MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 chromosome

Total Repeats: 2787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011369	GGGTG	2	10	2872	2881	0 %	20 %	80 %	0 %	209547614
2	NC_011369	AGCCG	2	10	3702	3711	20 %	0 %	40 %	40 %	209547615
3	NC_011369	GTGCG	2	10	4959	4968	0 %	20 %	60 %	20 %	209547616
4	NC_011369	CATCG	2	10	5488	5497	20 %	20 %	20 %	40 %	209547617
5	NC_011369	GTCCG	2	10	11946	11955	0 %	20 %	40 %	40 %	209547625
6	NC_011369	TCGGA	2	10	12969	12978	20 %	20 %	40 %	20 %	209547626
7	NC_011369	AGAGG	2	10	13018	13027	40 %	0 %	60 %	0 %	209547626
8	NC_011369	CCGCG	2	10	17326	17335	0 %	0 %	40 %	60 %	209547630
9	NC_011369	GCTGA	2	10	17531	17540	20 %	20 %	40 %	20 %	209547630
10	NC_011369	GCGCC	2	10	17636	17645	0 %	0 %	40 %	60 %	209547630
11	NC_011369	GAGCA	2	10	19927	19936	40 %	0 %	40 %	20 %	209547632
12	NC_011369	GAAAT	2	10	22309	22318	60 %	20 %	20 %	0 %	209547636
13	NC_011369	GCCGT	2	10	22411	22420	0 %	20 %	40 %	40 %	209547636
14	NC_011369	GTCAT	2	10	24779	24788	20 %	40 %	20 %	20 %	209547639
15	NC_011369	GCCTG	2	10	27921	27930	0 %	20 %	40 %	40 %	209547642
16	NC_011369	GTGGC	2	10	29607	29616	0 %	20 %	60 %	20 %	209547642
17	NC_011369	ATCGA	2	10	32188	32197	40 %	20 %	20 %	20 %	209547644
18	NC_011369	CCGGC	2	10	33445	33454	0 %	0 %	40 %	60 %	209547645
19	NC_011369	ACGGC	2	10	33612	33621	20 %	0 %	40 %	40 %	209547645
20	NC_011369	AAGGC	2	10	33672	33681	40 %	0 %	40 %	20 %	209547645
21	NC_011369	TCGAT	2	10	33708	33717	20 %	40 %	20 %	20 %	209547645
22	NC_011369	CGATC	2	10	34666	34675	20 %	20 %	20 %	40 %	209547645
23	NC_011369	GTTCG	2	10	35922	35931	0 %	40 %	40 %	20 %	209547646
24	NC_011369	CGGGC	2	10	38184	38193	0 %	0 %	60 %	40 %	209547648
25	NC_011369	GATCG	2	10	38296	38305	20 %	20 %	40 %	20 %	209547648
26	NC_011369	GCGCT	2	10	38498	38507	0 %	20 %	40 %	40 %	209547648
27	NC_011369	GTCAC	2	10	39545	39554	20 %	20 %	20 %	40 %	209547648
28	NC_011369	GCGGG	2	10	40734	40743	0 %	0 %	80 %	20 %	209547649
29	NC_011369	AGGCC	2	10	45783	45792	20 %	0 %	40 %	40 %	209547656
30	NC_011369	GCGCG	2	10	49176	49185	0 %	0 %	60 %	40 %	209547660
31	NC_011369	AGCCG	2	10	52467	52476	20 %	0 %	40 %	40 %	209547664
32	NC_011369	ACCGA	2	10	53632	53641	40 %	0 %	20 %	40 %	209547664
33	NC_011369	GCCGC	2	10	57698	57707	0 %	0 %	40 %	60 %	209547667
34	NC_011369	CAGCG	2	10	58180	58189	20 %	0 %	40 %	40 %	209547668
35	NC_011369	AAAGC	2	10	60965	60974	60 %	0 %	20 %	20 %	209547672
36	NC_011369	CGGCC	2	10	61482	61491	0 %	0 %	40 %	60 %	209547673
37	NC_011369	GCGCC	2	10	66498	66507	0 %	0 %	40 %	60 %	209547678
38	NC_011369	CGGCA	2	10	66569	66578	20 %	0 %	40 %	40 %	209547678
39	NC_011369	GAAGA	2	10	67189	67198	60 %	0 %	40 %	0 %	209547678
40	NC_011369	TCGAT	2	10	71642	71651	20 %	40 %	20 %	20 %	209547683
41	NC_011369	CCGGT	2	10	73244	73253	0 %	20 %	40 %	40 %	209547685
42	NC_011369	CAGCG	2	10	74289	74298	20 %	0 %	40 %	40 %	209547687
43	NC_011369	GATCA	2	10	81459	81468	40 %	20 %	20 %	20 %	209547695
44	NC_011369	TCGCC	2	10	82138	82147	0 %	20 %	20 %	60 %	209547695
45	NC_011369	ACCTC	2	10	83338	83347	20 %	20 %	0 %	60 %	209547696
46	NC_011369	CATCC	2	10	85967	85976	20 %	20 %	0 %	60 %	209547700
47	NC_011369	GACAT	2	10	86649	86658	40 %	20 %	20 %	20 %	209547701
48	NC_011369	GCCGC	2	10	87924	87933	0 %	0 %	40 %	60 %	209547704
49	NC_011369	ATACC	2	10	87940	87949	40 %	20 %	0 %	40 %	209547704
50	NC_011369	CCGCA	2	10	88345	88354	20 %	0 %	20 %	60 %	209547704
51	NC_011369	CGAGG	2	10	93804	93813	20 %	0 %	60 %	20 %	209547710
52	NC_011369	CCTCG	2	10	99010	99019	0 %	20 %	20 %	60 %	209547716
53	NC_011369	CGGTG	2	10	100383	100392	0 %	20 %	60 %	20 %	209547717
54	NC_011369	GTCGC	2	10	101077	101086	0 %	20 %	40 %	40 %	209547718
55	NC_011369	GGCCG	2	10	101758	101767	0 %	0 %	60 %	40 %	209547718
56	NC_011369	CTGTC	2	10	102946	102955	0 %	40 %	20 %	40 %	209547721
57	NC_011369	CGGCG	2	10	112605	112614	0 %	0 %	60 %	40 %	209547731
58	NC_011369	GCCGG	2	10	113052	113061	0 %	0 %	60 %	40 %	209547732
59	NC_011369	GCGAT	2	10	114392	114401	20 %	20 %	40 %	20 %	209547733
60	NC_011369	GCGCA	2	10	115233	115242	20 %	0 %	40 %	40 %	209547733
61	NC_011369	GGTGC	2	10	116794	116803	0 %	20 %	60 %	20 %	209547735
62	NC_011369	GCTCG	2	10	120003	120012	0 %	20 %	40 %	40 %	209547738
63	NC_011369	CATCG	2	10	120782	120791	20 %	20 %	20 %	40 %	209547739
64	NC_011369	GGCCT	2	10	122822	122831	0 %	20 %	40 %	40 %	209547741
65	NC_011369	GCGGG	2	10	123574	123583	0 %	0 %	80 %	20 %	209547741
66	NC_011369	CCTTC	2	10	128838	128847	0 %	40 %	0 %	60 %	209547747
67	NC_011369	GCGGT	2	10	133188	133197	0 %	20 %	60 %	20 %	209547749
68	NC_011369	CGAGT	2	10	134965	134974	20 %	20 %	40 %	20 %	209547751
69	NC_011369	CAGGC	2	10	136750	136759	20 %	0 %	40 %	40 %	209547751
70	NC_011369	TCGCC	2	10	138091	138100	0 %	20 %	20 %	60 %	209547754
71	NC_011369	ATCAA	2	10	140120	140129	60 %	20 %	0 %	20 %	209547755
72	NC_011369	GAATG	2	10	142209	142218	40 %	20 %	40 %	0 %	209547757
73	NC_011369	CGGCG	2	10	145909	145918	0 %	0 %	60 %	40 %	209547760
74	NC_011369	TCGCT	2	10	146083	146092	0 %	40 %	20 %	40 %	209547761
75	NC_011369	TGAGC	2	10	147131	147140	20 %	20 %	40 %	20 %	209547761
76	NC_011369	TGATC	2	10	148156	148165	20 %	40 %	20 %	20 %	209547762
77	NC_011369	GGCGC	2	10	148685	148694	0 %	0 %	60 %	40 %	209547762
78	NC_011369	CGGCG	2	10	149568	149577	0 %	0 %	60 %	40 %	209547764
79	NC_011369	TCAGA	2	10	150439	150448	40 %	20 %	20 %	20 %	209547765
80	NC_011369	CGGCG	2	10	151253	151262	0 %	0 %	60 %	40 %	209547765
81	NC_011369	CGGCG	2	10	151610	151619	0 %	0 %	60 %	40 %	209547765
82	NC_011369	CGCAT	2	10	154612	154621	20 %	20 %	20 %	40 %	209547768
83	NC_011369	CTTGC	2	10	155785	155794	0 %	40 %	20 %	40 %	209547769
84	NC_011369	CGTTC	2	10	159898	159907	0 %	40 %	20 %	40 %	209547772
85	NC_011369	CGCCC	2	10	164570	164579	0 %	0 %	20 %	80 %	209547775
86	NC_011369	TCCTT	2	10	165598	165607	0 %	60 %	0 %	40 %	209547776
87	NC_011369	GCATT	2	10	167998	168007	20 %	40 %	20 %	20 %	209547778
88	NC_011369	CGCGC	2	10	168429	168438	0 %	0 %	40 %	60 %	209547778
89	NC_011369	CTGCC	2	10	170542	170551	0 %	20 %	20 %	60 %	209547779
90	NC_011369	TGGCC	2	10	171104	171113	0 %	20 %	40 %	40 %	209547780
91	NC_011369	ACACG	2	10	171999	172008	40 %	0 %	20 %	40 %	209547781
92	NC_011369	GCCGC	2	10	174349	174358	0 %	0 %	40 %	60 %	209547784
93	NC_011369	CGACG	2	10	174861	174870	20 %	0 %	40 %	40 %	209547784
94	NC_011369	CCGCG	2	10	175383	175392	0 %	0 %	40 %	60 %	209547784
95	NC_011369	CGGAT	2	10	178942	178951	20 %	20 %	40 %	20 %	209547788
96	NC_011369	TGCTC	2	10	179717	179726	0 %	40 %	20 %	40 %	209547789
97	NC_011369	GGCCG	2	10	179832	179841	0 %	0 %	60 %	40 %	209547789
98	NC_011369	CGTGA	2	10	182566	182575	20 %	20 %	40 %	20 %	209547791
99	NC_011369	GAGAA	2	10	182918	182927	60 %	0 %	40 %	0 %	209547791
100	NC_011369	GGTGG	2	10	184877	184886	0 %	20 %	80 %	0 %	209547793
101	NC_011369	ATCGA	2	10	185558	185567	40 %	20 %	20 %	20 %	209547794
102	NC_011369	GCGAG	2	10	186174	186183	20 %	0 %	60 %	20 %	209547794
103	NC_011369	TGCTC	2	10	186714	186723	0 %	40 %	20 %	40 %	209547794
104	NC_011369	GCGCT	2	10	188563	188572	0 %	20 %	40 %	40 %	209547796
105	NC_011369	AGCGC	2	10	190981	190990	20 %	0 %	40 %	40 %	209547799
106	NC_011369	GCGCA	2	10	191141	191150	20 %	0 %	40 %	40 %	209547799
107	NC_011369	ATCAG	2	10	191288	191297	40 %	20 %	20 %	20 %	209547800
108	NC_011369	ATCGC	2	10	192608	192617	20 %	20 %	20 %	40 %	209547802
109	NC_011369	TCGCC	2	10	195692	195701	0 %	20 %	20 %	60 %	209547806
110	NC_011369	GCCTT	2	10	196880	196889	0 %	40 %	20 %	40 %	209547807
111	NC_011369	GATCT	2	10	202456	202465	20 %	40 %	20 %	20 %	209547811
112	NC_011369	ACGCT	2	10	205413	205422	20 %	20 %	20 %	40 %	209547815
113	NC_011369	GATCG	2	10	205665	205674	20 %	20 %	40 %	20 %	209547815
114	NC_011369	TGCGG	2	10	211882	211891	0 %	20 %	60 %	20 %	209547818
115	NC_011369	GGCGC	2	10	211892	211901	0 %	0 %	60 %	40 %	209547818
116	NC_011369	GCCGC	2	10	214397	214406	0 %	0 %	40 %	60 %	209547821
117	NC_011369	CCGAT	2	10	215700	215709	20 %	20 %	20 %	40 %	209547822
118	NC_011369	GCCGC	2	10	216072	216081	0 %	0 %	40 %	60 %	209547822
119	NC_011369	CACGA	2	10	217720	217729	40 %	0 %	20 %	40 %	209547823
120	NC_011369	CGCAG	2	10	218260	218269	20 %	0 %	40 %	40 %	209547824
121	NC_011369	GCCGA	2	10	221777	221786	20 %	0 %	40 %	40 %	209547827
122	NC_011369	ACACG	2	10	223792	223801	40 %	0 %	20 %	40 %	209547830
123	NC_011369	GGCGA	2	10	224510	224519	20 %	0 %	60 %	20 %	209547830
124	NC_011369	TGGCC	2	10	224704	224713	0 %	20 %	40 %	40 %	209547830
125	NC_011369	TCGTC	2	10	225645	225654	0 %	40 %	20 %	40 %	209547830
126	NC_011369	CCGGG	2	10	227488	227497	0 %	0 %	60 %	40 %	209547832
127	NC_011369	TCTCG	2	10	227714	227723	0 %	40 %	20 %	40 %	209547832
128	NC_011369	GCCGC	2	10	228432	228441	0 %	0 %	40 %	60 %	209547833
129	NC_011369	GCGCC	3	15	234392	234406	0 %	0 %	40 %	60 %	209547836
130	NC_011369	GCTCG	2	10	237346	237355	0 %	20 %	40 %	40 %	209547838
131	NC_011369	TTTCG	2	10	237485	237494	0 %	60 %	20 %	20 %	209547838
132	NC_011369	CAGTC	2	10	238487	238496	20 %	20 %	20 %	40 %	209547839
133	NC_011369	AGCGC	2	10	238658	238667	20 %	0 %	40 %	40 %	209547839
134	NC_011369	CGCGC	2	10	239675	239684	0 %	0 %	40 %	60 %	209547839
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259	NC_011369	CCGAC	2	10	436256	436265	20 %	0 %	20 %	60 %	209548033
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