MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 chromosome

Total Repeats: 3308

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011369	GGGTG	2	10	2872	2881	0 %	20 %	80 %	0 %	209547614
2	NC_011369	AGCCG	2	10	3702	3711	20 %	0 %	40 %	40 %	209547615
3	NC_011369	GTGCG	2	10	4959	4968	0 %	20 %	60 %	20 %	209547616
4	NC_011369	CATCG	2	10	5488	5497	20 %	20 %	20 %	40 %	209547617
5	NC_011369	GTCCG	2	10	11946	11955	0 %	20 %	40 %	40 %	209547625
6	NC_011369	TCGGA	2	10	12969	12978	20 %	20 %	40 %	20 %	209547626
7	NC_011369	AGAGG	2	10	13018	13027	40 %	0 %	60 %	0 %	209547626
8	NC_011369	CCGCG	2	10	17326	17335	0 %	0 %	40 %	60 %	209547630
9	NC_011369	GCTGA	2	10	17531	17540	20 %	20 %	40 %	20 %	209547630
10	NC_011369	GCGCC	2	10	17636	17645	0 %	0 %	40 %	60 %	209547630
11	NC_011369	GAGCA	2	10	19927	19936	40 %	0 %	40 %	20 %	209547632
12	NC_011369	GAAAT	2	10	22309	22318	60 %	20 %	20 %	0 %	209547636
13	NC_011369	GCCGT	2	10	22411	22420	0 %	20 %	40 %	40 %	209547636
14	NC_011369	TTCTC	2	10	23161	23170	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_011369	GTCAT	2	10	24779	24788	20 %	40 %	20 %	20 %	209547639
16	NC_011369	GCCTG	2	10	27921	27930	0 %	20 %	40 %	40 %	209547642
17	NC_011369	GTGGC	2	10	29607	29616	0 %	20 %	60 %	20 %	209547642
18	NC_011369	ATCGA	2	10	32188	32197	40 %	20 %	20 %	20 %	209547644
19	NC_011369	CCGGC	2	10	33445	33454	0 %	0 %	40 %	60 %	209547645
20	NC_011369	ACGGC	2	10	33612	33621	20 %	0 %	40 %	40 %	209547645
21	NC_011369	AAGGC	2	10	33672	33681	40 %	0 %	40 %	20 %	209547645
22	NC_011369	TCGAT	2	10	33708	33717	20 %	40 %	20 %	20 %	209547645
23	NC_011369	CGATC	2	10	34666	34675	20 %	20 %	20 %	40 %	209547645
24	NC_011369	GTTCG	2	10	35922	35931	0 %	40 %	40 %	20 %	209547646
25	NC_011369	CGGGC	2	10	38184	38193	0 %	0 %	60 %	40 %	209547648
26	NC_011369	GATCG	2	10	38296	38305	20 %	20 %	40 %	20 %	209547648
27	NC_011369	GCGCT	2	10	38498	38507	0 %	20 %	40 %	40 %	209547648
28	NC_011369	GTCAC	2	10	39545	39554	20 %	20 %	20 %	40 %	209547648
29	NC_011369	GCGGG	2	10	40734	40743	0 %	0 %	80 %	20 %	209547649
30	NC_011369	AGGCC	2	10	45783	45792	20 %	0 %	40 %	40 %	209547656
31	NC_011369	GCGCG	2	10	49176	49185	0 %	0 %	60 %	40 %	209547660
32	NC_011369	AGCCG	2	10	52467	52476	20 %	0 %	40 %	40 %	209547664
33	NC_011369	ACCGA	2	10	53632	53641	40 %	0 %	20 %	40 %	209547664
34	NC_011369	GCCGC	2	10	57698	57707	0 %	0 %	40 %	60 %	209547667
35	NC_011369	CAGCG	2	10	58180	58189	20 %	0 %	40 %	40 %	209547668
36	NC_011369	AAAGC	2	10	60965	60974	60 %	0 %	20 %	20 %	209547672
37	NC_011369	CGGCC	2	10	61482	61491	0 %	0 %	40 %	60 %	209547673
38	NC_011369	GCGCC	2	10	66498	66507	0 %	0 %	40 %	60 %	209547678
39	NC_011369	CGGCA	2	10	66569	66578	20 %	0 %	40 %	40 %	209547678
40	NC_011369	GAAGA	2	10	67189	67198	60 %	0 %	40 %	0 %	209547678
41	NC_011369	TCGAT	2	10	71642	71651	20 %	40 %	20 %	20 %	209547683
42	NC_011369	ATGAG	2	10	72012	72021	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011369	CCGGT	2	10	73244	73253	0 %	20 %	40 %	40 %	209547685
44	NC_011369	CAGCG	2	10	74289	74298	20 %	0 %	40 %	40 %	209547687
45	NC_011369	ATGTA	2	10	76452	76461	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011369	GATCA	2	10	81459	81468	40 %	20 %	20 %	20 %	209547695
47	NC_011369	TCGCC	2	10	82138	82147	0 %	20 %	20 %	60 %	209547695
48	NC_011369	ACCTC	2	10	83338	83347	20 %	20 %	0 %	60 %	209547696
49	NC_011369	CATCC	2	10	85967	85976	20 %	20 %	0 %	60 %	209547700
50	NC_011369	GACAT	2	10	86649	86658	40 %	20 %	20 %	20 %	209547701
51	NC_011369	GCCGC	2	10	87924	87933	0 %	0 %	40 %	60 %	209547704
52	NC_011369	ATACC	2	10	87940	87949	40 %	20 %	0 %	40 %	209547704
53	NC_011369	CCGCA	2	10	88345	88354	20 %	0 %	20 %	60 %	209547704
54	NC_011369	GGCGA	2	10	91884	91893	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
55	NC_011369	CGAGG	2	10	93804	93813	20 %	0 %	60 %	20 %	209547710
56	NC_011369	CTTTT	2	10	98166	98175	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_011369	CCTCG	2	10	99010	99019	0 %	20 %	20 %	60 %	209547716
58	NC_011369	CGGTG	2	10	100383	100392	0 %	20 %	60 %	20 %	209547717
59	NC_011369	GTCGC	2	10	101077	101086	0 %	20 %	40 %	40 %	209547718
60	NC_011369	GGCCG	2	10	101758	101767	0 %	0 %	60 %	40 %	209547718
61	NC_011369	CTGTC	2	10	102946	102955	0 %	40 %	20 %	40 %	209547721
62	NC_011369	GTATT	2	10	107545	107554	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011369	ACCGG	2	10	109917	109926	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
64	NC_011369	CGGCG	2	10	112605	112614	0 %	0 %	60 %	40 %	209547731
65	NC_011369	GCCGG	2	10	113052	113061	0 %	0 %	60 %	40 %	209547732
66	NC_011369	GCGAT	2	10	114392	114401	20 %	20 %	40 %	20 %	209547733
67	NC_011369	GCGCA	2	10	115233	115242	20 %	0 %	40 %	40 %	209547733
68	NC_011369	GGTGC	2	10	116794	116803	0 %	20 %	60 %	20 %	209547735
69	NC_011369	GCTCG	2	10	120003	120012	0 %	20 %	40 %	40 %	209547738
70	NC_011369	CATCG	2	10	120782	120791	20 %	20 %	20 %	40 %	209547739
71	NC_011369	GGCCT	2	10	122822	122831	0 %	20 %	40 %	40 %	209547741
72	NC_011369	GCGGG	2	10	123574	123583	0 %	0 %	80 %	20 %	209547741
73	NC_011369	CCTTC	2	10	128838	128847	0 %	40 %	0 %	60 %	209547747
74	NC_011369	GCGGT	2	10	133188	133197	0 %	20 %	60 %	20 %	209547749
75	NC_011369	CGAGT	2	10	134965	134974	20 %	20 %	40 %	20 %	209547751
76	NC_011369	CAGGC	2	10	136750	136759	20 %	0 %	40 %	40 %	209547751
77	NC_011369	TCGCC	2	10	138091	138100	0 %	20 %	20 %	60 %	209547754
78	NC_011369	ATCAA	2	10	140120	140129	60 %	20 %	0 %	20 %	209547755
79	NC_011369	GAATG	2	10	142209	142218	40 %	20 %	40 %	0 %	209547757
80	NC_011369	CGGCG	2	10	145909	145918	0 %	0 %	60 %	40 %	209547760
81	NC_011369	TCGCT	2	10	146083	146092	0 %	40 %	20 %	40 %	209547761
82	NC_011369	TGAGC	2	10	147131	147140	20 %	20 %	40 %	20 %	209547761
83	NC_011369	TGATC	2	10	148156	148165	20 %	40 %	20 %	20 %	209547762
84	NC_011369	GGCGC	2	10	148685	148694	0 %	0 %	60 %	40 %	209547762
85	NC_011369	CGGCG	2	10	149568	149577	0 %	0 %	60 %	40 %	209547764
86	NC_011369	TCAGA	2	10	150439	150448	40 %	20 %	20 %	20 %	209547765
87	NC_011369	CGGCG	2	10	151253	151262	0 %	0 %	60 %	40 %	209547765
88	NC_011369	CGGCG	2	10	151610	151619	0 %	0 %	60 %	40 %	209547765
89	NC_011369	CGCAT	2	10	154612	154621	20 %	20 %	20 %	40 %	209547768
90	NC_011369	CTTGC	2	10	155785	155794	0 %	40 %	20 %	40 %	209547769
91	NC_011369	CGTTC	2	10	159898	159907	0 %	40 %	20 %	40 %	209547772
92	NC_011369	CGCCC	2	10	164570	164579	0 %	0 %	20 %	80 %	209547775
93	NC_011369	AAATC	2	10	164906	164915	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_011369	TCCTT	2	10	165598	165607	0 %	60 %	0 %	40 %	209547776
95	NC_011369	CGGCG	2	10	167737	167746	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
96	NC_011369	GCATT	2	10	167998	168007	20 %	40 %	20 %	20 %	209547778
97	NC_011369	CGCGC	2	10	168429	168438	0 %	0 %	40 %	60 %	209547778
98	NC_011369	CTGCC	2	10	170542	170551	0 %	20 %	20 %	60 %	209547779
99	NC_011369	TGGCC	2	10	171104	171113	0 %	20 %	40 %	40 %	209547780
100	NC_011369	ACACG	2	10	171999	172008	40 %	0 %	20 %	40 %	209547781
101	NC_011369	GCCGC	2	10	174349	174358	0 %	0 %	40 %	60 %	209547784
102	NC_011369	CGACG	2	10	174861	174870	20 %	0 %	40 %	40 %	209547784
103	NC_011369	CCGCG	2	10	175383	175392	0 %	0 %	40 %	60 %	209547784
104	NC_011369	CGGAT	2	10	178942	178951	20 %	20 %	40 %	20 %	209547788
105	NC_011369	GATGC	2	10	179348	179357	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_011369	TGCTC	2	10	179717	179726	0 %	40 %	20 %	40 %	209547789
107	NC_011369	GGCCG	2	10	179832	179841	0 %	0 %	60 %	40 %	209547789
108	NC_011369	AGGTC	2	10	182008	182017	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_011369	CGTGA	2	10	182566	182575	20 %	20 %	40 %	20 %	209547791
110	NC_011369	GAGAA	2	10	182918	182927	60 %	0 %	40 %	0 %	209547791
111	NC_011369	ACGAT	2	10	184177	184186	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_011369	GGTGG	2	10	184877	184886	0 %	20 %	80 %	0 %	209547793
113	NC_011369	ATCGA	2	10	185558	185567	40 %	20 %	20 %	20 %	209547794
114	NC_011369	GCGAG	2	10	186174	186183	20 %	0 %	60 %	20 %	209547794
115	NC_011369	TGCTC	2	10	186714	186723	0 %	40 %	20 %	40 %	209547794
116	NC_011369	GCGCT	2	10	188563	188572	0 %	20 %	40 %	40 %	209547796
117	NC_011369	AGCGC	2	10	190981	190990	20 %	0 %	40 %	40 %	209547799
118	NC_011369	GCGCA	2	10	191141	191150	20 %	0 %	40 %	40 %	209547799
119	NC_011369	ATCAG	2	10	191288	191297	40 %	20 %	20 %	20 %	209547800
120	NC_011369	ATCGC	2	10	192608	192617	20 %	20 %	20 %	40 %	209547802
121	NC_011369	TCGCC	2	10	195692	195701	0 %	20 %	20 %	60 %	209547806
122	NC_011369	GCCTT	2	10	196880	196889	0 %	40 %	20 %	40 %	209547807
123	NC_011369	CACCC	2	10	197741	197750	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
124	NC_011369	CACCC	2	10	198207	198216	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
125	NC_011369	CCTGC	2	10	199452	199461	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
126	NC_011369	GATCT	2	10	202456	202465	20 %	40 %	20 %	20 %	209547811
127	NC_011369	CTGCC	2	10	203524	203533	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
128	NC_011369	GGCAG	2	10	203675	203684	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
129	NC_011369	ACGCT	2	10	205413	205422	20 %	20 %	20 %	40 %	209547815
130	NC_011369	GATCG	2	10	205665	205674	20 %	20 %	40 %	20 %	209547815
131	NC_011369	TGCGG	2	10	211882	211891	0 %	20 %	60 %	20 %	209547818
132	NC_011369	GGCGC	2	10	211892	211901	0 %	0 %	60 %	40 %	209547818
133	NC_011369	GCCGC	2	10	214397	214406	0 %	0 %	40 %	60 %	209547821
134	NC_011369	CCGAT	2	10	215700	215709	20 %	20 %	20 %	40 %	209547822
135	NC_011369	GCCGC	2	10	216072	216081	0 %	0 %	40 %	60 %	209547822
136	NC_011369	CACGA	2	10	217720	217729	40 %	0 %	20 %	40 %	209547823
137	NC_011369	CGCAG	2	10	218260	218269	20 %	0 %	40 %	40 %	209547824
138	NC_011369	CTGCC	2	10	220578	220587	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
139	NC_011369	GGCAG	2	10	220728	220737	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
140	NC_011369	GGCAG	2	10	221536	221545	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
141	NC_011369	GCCGA	2	10	221777	221786	20 %	0 %	40 %	40 %	209547827
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145	NC_011369	TCGTC	2	10	225645	225654	0 %	40 %	20 %	40 %	209547830
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236	NC_011369	TGACT	2	10	358074	358083	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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244	NC_011369	GGATC	2	10	368046	368055	20 %	20 %	40 %	20 %	209547971
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247	NC_011369	TAATC	2	10	369440	369449	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
248	NC_011369	GTGCA	2	10	369467	369476	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
249	NC_011369	GAGCG	2	10	370014	370023	20 %	0 %	60 %	20 %	209547972
250	NC_011369	CGAGC	2	10	370305	370314	20 %	0 %	40 %	40 %	209547972
251	NC_011369	GCCTG	2	10	371159	371168	0 %	20 %	40 %	40 %	209547973
252	NC_011369	CGGAT	2	10	371169	371178	20 %	20 %	40 %	20 %	209547973
253	NC_011369	GTCGG	2	10	371905	371914	0 %	20 %	60 %	20 %	209547973
254	NC_011369	CGGCA	2	10	372669	372678	20 %	0 %	40 %	40 %	209547974
255	NC_011369	ACCGC	2	10	373402	373411	20 %	0 %	20 %	60 %	209547974
256	NC_011369	AGCGC	2	10	376231	376240	20 %	0 %	40 %	40 %	209547976
257	NC_011369	CAGAT	2	10	380754	380763	40 %	20 %	20 %	20 %	209547981
258	NC_011369	CCTGA	2	10	380816	380825	20 %	20 %	20 %	40 %	209547981
259	NC_011369	CCGGC	2	10	381256	381265	0 %	0 %	40 %	60 %	209547981
260	NC_011369	CGGAA	2	10	381786	381795	40 %	0 %	40 %	20 %	209547982
261	NC_011369	ATGGC	2	10	385974	385983	20 %	20 %	40 %	20 %	209547985
262	NC_011369	AATGC	2	10	389475	389484	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
263	NC_011369	GCTGA	2	10	396160	396169	20 %	20 %	40 %	20 %	209547990
264	NC_011369	GGCGA	2	10	396843	396852	20 %	0 %	60 %	20 %	209547991
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