MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 chromosome

Total Repeats: 72745

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011369	CGG	2	6	639	644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547613
2	NC_011369	CAC	2	6	856	861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209547613
3	NC_011369	CAA	2	6	880	885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209547613
4	NC_011369	TCA	2	6	900	905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547613
5	NC_011369	CAG	2	6	1073	1078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547613
6	NC_011369	TTC	2	6	1084	1089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209547613
7	NC_011369	TGC	2	6	1093	1098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547613
8	NC_011369	CGC	2	6	1122	1127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547613
9	NC_011369	CGC	2	6	1137	1142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547613
10	NC_011369	TCG	2	6	1170	1175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547613
11	NC_011369	GCC	2	6	1205	1210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547613
12	NC_011369	CTG	2	6	1295	1300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547613
13	NC_011369	GCG	2	6	1316	1321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547613
14	NC_011369	CGT	2	6	1345	1350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547613
15	NC_011369	ATG	2	6	1404	1409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547613
16	NC_011369	ATC	2	6	1451	1456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547613
17	NC_011369	GAC	2	6	1457	1462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547613
18	NC_011369	GAT	2	6	1483	1488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547613
19	NC_011369	TGC	2	6	1518	1523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547613
20	NC_011369	GTC	3	9	1541	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547613
21	NC_011369	GCC	2	6	1550	1555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547613
22	NC_011369	TCC	2	6	1665	1670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209547613
23	NC_011369	TGC	2	6	1681	1686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547613
24	NC_011369	CCG	2	6	1801	1806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547613
25	NC_011369	CGA	2	6	1840	1845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547613
26	NC_011369	TCG	2	6	1860	1865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547613
27	NC_011369	CGC	2	6	1880	1885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547613
28	NC_011369	TCG	2	6	1911	1916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547613
29	NC_011369	CCG	2	6	1957	1962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547613
30	NC_011369	CGC	2	6	2019	2024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547613
31	NC_011369	GCC	2	6	2043	2048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547613
32	NC_011369	CGG	2	6	2053	2058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547613
33	NC_011369	TGC	2	6	2076	2081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547613
34	NC_011369	GGC	2	6	2386	2391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547614
35	NC_011369	GGT	2	6	2497	2502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209547614
36	NC_011369	CTG	2	6	2510	2515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547614
37	NC_011369	CAC	2	6	2626	2631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209547614
38	NC_011369	TCG	2	6	2640	2645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547614
39	NC_011369	TCG	2	6	2703	2708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547614
40	NC_011369	GCA	2	6	2782	2787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547614
41	NC_011369	CTG	2	6	2798	2803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547614
42	NC_011369	GTC	2	6	2834	2839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547614
43	NC_011369	CGG	2	6	2926	2931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547614
44	NC_011369	CAC	2	6	2950	2955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209547614
45	NC_011369	GGC	2	6	2960	2965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547614
46	NC_011369	TGA	2	6	3048	3053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547614
47	NC_011369	CTT	3	9	3055	3063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209547614
48	NC_011369	GCC	2	6	3124	3129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547614
49	NC_011369	GTC	2	6	3143	3148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547614
50	NC_011369	CGC	2	6	3160	3165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547614
51	NC_011369	CGC	2	6	3242	3247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547614
52	NC_011369	GAC	2	6	3262	3267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547614
53	NC_011369	CGT	2	6	3277	3282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547614
54	NC_011369	CTG	2	6	3311	3316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547614
55	NC_011369	CCA	2	6	3402	3407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209547614
56	NC_011369	CAG	2	6	3482	3487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547615
57	NC_011369	CGA	2	6	3498	3503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547615
58	NC_011369	GCT	2	6	3624	3629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547615
59	NC_011369	CAG	2	6	3673	3678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547615
60	NC_011369	TCG	2	6	3683	3688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547615
61	NC_011369	CTC	2	6	3712	3717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209547615
62	NC_011369	TCT	2	6	3792	3797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209547615
63	NC_011369	GAT	2	6	4065	4070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547615
64	NC_011369	CAT	2	6	4209	4214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547615
65	NC_011369	ATC	2	6	4243	4248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547615
66	NC_011369	TCA	2	6	4416	4421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547615
67	NC_011369	GCC	3	9	4432	4440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547615
68	NC_011369	CCG	2	6	4485	4490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547615
69	NC_011369	CGC	2	6	4579	4584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547615
70	NC_011369	GCA	2	6	4635	4640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547615
71	NC_011369	GGC	2	6	4659	4664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547615
72	NC_011369	CGC	2	6	4791	4796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547616
73	NC_011369	GCC	2	6	4861	4866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547616
74	NC_011369	GCG	2	6	4869	4874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547616
75	NC_011369	GAC	2	6	4879	4884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547616
76	NC_011369	CGC	2	6	4899	4904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547616
77	NC_011369	CGT	2	6	4978	4983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547616
78	NC_011369	ACC	2	6	5105	5110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209547616
79	NC_011369	CGA	2	6	5214	5219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547616
80	NC_011369	CGG	2	6	5229	5234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547616
81	NC_011369	ACG	2	6	5309	5314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547616
82	NC_011369	GCC	2	6	5425	5430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547617
83	NC_011369	GCG	2	6	5550	5555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547617
84	NC_011369	CGG	2	6	5578	5583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547617
85	NC_011369	CAG	2	6	5611	5616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547617
86	NC_011369	GAA	2	6	5635	5640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209547617
87	NC_011369	GGC	2	6	5653	5658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547617
88	NC_011369	CGA	2	6	5885	5890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547618
89	NC_011369	CGC	2	6	5984	5989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547618
90	NC_011369	GGC	2	6	5997	6002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547618
91	NC_011369	GCC	2	6	6111	6116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547618
92	NC_011369	CGA	2	6	6176	6181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547618
93	NC_011369	GCC	2	6	6228	6233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547618
94	NC_011369	GCA	2	6	6284	6289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547618
95	NC_011369	CGG	2	6	6336	6341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547618
96	NC_011369	TTC	2	6	6348	6353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209547618
97	NC_011369	TGC	2	6	6645	6650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547619
98	NC_011369	CGC	2	6	6679	6684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547619
99	NC_011369	TCG	2	6	6686	6691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547619
100	NC_011369	GCG	2	6	6707	6712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547619
101	NC_011369	CTG	2	6	6742	6747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547619
102	NC_011369	CGC	2	6	6818	6823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547619
103	NC_011369	TCG	2	6	6869	6874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547619
104	NC_011369	GAT	2	6	6969	6974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547619
105	NC_011369	TCA	2	6	7025	7030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547619
106	NC_011369	TCG	2	6	7103	7108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547619
107	NC_011369	CAT	2	6	7134	7139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547619
108	NC_011369	CGG	2	6	7148	7153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547619
109	NC_011369	CCT	2	6	7160	7165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209547619
110	NC_011369	GGC	2	6	7179	7184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547619
111	NC_011369	TCG	2	6	7295	7300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547619
112	NC_011369	ATC	2	6	7357	7362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547619
113	NC_011369	CGA	2	6	7431	7436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547619
114	NC_011369	AAG	2	6	7444	7449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209547619
115	NC_011369	TCG	2	6	7553	7558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547619
116	NC_011369	GAC	3	9	7570	7578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547619
117	NC_011369	TCG	2	6	7586	7591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547619
118	NC_011369	ATT	2	6	7625	7630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209547619
119	NC_011369	TGG	2	6	7646	7651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209547619
120	NC_011369	ACG	2	6	7820	7825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547620
121	NC_011369	GCC	2	6	7871	7876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547620
122	NC_011369	GCC	2	6	7979	7984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547620
123	NC_011369	GCC	2	6	8001	8006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547620
124	NC_011369	AAC	2	6	8297	8302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209547620
125	NC_011369	GTC	2	6	8306	8311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547620
126	NC_011369	TGC	2	6	8349	8354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547620
127	NC_011369	GGC	2	6	8381	8386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547620
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129	NC_011369	CGA	2	6	8422	8427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547620
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499	NC_011369	CTG	2	6	29783	29788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547642
500	NC_011369	TGA	2	6	29827	29832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547642

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