MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 chromosome

Total Repeats: 7267

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011369	GGT	2	6	73	78	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011369	CTT	2	6	115	120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011369	GCC	2	6	369	374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_011369	AAT	2	6	564	569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011369	GGC	2	6	572	577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011369	GCC	2	6	591	596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_011369	GGC	2	6	611	616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011369	GCG	2	6	2279	2284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011369	GGA	2	6	2323	2328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011369	GTG	2	6	4687	4692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011369	TTG	2	6	6499	6504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011369	GGC	2	6	6520	6525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011369	ATC	2	6	6584	6589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011369	CTT	2	6	7728	7733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011369	GCC	2	6	9489	9494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_011369	CAC	2	6	9517	9522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_011369	TGC	2	6	9604	9609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011369	CTT	2	6	10108	10113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011369	GGA	2	6	10116	10121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011369	GAA	2	6	10391	10396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011369	TCG	2	6	10477	10482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011369	CGC	2	6	10696	10701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_011369	CGA	2	6	10741	10746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011369	CGT	2	6	10753	10758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011369	GGC	2	6	12864	12869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011369	TCA	2	6	13445	13450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011369	GCC	2	6	19314	19319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_011369	TCT	2	6	19334	19339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011369	CGG	2	6	20152	20157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011369	AGA	2	6	22545	22550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011369	GAA	2	6	23183	23188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011369	GTC	2	6	24264	24269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011369	TGG	2	6	24280	24285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011369	TGC	2	6	24305	24310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011369	GCA	2	6	24314	24319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011369	GTT	2	6	24322	24327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011369	CGC	2	6	24343	24348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_011369	GCC	2	6	24943	24948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_011369	AGG	2	6	24961	24966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011369	CCG	2	6	33194	33199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_011369	ACA	2	6	33315	33320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011369	GGA	2	6	33359	33364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011369	TCA	2	6	35818	35823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011369	AAG	2	6	37898	37903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011369	AGC	2	6	42933	42938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011369	GCG	2	6	42942	42947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011369	GCC	2	6	44464	44469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_011369	GCG	2	6	44478	44483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011369	CGC	2	6	44581	44586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_011369	GGC	2	6	44588	44593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011369	ATT	2	6	44917	44922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011369	GCC	2	6	45916	45921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_011369	GCG	2	6	45947	45952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011369	TTG	2	6	45993	45998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011369	TAA	2	6	46029	46034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011369	GGC	2	6	46054	46059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011369	ATC	2	6	47448	47453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011369	ACA	2	6	48293	48298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011369	GGA	2	6	48364	48369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011369	CGC	2	6	49956	49961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_011369	TGT	2	6	50988	50993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011369	CGC	2	6	51084	51089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_011369	CAG	2	6	51148	51153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011369	ACG	2	6	51230	51235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011369	AAG	2	6	51238	51243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011369	GCG	2	6	51842	51847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011369	CGC	3	9	51852	51860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_011369	GCC	3	9	54844	54852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_011369	CGC	2	6	54889	54894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_011369	CAG	2	6	54948	54953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011369	CGC	2	6	54960	54965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_011369	CGG	2	6	55047	55052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011369	AGA	2	6	57261	57266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011369	CGG	2	6	57301	57306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011369	CGG	2	6	62380	62385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011369	GGC	3	9	62406	62414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011369	CGC	2	6	62430	62435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_011369	CGG	2	6	63361	63366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011369	CAA	2	6	63439	63444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011369	CAG	3	9	64468	64476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_011369	GAA	2	6	65254	65259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011369	GCC	2	6	65324	65329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_011369	CGG	2	6	66122	66127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011369	CGC	2	6	68001	68006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_011369	GAG	2	6	69308	69313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011369	CGG	2	6	70413	70418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011369	GAT	2	6	70428	70433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011369	GCT	2	6	70907	70912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_011369	AGG	3	9	70950	70958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011369	TGA	2	6	70977	70982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011369	AAT	2	6	71939	71944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011369	GCC	2	6	73352	73357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_011369	GAC	2	6	73375	73380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011369	GAG	2	6	73414	73419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011369	CCG	2	6	75239	75244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_011369	CGA	2	6	75375	75380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011369	GAA	2	6	76332	76337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011369	GTC	2	6	76446	76451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011369	GGT	2	6	77394	77399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011369	CCG	2	6	77439	77444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_011369	CTT	2	6	79840	79845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_011369	GCG	2	6	79915	79920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_011369	TAA	2	6	80010	80015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011369	TAA	2	6	80155	80160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011369	ATC	2	6	80178	80183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011369	CGC	2	6	82258	82263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_011369	GCG	2	6	82270	82275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_011369	TCG	2	6	82375	82380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_011369	TGC	2	6	82406	82411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_011369	TGG	2	6	82457	82462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011369	GCT	2	6	82487	82492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_011369	GGC	2	6	82540	82545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_011369	TGC	2	6	82551	82556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_011369	CCG	2	6	84215	84220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_011369	CCG	2	6	84361	84366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_011369	CCG	2	6	84502	84507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_011369	CGA	2	6	85081	85086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011369	GGA	2	6	85176	85181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011369	TGG	2	6	85878	85883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011369	GAA	2	6	86421	86426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011369	CCG	2	6	86515	86520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_011369	GCA	2	6	87225	87230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011369	TGC	2	6	87318	87323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011369	ACG	2	6	87374	87379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011369	TGG	2	6	92655	92660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011369	TCC	2	6	93476	93481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_011369	TGA	2	6	93601	93606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011369	GGA	2	6	93627	93632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011369	GGC	2	6	94096	94101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_011369	TCA	2	6	94116	94121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_011369	AGG	2	6	94135	94140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011369	GGC	2	6	94536	94541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_011369	GAG	2	6	94542	94547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011369	GTA	2	6	94605	94610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011369	TCC	2	6	94655	94660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_011369	GGC	2	6	95024	95029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_011369	GCC	2	6	95038	95043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_011369	CGC	2	6	95204	95209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_011369	GAT	2	6	95932	95937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011369	CCT	2	6	96647	96652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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142	NC_011369	CGG	2	6	96699	96704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_011369	ATC	2	6	96705	96710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_011369	CGG	2	6	96736	96741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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