MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 plasmid pRLG201

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011368	AAAGAA	2	12	21931	21942	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011368	TGCCGT	2	12	22859	22870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011368	AGCCGA	2	12	36917	36928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011368	ACTGGC	2	12	37790	37801	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011368	ACGCTG	2	12	107498	107509	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011368	GCCGCG	2	12	205072	205083	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_011368	TTCGGC	2	12	208937	208948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011368	CGAAGG	2	12	209038	209049	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_011368	GCTTCA	2	12	212317	212328	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011368	ATGTCG	2	12	231737	231748	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_011368	AGGCCG	2	12	268390	268401	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011368	GAGGTC	2	12	278453	278464	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_011368	GCAACG	2	12	308062	308073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011368	GAAGGC	2	12	308197	308208	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_011368	TCGGCG	2	12	309287	309298	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011368	TTCAGA	2	12	327735	327746	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_011368	ATCTTT	2	12	340841	340852	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_011368	CCCGTT	2	12	349318	349329	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
19	NC_011368	CGATAA	2	12	365493	365504	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_011368	GGCCAG	2	12	438805	438816	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_011368	ATTGAA	2	12	478173	478184	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011368	CGGCAC	2	12	500489	500500	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
23	NC_011368	TGGTGA	2	12	500769	500780	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011368	AAGCGG	2	12	537089	537100	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_011368	TGAGCA	2	12	564120	564131	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_011368	AGAGGA	2	12	564261	564272	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011368	GACGAG	2	12	576309	576320	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_011368	GGGAGG	2	12	576747	576758	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011368	ATAGGC	2	12	677446	677457	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_011368	CGGCCG	2	12	725156	725167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_011368	GCCGGG	2	12	728480	728491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011368	GGCTCC	2	12	736794	736805	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
33	NC_011368	TTACGC	2	12	740378	740389	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011368	TGTTAC	2	12	747644	747655	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_011368	CTGACG	2	12	757637	757648	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011368	TGTCGA	2	12	762580	762591	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_011368	GGCGAA	2	12	762642	762653	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_011368	CGGGCA	2	12	775780	775791	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011368	AGCTTG	2	12	782910	782921	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_011368	TCCCCG	2	12	808371	808382	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_011368	GCCGCT	2	12	816377	816388	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
42	NC_011368	CAAAGA	2	12	822958	822969	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_011368	CCAGAT	2	12	828988	828999	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011368	CAATGC	2	12	836765	836776	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011368	CGAGCG	2	12	847199	847210	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011368	CAGGTC	2	12	847332	847343	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011368	AAGGCA	2	12	848521	848532	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_011368	CTGAAA	2	12	892442	892453	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_011368	ACCCCG	2	12	924555	924566	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_011368	GCGAAA	2	12	1074804	1074815	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_011368	AAGGCG	2	12	1106171	1106182	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_011368	TTTGCC	2	12	1139435	1139446	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011368	TGGCGA	2	12	1150390	1150401	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_011368	CGTCAC	2	12	1205651	1205662	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
55	NC_011368	CGACAT	2	12	1227837	1227848	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.