MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 plasmid pRLG203

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011370	ACGGA	2	10	11724	11733	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_011370	AACCA	2	10	42643	42652	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_011370	GCGGA	2	10	42688	42697	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4	NC_011370	CCTGC	2	10	50139	50148	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5	NC_011370	TAAAT	2	10	58211	58220	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011370	GTCAA	2	10	66159	66168	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_011370	ATTTC	2	10	66196	66205	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_011370	GTCAA	2	10	68671	68680	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_011370	CGAGG	2	10	79177	79186	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
10	NC_011370	GCGAG	2	10	79776	79785	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_011370	ATCCA	2	10	85931	85940	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_011370	GGCCT	2	10	87663	87672	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_011370	ACTTC	2	10	96144	96153	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_011370	GCTGG	2	10	98329	98338	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
15	NC_011370	GTCCG	2	10	98649	98658	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_011370	AGGGG	2	10	99242	99251	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011370	CGTTT	2	10	99290	99299	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_011370	ACGAG	2	10	99795	99804	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_011370	AAACG	2	10	104655	104664	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_011370	GCGCT	2	10	108323	108332	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_011370	CCCTT	2	10	120072	120081	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
22	NC_011370	AGAGA	2	10	121730	121739	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011370	AGGGG	2	10	124494	124503	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011370	CACGG	2	10	126464	126473	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_011370	CTCCG	2	10	141395	141404	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
26	NC_011370	GCTTC	2	10	141760	141769	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_011370	AAACG	2	10	172111	172120	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_011370	AGATC	2	10	175216	175225	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_011370	CGAGT	2	10	180539	180548	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_011370	TGCCT	2	10	181222	181231	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_011370	CATTC	2	10	183147	183156	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_011370	CCGGG	2	10	184502	184511	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
33	NC_011370	CCATC	2	10	189827	189836	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
34	NC_011370	AAGAC	2	10	205601	205610	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_011370	GGCGC	2	10	213077	213086	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
36	NC_011370	GGGCG	2	10	213119	213128	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
37	NC_011370	CGCGC	2	10	222810	222819	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
38	NC_011370	GCGCT	2	10	223976	223985	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_011370	TACGG	2	10	224418	224427	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_011370	GCGAA	2	10	227500	227509	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_011370	CGGTC	2	10	237828	237837	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_011370	GCTTG	2	10	245175	245184	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_011370	ATCCA	2	10	246589	246598	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_011370	GGATC	2	10	296574	296583	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_011370	CCGGT	2	10	299190	299199	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_011370	TCCCT	2	10	302812	302821	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
47	NC_011370	CCACG	2	10	303204	303213	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.