MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 plasmid pRLG204

Total Repeats: 4115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011371	GCC	2	6	50	55	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552196
2	NC_011371	TCG	2	6	90	95	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552196
3	NC_011371	GCG	2	6	100	105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552196
4	NC_011371	CGA	2	6	115	120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552196
5	NC_011371	GGA	2	6	190	195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209552196
6	NC_011371	CTT	2	6	287	292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209552196
7	NC_011371	GTC	2	6	293	298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552196
8	NC_011371	GCA	2	6	481	486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552196
9	NC_011371	ATA	2	6	557	562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209552196
10	NC_011371	ATC	2	6	668	673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209552196
11	NC_011371	TCG	2	6	678	683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552196
12	NC_011371	GCC	2	6	782	787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552196
13	NC_011371	ATC	2	6	918	923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209552196
14	NC_011371	AGC	2	6	978	983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552196
15	NC_011371	TTC	2	6	1031	1036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209552196
16	NC_011371	AGC	2	6	1083	1088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552196
17	NC_011371	CGA	2	6	1153	1158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552196
18	NC_011371	GAT	2	6	1232	1237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209552196
19	NC_011371	GCC	2	6	1241	1246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552196
20	NC_011371	CGC	2	6	1350	1355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552197
21	NC_011371	GCG	2	6	1393	1398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552197
22	NC_011371	GCG	2	6	1415	1420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552197
23	NC_011371	TCA	2	6	1440	1445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209552197
24	NC_011371	AGG	2	6	1554	1559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209552197
25	NC_011371	ACG	2	6	1565	1570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552197
26	NC_011371	GAA	2	6	1612	1617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209552197
27	NC_011371	CCG	2	6	1649	1654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552197
28	NC_011371	GAT	2	6	1783	1788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209552197
29	NC_011371	CAG	2	6	1798	1803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552197
30	NC_011371	GAT	3	9	1807	1815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209552197
31	NC_011371	GAA	2	6	1843	1848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209552197
32	NC_011371	TGG	2	6	1911	1916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209552197
33	NC_011371	ATA	2	6	1954	1959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209552197
34	NC_011371	GCA	2	6	2040	2045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552197
35	NC_011371	CGC	2	6	2055	2060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552197
36	NC_011371	ATC	2	6	2126	2131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209552197
37	NC_011371	ATG	2	6	2144	2149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209552197
38	NC_011371	GCG	2	6	2217	2222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552197
39	NC_011371	GCC	2	6	2240	2245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552197
40	NC_011371	GAT	2	6	2263	2268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209552197
41	NC_011371	CAT	2	6	2281	2286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209552197
42	NC_011371	GAA	2	6	2307	2312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209552198
43	NC_011371	TGG	2	6	2414	2419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209552198
44	NC_011371	GGC	2	6	2430	2435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552198
45	NC_011371	GAC	2	6	2439	2444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552198
46	NC_011371	ACA	2	6	2476	2481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209552198
47	NC_011371	GTC	2	6	2515	2520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552198
48	NC_011371	CGG	2	6	2651	2656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552198
49	NC_011371	GAC	3	9	2700	2708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552198
50	NC_011371	GCA	2	6	2768	2773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552198
51	NC_011371	CAG	3	9	2877	2885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552198
52	NC_011371	GAC	2	6	2892	2897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552198
53	NC_011371	CAG	4	12	2970	2981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552198
54	NC_011371	AGC	2	6	3013	3018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552198
55	NC_011371	GCC	2	6	3028	3033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552198
56	NC_011371	CGG	3	9	3104	3112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552198
57	NC_011371	GCG	2	6	3131	3136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552198
58	NC_011371	CAG	2	6	3291	3296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552198
59	NC_011371	CAT	2	6	3358	3363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209552199
60	NC_011371	CGT	2	6	3387	3392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552199
61	NC_011371	GGC	2	6	3414	3419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552199
62	NC_011371	CGA	2	6	3423	3428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552199
63	NC_011371	TCG	2	6	3461	3466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552199
64	NC_011371	CAG	2	6	3481	3486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552199
65	NC_011371	CGG	2	6	3489	3494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552199
66	NC_011371	CGG	2	6	3503	3508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552199
67	NC_011371	GCC	2	6	3533	3538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552199
68	NC_011371	TCG	2	6	3548	3553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552199
69	NC_011371	GCC	2	6	3591	3596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552199
70	NC_011371	GCC	2	6	3634	3639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552199
71	NC_011371	CCG	3	9	3668	3676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552199
72	NC_011371	TCG	2	6	3689	3694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552199
73	NC_011371	CGA	2	6	3858	3863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552199
74	NC_011371	CGC	3	9	3912	3920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552199
75	NC_011371	CGC	2	6	3955	3960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552199
76	NC_011371	GAT	2	6	3982	3987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209552199
77	NC_011371	CGG	2	6	4124	4129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552199
78	NC_011371	GCC	2	6	4195	4200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552199
79	NC_011371	GCA	2	6	4203	4208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552199
80	NC_011371	CGA	2	6	4209	4214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552199
81	NC_011371	GCC	2	6	4226	4231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552199
82	NC_011371	TCG	2	6	4238	4243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552199
83	NC_011371	TCG	2	6	4346	4351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552199
84	NC_011371	TGC	2	6	4403	4408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552199
85	NC_011371	CTT	2	6	4483	4488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209552199
86	NC_011371	CGC	2	6	4492	4497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552199
87	NC_011371	CGC	2	6	4615	4620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552199
88	NC_011371	TCA	2	6	4701	4706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209552199
89	NC_011371	ACC	2	6	4745	4750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209552199
90	NC_011371	GCG	2	6	5036	5041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552200
91	NC_011371	TGG	2	6	5216	5221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209552200
92	NC_011371	CCG	2	6	5626	5631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552200
93	NC_011371	GCA	2	6	5697	5702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552200
94	NC_011371	GGC	2	6	5703	5708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552200
95	NC_011371	GCC	2	6	5724	5729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552200
96	NC_011371	CGA	2	6	5753	5758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552200
97	NC_011371	GCC	2	6	5776	5781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552200
98	NC_011371	CCG	2	6	5785	5790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552200
99	NC_011371	GCC	2	6	5796	5801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552200
100	NC_011371	TCG	2	6	5885	5890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552200
101	NC_011371	CGC	2	6	5951	5956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552200
102	NC_011371	GGC	2	6	6054	6059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552200
103	NC_011371	CCG	2	6	6101	6106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552200
104	NC_011371	GCC	2	6	6158	6163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552200
105	NC_011371	GCG	2	6	6196	6201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552200
106	NC_011371	GCC	2	6	6226	6231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552200
107	NC_011371	CAT	2	6	6278	6283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209552201
108	NC_011371	GCC	2	6	6386	6391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552201
109	NC_011371	TCA	2	6	6397	6402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209552201
110	NC_011371	CGC	2	6	6458	6463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552201
111	NC_011371	GCG	2	6	6520	6525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552201
112	NC_011371	GGC	2	6	6569	6574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552201
113	NC_011371	CGG	2	6	6653	6658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552201
114	NC_011371	GAA	2	6	6662	6667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209552201
115	NC_011371	GCA	2	6	6723	6728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552201
116	NC_011371	CGC	2	6	6883	6888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552201
117	NC_011371	TTG	2	6	6978	6983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209552201
118	NC_011371	GAA	2	6	7524	7529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209552202
119	NC_011371	GTC	2	6	7562	7567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552202
120	NC_011371	GCT	2	6	7631	7636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552202
121	NC_011371	GGC	2	6	7770	7775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552202
122	NC_011371	TCG	2	6	7840	7845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552202
123	NC_011371	TGC	2	6	7886	7891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552202
124	NC_011371	GCT	2	6	7892	7897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552202
125	NC_011371	GGA	2	6	7929	7934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209552202
126	NC_011371	CAT	2	6	7964	7969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209552202
127	NC_011371	AGC	2	6	7975	7980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552202
128	NC_011371	CAT	2	6	8072	8077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209552202
129	NC_011371	CGT	2	6	8159	8164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552203
130	NC_011371	CGC	3	9	8234	8242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552203
131	NC_011371	GCC	2	6	8291	8296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552203
132	NC_011371	GCG	2	6	8311	8316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552203
133	NC_011371	GGC	2	6	8332	8337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552203
134	NC_011371	GCC	2	6	8753	8758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552203
135	NC_011371	GCC	2	6	8788	8793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552204
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250	NC_011371	CTC	2	6	15313	15318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209552212
251	NC_011371	CTT	2	6	15385	15390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209552212
252	NC_011371	TTC	2	6	15446	15451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209552212
253	NC_011371	CCG	2	6	15486	15491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552212
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255	NC_011371	TCG	2	6	15533	15538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552212
256	NC_011371	GCA	2	6	15546	15551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552212
257	NC_011371	GGC	2	6	15559	15564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552212
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259	NC_011371	GCG	2	6	15579	15584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552212
260	NC_011371	GGC	2	6	15643	15648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552212
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263	NC_011371	CGG	2	6	15785	15790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552212
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