MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 chromosome

Total Repeats: 12015

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011369	TTTC	2	8	3	10	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011369	GGCA	2	8	516	523	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011369	GCCG	2	8	1054	1061	0 %	0 %	50 %	50 %	209547613
4	NC_011369	TCGA	2	8	1826	1833	25 %	25 %	25 %	25 %	209547613
5	NC_011369	CATT	2	8	2593	2600	25 %	50 %	0 %	25 %	209547614
6	NC_011369	CCGC	2	8	2658	2665	0 %	0 %	25 %	75 %	209547614
7	NC_011369	GCCG	2	8	3813	3820	0 %	0 %	50 %	50 %	209547615
8	NC_011369	CCGG	2	8	3891	3898	0 %	0 %	50 %	50 %	209547615
9	NC_011369	GCTT	2	8	4088	4095	0 %	50 %	25 %	25 %	209547615
10	NC_011369	CCGG	2	8	4128	4135	0 %	0 %	50 %	50 %	209547615
11	NC_011369	GCCG	2	8	4218	4225	0 %	0 %	50 %	50 %	209547615
12	NC_011369	CGAG	2	8	4263	4270	25 %	0 %	50 %	25 %	209547615
13	NC_011369	GCCG	2	8	4282	4289	0 %	0 %	50 %	50 %	209547615
14	NC_011369	GGCA	2	8	4357	4364	25 %	0 %	50 %	25 %	209547615
15	NC_011369	CAGG	2	8	4705	4712	25 %	0 %	50 %	25 %	209547616
16	NC_011369	GTCC	2	8	4920	4927	0 %	25 %	25 %	50 %	209547616
17	NC_011369	TGGC	2	8	5300	5307	0 %	25 %	50 %	25 %	209547616
18	NC_011369	CGCC	2	8	5463	5470	0 %	0 %	25 %	75 %	209547617
19	NC_011369	GGCT	2	8	5968	5975	0 %	25 %	50 %	25 %	209547618
20	NC_011369	TCCA	2	8	6049	6056	25 %	25 %	0 %	50 %	209547618
21	NC_011369	GCCG	2	8	6240	6247	0 %	0 %	50 %	50 %	209547618
22	NC_011369	CAGG	2	8	6396	6403	25 %	0 %	50 %	25 %	209547618
23	NC_011369	ACTT	2	8	6566	6573	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_011369	GCCG	2	8	6832	6839	0 %	0 %	50 %	50 %	209547619
25	NC_011369	GCTG	2	8	7092	7099	0 %	25 %	50 %	25 %	209547619
26	NC_011369	CGTC	2	8	7260	7267	0 %	25 %	25 %	50 %	209547619
27	NC_011369	GCAG	2	8	8320	8327	25 %	0 %	50 %	25 %	209547620
28	NC_011369	TCCG	2	8	9229	9236	0 %	25 %	25 %	50 %	209547621
29	NC_011369	CAAG	2	8	9502	9509	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_011369	GCTG	2	8	9813	9820	0 %	25 %	50 %	25 %	209547622
31	NC_011369	GCCC	2	8	10035	10042	0 %	0 %	25 %	75 %	209547622
32	NC_011369	GCCA	2	8	10895	10902	25 %	0 %	25 %	50 %	209547624
33	NC_011369	GCGG	2	8	11817	11824	0 %	0 %	75 %	25 %	209547625
34	NC_011369	AGCT	2	8	12754	12761	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_011369	ATCC	2	8	13376	13383	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_011369	GCCG	2	8	14654	14661	0 %	0 %	50 %	50 %	209547627
37	NC_011369	CAGC	2	8	14855	14862	25 %	0 %	25 %	50 %	209547627
38	NC_011369	CGGG	2	8	15195	15202	0 %	0 %	75 %	25 %	209547628
39	NC_011369	TGCG	2	8	15611	15618	0 %	25 %	50 %	25 %	209547628
40	NC_011369	GGCC	2	8	15748	15755	0 %	0 %	50 %	50 %	209547628
41	NC_011369	GCCG	2	8	16102	16109	0 %	0 %	50 %	50 %	209547628
42	NC_011369	GCGG	2	8	17224	17231	0 %	0 %	75 %	25 %	209547630
43	NC_011369	TGGT	2	8	17646	17653	0 %	50 %	50 %	0 %	209547630
44	NC_011369	GTCT	2	8	18269	18276	0 %	50 %	25 %	25 %	209547631
45	NC_011369	CGTC	2	8	19005	19012	0 %	25 %	25 %	50 %	209547631
46	NC_011369	TCGG	2	8	19131	19138	0 %	25 %	50 %	25 %	209547631
47	NC_011369	ATCC	2	8	19905	19912	25 %	25 %	0 %	50 %	209547632
48	NC_011369	CGGC	2	8	19941	19948	0 %	0 %	50 %	50 %	209547632
49	NC_011369	CTTC	2	8	20174	20181	0 %	50 %	0 %	50 %	209547633
50	NC_011369	GGCG	2	8	20375	20382	0 %	0 %	75 %	25 %	209547633
51	NC_011369	TGAA	2	8	22483	22490	50 %	25 %	25 %	0 %	209547636
52	NC_011369	CGGC	2	8	22507	22514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_011369	CGGC	2	8	22674	22681	0 %	0 %	50 %	50 %	209547637
54	NC_011369	CGGC	2	8	22986	22993	0 %	0 %	50 %	50 %	209547637
55	NC_011369	ATGG	2	8	23349	23356	25 %	25 %	50 %	0 %	209547638
56	NC_011369	CCGG	2	8	23474	23481	0 %	0 %	50 %	50 %	209547638
57	NC_011369	CTCG	2	8	23499	23506	0 %	25 %	25 %	50 %	209547638
58	NC_011369	ACCG	2	8	23817	23824	25 %	0 %	25 %	50 %	209547638
59	NC_011369	CGAG	2	8	23888	23895	25 %	0 %	50 %	25 %	209547638
60	NC_011369	GCAT	2	8	24121	24128	25 %	25 %	25 %	25 %	209547638
61	NC_011369	CTTA	2	8	24862	24869	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_011369	TCAT	2	8	25059	25066	25 %	50 %	0 %	25 %	209547640
63	NC_011369	TCGA	2	8	26255	26262	25 %	25 %	25 %	25 %	209547641
64	NC_011369	GCCG	2	8	26551	26558	0 %	0 %	50 %	50 %	209547641
65	NC_011369	CCGG	2	8	27514	27521	0 %	0 %	50 %	50 %	209547642
66	NC_011369	ATGG	2	8	27743	27750	25 %	25 %	50 %	0 %	209547642
67	NC_011369	GCCG	2	8	27806	27813	0 %	0 %	50 %	50 %	209547642
68	NC_011369	CGGT	2	8	28287	28294	0 %	25 %	50 %	25 %	209547642
69	NC_011369	GATC	2	8	28549	28556	25 %	25 %	25 %	25 %	209547642
70	NC_011369	CGGG	2	8	29114	29121	0 %	0 %	75 %	25 %	209547642
71	NC_011369	GCCC	2	8	29353	29360	0 %	0 %	25 %	75 %	209547642
72	NC_011369	CCTT	2	8	29364	29371	0 %	50 %	0 %	50 %	209547642
73	NC_011369	CGCC	2	8	29401	29408	0 %	0 %	25 %	75 %	209547642
74	NC_011369	TCGG	2	8	29679	29686	0 %	25 %	50 %	25 %	209547642
75	NC_011369	TGCT	2	8	29923	29930	0 %	50 %	25 %	25 %	209547642
76	NC_011369	CCGG	2	8	29968	29975	0 %	0 %	50 %	50 %	209547642
77	NC_011369	CTGT	2	8	30307	30314	0 %	50 %	25 %	25 %	209547643
78	NC_011369	GGCG	2	8	30779	30786	0 %	0 %	75 %	25 %	209547644
79	NC_011369	TCGC	2	8	31054	31061	0 %	25 %	25 %	50 %	209547644
80	NC_011369	GCGG	2	8	32211	32218	0 %	0 %	75 %	25 %	209547644
81	NC_011369	GGTC	2	8	32219	32226	0 %	25 %	50 %	25 %	209547644
82	NC_011369	CGAG	2	8	32948	32955	25 %	0 %	50 %	25 %	209547644
83	NC_011369	AAGA	2	8	33383	33390	75 %	0 %	25 %	0 %	209547645
84	NC_011369	CCGG	2	8	33391	33398	0 %	0 %	50 %	50 %	209547645
85	NC_011369	CCGC	2	8	33579	33586	0 %	0 %	25 %	75 %	209547645
86	NC_011369	TGCG	2	8	33761	33768	0 %	25 %	50 %	25 %	209547645
87	NC_011369	ACGC	2	8	34135	34142	25 %	0 %	25 %	50 %	209547645
88	NC_011369	CCGG	2	8	34867	34874	0 %	0 %	50 %	50 %	209547645
89	NC_011369	CGTC	2	8	36510	36517	0 %	25 %	25 %	50 %	209547646
90	NC_011369	ATGC	2	8	36532	36539	25 %	25 %	25 %	25 %	209547646
91	NC_011369	TCTG	2	8	36725	36732	0 %	50 %	25 %	25 %	209547646
92	NC_011369	CGGC	2	8	36953	36960	0 %	0 %	50 %	50 %	209547647
93	NC_011369	GTCG	2	8	37024	37031	0 %	25 %	50 %	25 %	209547647
94	NC_011369	TAGA	2	8	37255	37262	50 %	25 %	25 %	0 %	209547647
95	NC_011369	TCGG	2	8	38615	38622	0 %	25 %	50 %	25 %	209547648
96	NC_011369	GCCG	2	8	39576	39583	0 %	0 %	50 %	50 %	209547648
97	NC_011369	AGCA	2	8	39979	39986	50 %	0 %	25 %	25 %	209547648
98	NC_011369	TGCA	2	8	40199	40206	25 %	25 %	25 %	25 %	209547648
99	NC_011369	CGGC	2	8	40263	40270	0 %	0 %	50 %	50 %	209547649
100	NC_011369	CAGC	2	8	40305	40312	25 %	0 %	25 %	50 %	209547649
101	NC_011369	GAGC	2	8	40462	40469	25 %	0 %	50 %	25 %	209547649
102	NC_011369	CCAT	2	8	40548	40555	25 %	25 %	0 %	50 %	209547649
103	NC_011369	GCCG	2	8	41008	41015	0 %	0 %	50 %	50 %	209547650
104	NC_011369	GCCG	2	8	41149	41156	0 %	0 %	50 %	50 %	209547650
105	NC_011369	GCCC	2	8	41349	41356	0 %	0 %	25 %	75 %	209547650
106	NC_011369	CTTC	2	8	41565	41572	0 %	50 %	0 %	50 %	209547650
107	NC_011369	CGGC	3	12	42147	42158	0 %	0 %	50 %	50 %	209547651
108	NC_011369	GGCA	2	8	42564	42571	25 %	0 %	50 %	25 %	209547651
109	NC_011369	CCGG	2	8	42630	42637	0 %	0 %	50 %	50 %	209547651
110	NC_011369	CGGC	2	8	42690	42697	0 %	0 %	50 %	50 %	209547651
111	NC_011369	TGTC	2	8	42728	42735	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_011369	GCGG	2	8	43662	43669	0 %	0 %	75 %	25 %	209547653
113	NC_011369	GGCC	2	8	43838	43845	0 %	0 %	50 %	50 %	209547653
114	NC_011369	CCGG	2	8	44324	44331	0 %	0 %	50 %	50 %	209547654
115	NC_011369	CGCT	2	8	45336	45343	0 %	25 %	25 %	50 %	209547656
116	NC_011369	GATC	2	8	45922	45929	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_011369	CCGG	2	8	46153	46160	0 %	0 %	50 %	50 %	209547657
118	NC_011369	CCGC	2	8	46189	46196	0 %	0 %	25 %	75 %	209547657
119	NC_011369	ATCT	2	8	46275	46282	25 %	50 %	0 %	25 %	209547657
120	NC_011369	GCCG	2	8	46353	46360	0 %	0 %	50 %	50 %	209547657
121	NC_011369	ATGA	2	8	46464	46471	50 %	25 %	25 %	0 %	209547657
122	NC_011369	CCGC	2	8	46591	46598	0 %	0 %	25 %	75 %	209547657
123	NC_011369	ATCC	2	8	46741	46748	25 %	25 %	0 %	50 %	209547657
124	NC_011369	CCAT	2	8	46750	46757	25 %	25 %	0 %	50 %	209547657
125	NC_011369	GCCG	2	8	47072	47079	0 %	0 %	50 %	50 %	209547658
126	NC_011369	CGAC	2	8	47972	47979	25 %	0 %	25 %	50 %	209547659
127	NC_011369	CGTC	2	8	48385	48392	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_011369	ATCC	2	8	48461	48468	25 %	25 %	0 %	50 %	209547660
129	NC_011369	ACTC	2	8	48494	48501	25 %	25 %	0 %	50 %	209547660
130	NC_011369	GGCG	2	8	48563	48570	0 %	0 %	75 %	25 %	209547660
131	NC_011369	CCTT	2	8	49441	49448	0 %	50 %	0 %	50 %	209547660
132	NC_011369	CGCC	2	8	49853	49860	0 %	0 %	25 %	75 %	209547660
133	NC_011369	TCGG	2	8	50780	50787	0 %	25 %	50 %	25 %	209547661
134	NC_011369	GGCT	2	8	51069	51076	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_011369	CTTG	2	8	51166	51173	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_011369	CGGC	2	8	51446	51453	0 %	0 %	50 %	50 %	209547662
137	NC_011369	CGCC	2	8	51638	51645	0 %	0 %	25 %	75 %	209547662
138	NC_011369	GTCG	2	8	51681	51688	0 %	25 %	50 %	25 %	209547662
139	NC_011369	CCTT	2	8	52855	52862	0 %	50 %	0 %	50 %	209547664
140	NC_011369	AGCG	2	8	53740	53747	25 %	0 %	50 %	25 %	209547664
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