371	TGAC	2	8	172564	172571	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_011371	GGAA	2	8	172708	172715	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011371	TCAG	2	8	173506	173513	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_011371	AGCG	2	8	181015	181022	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_011371	GCCG	2	8	181322	181329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_011371	TGCA	2	8	193896	193903	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_011371	AGTT	2	8	194964	194971	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011371	TTCG	2	8	196353	196360	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_011371	CCCA	2	8	202954	202961	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
61	NC_011371	GCCG	2	8	206982	206989	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_011371	CGTT	2	8	211119	211126	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_011371	ATCA	2	8	212119	212126	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_011371	GACA	2	8	214935	214942	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_011371	CGGT	2	8	216487	216494	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_011371	CGAT	2	8	225052	225059	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_011371	GATC	2	8	234646	234653	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_011371	TCTT	2	8	236159	236166	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_011371	GAAA	2	8	242605	242612	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011371	CGGA	2	8	252204	252211	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_011371	AGTG	2	8	257143	257150	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.