MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 plasmid pRLG203

Total Repeats: 141

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011370	A	7	7	3189	3195	100 %	0 %	0 %	0 %	209551942
2	NC_011370	T	6	6	13203	13208	0 %	100 %	0 %	0 %	209551952
3	NC_011370	T	8	8	13487	13494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011370	A	6	6	14570	14575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011370	T	6	6	15500	15505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011370	T	6	6	16403	16408	0 %	100 %	0 %	0 %	209551956
7	NC_011370	T	6	6	17942	17947	0 %	100 %	0 %	0 %	209551958
8	NC_011370	G	6	6	32085	32090	0 %	0 %	100 %	0 %	209551969
9	NC_011370	T	6	6	34965	34970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011370	A	6	6	38561	38566	100 %	0 %	0 %	0 %	209551974
11	NC_011370	A	6	6	42300	42305	100 %	0 %	0 %	0 %	209551977
12	NC_011370	A	6	6	43918	43923	100 %	0 %	0 %	0 %	209551978
13	NC_011370	T	7	7	44523	44529	0 %	100 %	0 %	0 %	209551979
14	NC_011370	A	7	7	45645	45651	100 %	0 %	0 %	0 %	209551979
15	NC_011370	A	6	6	45688	45693	100 %	0 %	0 %	0 %	209551979
16	NC_011370	C	8	8	50741	50748	0 %	0 %	0 %	100 %	209551981
17	NC_011370	C	6	6	50801	50806	0 %	0 %	0 %	100 %	209551981
18	NC_011370	C	6	6	51472	51477	0 %	0 %	0 %	100 %	209551981
19	NC_011370	G	6	6	54896	54901	0 %	0 %	100 %	0 %	209551984
20	NC_011370	T	6	6	55539	55544	0 %	100 %	0 %	0 %	209551984
21	NC_011370	A	6	6	56549	56554	100 %	0 %	0 %	0 %	209551985
22	NC_011370	C	6	6	60576	60581	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
23	NC_011370	C	6	6	62170	62175	0 %	0 %	0 %	100 %	209551988
24	NC_011370	T	6	6	72356	72361	0 %	100 %	0 %	0 %	209551996
25	NC_011370	A	6	6	75161	75166	100 %	0 %	0 %	0 %	209551998
26	NC_011370	A	7	7	75940	75946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011370	A	6	6	76036	76041	100 %	0 %	0 %	0 %	209551999
28	NC_011370	G	6	6	76539	76544	0 %	0 %	100 %	0 %	209551999
29	NC_011370	T	6	6	76963	76968	0 %	100 %	0 %	0 %	209551999
30	NC_011370	T	6	6	79048	79053	0 %	100 %	0 %	0 %	209552001
31	NC_011370	T	7	7	80666	80672	0 %	100 %	0 %	0 %	209552003
32	NC_011370	A	6	6	87812	87817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011370	T	6	6	88362	88367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011370	T	8	8	92042	92049	0 %	100 %	0 %	0 %	209552012
35	NC_011370	T	6	6	92068	92073	0 %	100 %	0 %	0 %	209552012
36	NC_011370	A	6	6	94558	94563	100 %	0 %	0 %	0 %	209552012
37	NC_011370	C	6	6	97413	97418	0 %	0 %	0 %	100 %	209552016
38	NC_011370	A	6	6	98395	98400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011370	T	6	6	100030	100035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011370	T	6	6	114996	115001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011370	A	6	6	115046	115051	100 %	0 %	0 %	0 %	209552029
42	NC_011370	A	6	6	116544	116549	100 %	0 %	0 %	0 %	209552030
43	NC_011370	A	6	6	118450	118455	100 %	0 %	0 %	0 %	209552032
44	NC_011370	G	7	7	119630	119636	0 %	0 %	100 %	0 %	209552032
45	NC_011370	A	6	6	121680	121685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011370	G	6	6	123488	123493	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011370	G	6	6	145501	145506	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011370	T	6	6	146368	146373	0 %	100 %	0 %	0 %	209552055
49	NC_011370	T	6	6	146956	146961	0 %	100 %	0 %	0 %	209552055
50	NC_011370	T	7	7	149969	149975	0 %	100 %	0 %	0 %	209552058
51	NC_011370	G	6	6	151844	151849	0 %	0 %	100 %	0 %	209552060
52	NC_011370	G	6	6	152637	152642	0 %	0 %	100 %	0 %	209552062
53	NC_011370	T	7	7	157649	157655	0 %	100 %	0 %	0 %	209552067
54	NC_011370	T	7	7	160295	160301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011370	A	7	7	162217	162223	100 %	0 %	0 %	0 %	209552070
56	NC_011370	T	6	6	163881	163886	0 %	100 %	0 %	0 %	209552073
57	NC_011370	T	6	6	166322	166327	0 %	100 %	0 %	0 %	209552077
58	NC_011370	C	6	6	166691	166696	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
59	NC_011370	A	6	6	167151	167156	100 %	0 %	0 %	0 %	209552078
60	NC_011370	A	6	6	170291	170296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011370	A	6	6	170437	170442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011370	A	6	6	171446	171451	100 %	0 %	0 %	0 %	209552083
63	NC_011370	T	6	6	172153	172158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011370	C	6	6	172854	172859	0 %	0 %	0 %	100 %	209552084
65	NC_011370	G	6	6	174816	174821	0 %	0 %	100 %	0 %	209552085
66	NC_011370	A	6	6	180107	180112	100 %	0 %	0 %	0 %	209552089
67	NC_011370	A	6	6	182327	182332	100 %	0 %	0 %	0 %	209552091
68	NC_011370	G	6	6	182880	182885	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011370	T	6	6	184021	184026	0 %	100 %	0 %	0 %	209552092
70	NC_011370	T	8	8	190146	190153	0 %	100 %	0 %	0 %	209552098
71	NC_011370	A	6	6	190200	190205	100 %	0 %	0 %	0 %	209552098
72	NC_011370	A	6	6	190224	190229	100 %	0 %	0 %	0 %	209552098
73	NC_011370	A	6	6	190780	190785	100 %	0 %	0 %	0 %	209552098
74	NC_011370	A	6	6	193932	193937	100 %	0 %	0 %	0 %	209552101
75	NC_011370	T	6	6	195097	195102	0 %	100 %	0 %	0 %	209552102
76	NC_011370	C	6	6	195992	195997	0 %	0 %	0 %	100 %	209552102
77	NC_011370	T	6	6	197374	197379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011370	T	6	6	197626	197631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011370	T	6	6	201508	201513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011370	G	6	6	203381	203386	0 %	0 %	100 %	0 %	209552109
81	NC_011370	G	7	7	204831	204837	0 %	0 %	100 %	0 %	209552110
82	NC_011370	A	6	6	209866	209871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011370	G	6	6	212409	212414	0 %	0 %	100 %	0 %	209552117
84	NC_011370	C	6	6	213511	213516	0 %	0 %	0 %	100 %	209552118
85	NC_011370	A	6	6	213997	214002	100 %	0 %	0 %	0 %	209552118
86	NC_011370	C	6	6	214038	214043	0 %	0 %	0 %	100 %	209552118
87	NC_011370	A	7	7	214378	214384	100 %	0 %	0 %	0 %	209552118
88	NC_011370	T	7	7	221479	221485	0 %	100 %	0 %	0 %	209552123
89	NC_011370	A	6	6	222095	222100	100 %	0 %	0 %	0 %	209552123
90	NC_011370	G	6	6	223564	223569	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011370	T	7	7	224822	224828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011370	A	8	8	224959	224966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011370	A	7	7	227335	227341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011370	A	7	7	228992	228998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011370	G	7	7	231062	231068	0 %	0 %	100 %	0 %	209552128
96	NC_011370	G	7	7	232630	232636	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011370	G	6	6	234392	234397	0 %	0 %	100 %	0 %	209552130
98	NC_011370	T	6	6	234561	234566	0 %	100 %	0 %	0 %	209552130
99	NC_011370	A	6	6	236499	236504	100 %	0 %	0 %	0 %	209552131
100	NC_011370	T	6	6	237393	237398	0 %	100 %	0 %	0 %	209552132
101	NC_011370	A	7	7	237547	237553	100 %	0 %	0 %	0 %	209552132
102	NC_011370	T	7	7	238998	239004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011370	T	6	6	240109	240114	0 %	100 %	0 %	0 %	209552135
104	NC_011370	A	6	6	241241	241246	100 %	0 %	0 %	0 %	209552136
105	NC_011370	C	6	6	244611	244616	0 %	0 %	0 %	100 %	209552139
106	NC_011370	T	8	8	246755	246762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011370	T	6	6	249441	249446	0 %	100 %	0 %	0 %	209552144
108	NC_011370	A	6	6	255410	255415	100 %	0 %	0 %	0 %	209552148
109	NC_011370	C	6	6	256203	256208	0 %	0 %	0 %	100 %	209552149
110	NC_011370	C	6	6	256217	256222	0 %	0 %	0 %	100 %	209552149
111	NC_011370	T	6	6	256390	256395	0 %	100 %	0 %	0 %	209552149
112	NC_011370	T	6	6	257943	257948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011370	T	6	6	258424	258429	0 %	100 %	0 %	0 %	209552152
114	NC_011370	T	7	7	260493	260499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011370	G	6	6	261707	261712	0 %	0 %	100 %	0 %	209552155
116	NC_011370	T	6	6	262956	262961	0 %	100 %	0 %	0 %	209552156
117	NC_011370	C	6	6	263465	263470	0 %	0 %	0 %	100 %	209552156
118	NC_011370	C	6	6	265125	265130	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
119	NC_011370	T	6	6	266799	266804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011370	C	6	6	268379	268384	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
121	NC_011370	C	6	6	269606	269611	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
122	NC_011370	A	7	7	270102	270108	100 %	0 %	0 %	0 %	209552162
123	NC_011370	T	6	6	272515	272520	0 %	100 %	0 %	0 %	209552164
124	NC_011370	T	6	6	272563	272568	0 %	100 %	0 %	0 %	209552164
125	NC_011370	T	6	6	274890	274895	0 %	100 %	0 %	0 %	209552166
126	NC_011370	G	7	7	281631	281637	0 %	0 %	100 %	0 %	209552171
127	NC_011370	C	6	6	283051	283056	0 %	0 %	0 %	100 %	209552172
128	NC_011370	A	6	6	283521	283526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011370	A	6	6	284393	284398	100 %	0 %	0 %	0 %	209552174
130	NC_011370	T	6	6	289051	289056	0 %	100 %	0 %	0 %	209552178
131	NC_011370	T	6	6	289119	289124	0 %	100 %	0 %	0 %	209552178
132	NC_011370	C	6	6	289171	289176	0 %	0 %	0 %	100 %	209552178
133	NC_011370	A	7	7	293474	293480	100 %	0 %	0 %	0 %	209552183
134	NC_011370	T	6	6	294962	294967	0 %	100 %	0 %	0 %	209552185
135	NC_011370	T	6	6	294980	294985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011370	T	6	6	298202	298207	0 %	100 %	0 %	0 %	209552188
137	NC_011370	G	6	6	301546	301551	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011370	T	6	6	301628	301633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011370	G	6	6	303849	303854	0 %	0 %	100 %	0 %	209552191
140	NC_011370	A	6	6	305241	305246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011370	T	7	7	306707	306713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.