MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 chromosome

Total Repeats: 1699

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011369	TTTC	2	8	3	10	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011369	GGCA	2	8	516	523	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011369	ACTT	2	8	6566	6573	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_011369	CAAG	2	8	9502	9509	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011369	AGCT	2	8	12754	12761	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_011369	ATCC	2	8	13376	13383	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_011369	CGGC	2	8	22507	22514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_011369	CTTA	2	8	24862	24869	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011369	TGTC	2	8	42728	42735	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_011369	GATC	2	8	45922	45929	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_011369	CGTC	2	8	48385	48392	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_011369	GGCT	2	8	51069	51076	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_011369	CTTG	2	8	51166	51173	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_011369	TGAA	2	8	54980	54987	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011369	GCAG	2	8	57321	57328	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011369	TCGA	2	8	57362	57369	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011369	CGGG	2	8	57459	57466	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18	NC_011369	CGGG	2	8	64427	64434	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_011369	CGGA	2	8	64543	64550	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_011369	TGAA	2	8	65305	65312	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011369	CGCC	2	8	70327	70334	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
22	NC_011369	ATTA	2	8	70340	70347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011369	GCCG	2	8	73291	73298	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_011369	GCCC	2	8	73981	73988	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25	NC_011369	GTTC	2	8	76387	76394	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_011369	AGCA	2	8	76428	76435	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_011369	CGGG	2	8	76599	76606	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_011369	GCCG	2	8	76651	76658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_011369	CGGA	2	8	77373	77380	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_011369	CGGG	2	8	79881	79888	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
31	NC_011369	GATC	2	8	80057	80064	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_011369	GGGA	2	8	82338	82345	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011369	TCCC	2	8	82430	82437	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
34	NC_011369	GCAC	2	8	84226	84233	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_011369	GGTT	2	8	84410	84417	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011369	CAGG	2	8	84472	84479	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_011369	TTGC	2	8	86386	86393	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_011369	TTTC	2	8	88830	88837	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_011369	TCGT	2	8	91814	91821	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_011369	TAAG	2	8	93508	93515	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011369	AATC	2	8	95226	95233	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_011369	GTCG	2	8	96583	96590	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_011369	GTCA	2	8	98120	98127	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_011369	TGGG	2	8	99702	99709	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011369	GCGT	2	8	105593	105600	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_011369	GCAG	2	8	107520	107527	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_011369	AGGG	2	8	107564	107571	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011369	TCGA	2	8	117216	117223	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_011369	ATTT	2	8	117255	117262	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011369	GACG	2	8	118479	118486	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_011369	CGAT	2	8	123769	123776	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_011369	GCCG	2	8	124458	124465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_011369	GTCA	2	8	124702	124709	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_011369	CAGC	2	8	127956	127963	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_011369	GCCC	2	8	127984	127991	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
56	NC_011369	GATG	2	8	128020	128027	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011369	TTCT	2	8	129621	129628	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_011369	TCGG	2	8	133381	133388	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_011369	GTGG	2	8	134039	134046	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011369	CCGC	2	8	140179	140186	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
61	NC_011369	GAGC	2	8	140196	140203	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_011369	TGCG	2	8	141248	141255	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_011369	GGAG	2	8	141549	141556	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011369	CTGT	2	8	147718	147725	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_011369	CAGT	2	8	156299	156306	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_011369	CCGG	2	8	158051	158058	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_011369	CGAA	2	8	158107	158114	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_011369	TCAA	2	8	159153	159160	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_011369	AAGC	2	8	159503	159510	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_011369	CAGC	2	8	160209	160216	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_011369	GGTT	2	8	160434	160441	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011369	TTCT	2	8	164873	164880	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_011369	ATTC	2	8	167814	167821	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_011369	AGGC	2	8	167840	167847	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_011369	TGCG	2	8	172302	172309	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_011369	ACCG	2	8	173146	173153	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_011369	CCGG	2	8	179186	179193	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_011369	GCAT	2	8	187224	187231	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_011369	CGGC	2	8	187240	187247	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_011369	GGGC	2	8	187403	187410	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
81	NC_011369	GCCG	2	8	190477	190484	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_011369	ACCG	2	8	190493	190500	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_011369	CTCC	2	8	191207	191214	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
84	NC_011369	TGCA	2	8	191261	191268	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_011369	GTCG	2	8	197628	197635	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_011369	TCCC	2	8	198169	198176	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
87	NC_011369	CCGT	2	8	198178	198185	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_011369	GGAT	2	8	208025	208032	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011369	CGGG	2	8	208070	208077	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
90	NC_011369	GGGT	2	8	208324	208331	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011369	AAGG	2	8	214517	214524	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011369	GGTC	2	8	221322	221329	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_011369	ACGG	2	8	221474	221481	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_011369	CGCC	2	8	221583	221590	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
95	NC_011369	TCGT	2	8	222649	222656	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_011369	CCCG	2	8	231339	231346	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
97	NC_011369	GATT	2	8	231401	231408	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011369	CCCG	2	8	232096	232103	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
99	NC_011369	TCGG	2	8	233370	233377	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_011369	CGAT	2	8	233400	233407	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_011369	GAAA	2	8	233500	233507	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011369	CGAT	2	8	236654	236661	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_011369	CAAC	2	8	240441	240448	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_011369	GCCG	2	8	241247	241254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_011369	GAAA	2	8	242247	242254	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011369	TCCG	2	8	242686	242693	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_011369	GGCG	2	8	242765	242772	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
108	NC_011369	CGCT	2	8	248310	248317	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_011369	CGTG	2	8	252687	252694	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_011369	CCCG	2	8	254387	254394	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
111	NC_011369	CGTA	2	8	254730	254737	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_011369	AAGC	2	8	257976	257983	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_011369	TCAT	2	8	258056	258063	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_011369	GCCG	2	8	258315	258322	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_011369	ATTT	2	8	264091	264098	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011369	TGCC	2	8	270201	270208	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_011369	GGCG	2	8	301544	301551	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
118	NC_011369	CAAG	2	8	301766	301773	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_011369	GGCT	2	8	312492	312499	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_011369	GCGG	2	8	315886	315893	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
121	NC_011369	CCGG	2	8	322537	322544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_011369	GATC	2	8	330841	330848	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_011369	GCTT	2	8	330889	330896	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_011369	TTTC	2	8	330945	330952	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_011369	CAAA	2	8	331089	331096	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_011369	GCCG	2	8	332319	332326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_011369	CAAA	2	8	332368	332375	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_011369	TTCT	2	8	334529	334536	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_011369	GACA	2	8	342116	342123	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_011369	TGAG	2	8	353865	353872	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011369	GCCC	2	8	357905	357912	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
132	NC_011369	GGGA	2	8	359720	359727	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011369	TTTG	2	8	365293	365300	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011369	CAGA	2	8	373812	373819	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_011369	CTGC	2	8	376897	376904	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_011369	AACA	2	8	383301	383308	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_011369	CGGA	2	8	384430	384437	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_011369	CGGC	2	8	395708	395715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_011369	GCAG	2	8	395796	395803	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_011369	GGCC	2	8	403039	403046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_011369	TTGA	2	8	403178	403185	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011369	TCCG	2	8	408922	408929	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_011369	GGCA	2	8	413075	413082	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_011369	CGAG	2	8	414537	414544	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_011369	CGAT	2	8	415512	415519	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_011369	GTTC	2	8	434775	434782	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_011369	GCGG	2	8	437402	437409	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
148	NC_011369	GGCG	2	8	437503	437510	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
149	NC_011369	CCGG	2	8	443216	443223	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_011369	TCCT	2	8	443237	443244	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_011369	TTCT	2	8	446349	446356	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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