MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 plasmid pRLG203

Total Repeats: 154

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011370	ATTC	2	8	1144	1151	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011370	TCAC	2	8	11671	11678	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_011370	GAGG	2	8	15658	15665	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011370	GGCT	2	8	22541	22548	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011370	TCTG	2	8	22642	22649	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_011370	CAAA	2	8	22718	22725	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_011370	CGGG	2	8	23827	23834	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8	NC_011370	TGCG	2	8	32681	32688	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011370	AAAG	2	8	32747	32754	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011370	TGAC	2	8	32794	32801	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_011370	CGGG	2	8	33271	33278	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011370	CCCG	2	8	33287	33294	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13	NC_011370	TGCG	2	8	35462	35469	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_011370	TTCC	2	8	38943	38950	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_011370	CTCG	2	8	42777	42784	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_011370	TCGT	2	8	45826	45833	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011370	GCCG	2	8	45931	45938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_011370	AGCC	2	8	46081	46088	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_011370	CGAT	2	8	52158	52165	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_011370	ACCG	2	8	54789	54796	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_011370	TCGA	2	8	56273	56280	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_011370	CTGG	2	8	57832	57839	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_011370	TCGA	2	8	57869	57876	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_011370	TCGG	2	8	57917	57924	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_011370	CTTC	2	8	57933	57940	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_011370	TTTA	2	8	58285	58292	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011370	ATGG	2	8	58305	58312	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011370	TTTC	2	8	60380	60387	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_011370	TCCG	2	8	66218	66225	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_011370	GCTG	2	8	68625	68632	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_011370	AGGG	2	8	68710	68717	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011370	GCAG	2	8	68764	68771	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_011370	CGGC	2	8	78355	78362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_011370	TTTG	2	8	80082	80089	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011370	CATC	2	8	86345	86352	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_011370	CGGC	2	8	86749	86756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_011370	GTTA	2	8	87166	87173	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011370	CCAC	2	8	87286	87293	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
39	NC_011370	CGGT	2	8	87460	87467	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_011370	TCAA	2	8	87534	87541	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_011370	TCGA	2	8	88011	88018	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_011370	TTGA	2	8	88340	88347	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011370	AAAG	2	8	98118	98125	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011370	GTGG	2	8	98474	98481	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011370	CGCC	2	8	99175	99182	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
46	NC_011370	GGTA	2	8	99313	99320	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011370	TTCG	2	8	99494	99501	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_011370	TCAG	2	8	107597	107604	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_011370	TTCT	2	8	107705	107712	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_011370	CGAG	2	8	107793	107800	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_011370	CGCA	2	8	107868	107875	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_011370	ACAG	2	8	108078	108085	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_011370	GTAT	2	8	108139	108146	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011370	GCCG	2	8	111927	111934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_011370	TGCC	2	8	120161	120168	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_011370	TGAC	2	8	121934	121941	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_011370	CGGC	2	8	125233	125240	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_011370	CTCC	2	8	126892	126899	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
59	NC_011370	GGGA	2	8	127256	127263	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011370	CCGG	2	8	127362	127369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_011370	GTTT	2	8	130303	130310	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011370	TCCC	2	8	131917	131924	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
63	NC_011370	GTCG	2	8	137592	137599	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_011370	CCCT	2	8	137660	137667	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
65	NC_011370	GGCC	2	8	139586	139593	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_011370	GATC	2	8	139610	139617	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_011370	GTCG	2	8	139663	139670	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_011370	CCGA	2	8	139731	139738	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_011370	GCCC	2	8	141285	141292	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
70	NC_011370	GTCC	2	8	141332	141339	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_011370	TCGA	2	8	141970	141977	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_011370	AGGA	2	8	142067	142074	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011370	GATT	2	8	142115	142122	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011370	CCCG	2	8	143185	143192	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
75	NC_011370	CAAA	2	8	143232	143239	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_011370	TCGC	2	8	143331	143338	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_011370	ATGC	2	8	144224	144231	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_011370	GGAT	2	8	144290	144297	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011370	TAAT	2	8	162417	162424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011370	TGAT	2	8	162651	162658	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011370	GCCG	2	8	163752	163759	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_011370	CAGG	2	8	164147	164154	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_011370	GCGG	2	8	170453	170460	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
84	NC_011370	GCCA	2	8	176773	176780	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_011370	CCGA	2	8	176816	176823	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_011370	AGGG	2	8	176849	176856	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011370	AGGG	2	8	180414	180421	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011370	CGAT	2	8	180558	180565	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_011370	CGAA	2	8	181654	181661	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_011370	CAAT	2	8	181814	181821	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_011370	CATC	2	8	181844	181851	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_011370	GCTG	2	8	183115	183122	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_011370	CTGG	2	8	183301	183308	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_011370	TCCC	2	8	205507	205514	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
95	NC_011370	CTTT	2	8	206544	206551	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_011370	CAAA	2	8	209855	209862	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_011370	AGCG	2	8	210850	210857	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_011370	AAGC	2	8	210871	210878	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_011370	CCAC	2	8	222420	222427	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
100	NC_011370	GCCC	2	8	222748	222755	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
101	NC_011370	AAAG	2	8	222795	222802	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011370	GCGA	2	8	222936	222943	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_011370	GTTT	2	8	223522	223529	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011370	CTGG	2	8	223684	223691	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_011370	GAGC	2	8	223912	223919	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_011370	TTCG	2	8	224699	224706	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_011370	GCAA	2	8	226650	226657	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_011370	TTAA	2	8	227329	227336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011370	TCGG	2	8	227546	227553	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_011370	CTCG	2	8	228827	228834	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_011370	GGTC	2	8	229068	229075	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_011370	CATC	2	8	230777	230784	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_011370	TTGT	2	8	232797	232804	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011370	TTCT	2	8	232964	232971	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_011370	GGGC	2	8	233018	233025	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
116	NC_011370	GCTA	2	8	233329	233336	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_011370	GAAA	2	8	237716	237723	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011370	GTAT	2	8	237785	237792	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011370	ACGG	2	8	238138	238145	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_011370	GTAT	2	8	240021	240028	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011370	CGGG	2	8	242414	242421	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
122	NC_011370	TCTG	2	8	245099	245106	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_011370	TAGC	2	8	249136	249143	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_011370	GATT	2	8	253811	253818	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011370	GAAT	2	8	255817	255824	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011370	ATAA	2	8	255863	255870	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011370	CGTC	2	8	264926	264933	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_011370	CAGC	2	8	264979	264986	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_011370	CCTG	2	8	264987	264994	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_011370	CAGG	2	8	265351	265358	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_011370	CCTC	2	8	266478	266485	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
132	NC_011370	GAGT	2	8	266538	266545	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011370	GCCC	2	8	266746	266753	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
134	NC_011370	TCGC	2	8	276660	276667	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_011370	TATT	2	8	279631	279638	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011370	GGGT	2	8	283675	283682	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011370	ACGC	2	8	283983	283990	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_011370	CGGA	2	8	284906	284913	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_011370	GCCG	2	8	285865	285872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_011370	AACC	2	8	285902	285909	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_011370	CAGT	2	8	287567	287574	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_011370	TTCC	2	8	290268	290275	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_011370	GGTT	2	8	292824	292831	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011370	CCTT	2	8	298789	298796	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_011370	AACT	2	8	298805	298812	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_011370	TATT	2	8	298839	298846	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011370	TCCG	2	8	298849	298856	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_011370	TCCA	2	8	299017	299024	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_011370	CGGT	2	8	301646	301653	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_011370	GCCG	2	8	301955	301962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_011370	ATCG	2	8	302121	302128	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_011370	GCCG	2	8	302503	302510	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_011370	CTGT	2	8	302632	302639	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
154	NC_011370	CAAT	2	8	304823	304830	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.