MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 plasmid pRLG201

Total Repeats: 769

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011368	GCGCC	2	10	472	481	0 %	0 %	40 %	60 %	209546451
2	NC_011368	CAGGG	2	10	517	526	20 %	0 %	60 %	20 %	209546451
3	NC_011368	TGCGG	2	10	6769	6778	0 %	20 %	60 %	20 %	209546456
4	NC_011368	AAGGC	2	10	6900	6909	40 %	0 %	40 %	20 %	209546457
5	NC_011368	TCGCG	2	10	7066	7075	0 %	20 %	40 %	40 %	209546457
6	NC_011368	GGCAG	2	10	8032	8041	20 %	0 %	60 %	20 %	209546457
7	NC_011368	GTTCT	2	10	8379	8388	0 %	60 %	20 %	20 %	209546457
8	NC_011368	GGCGA	2	10	9954	9963	20 %	0 %	60 %	20 %	209546459
9	NC_011368	AGCCG	2	10	10852	10861	20 %	0 %	40 %	40 %	209546461
10	NC_011368	AGCGC	2	10	11125	11134	20 %	0 %	40 %	40 %	209546461
11	NC_011368	GCGCA	2	10	11138	11147	20 %	0 %	40 %	40 %	209546461
12	NC_011368	GCCAC	2	10	13189	13198	20 %	0 %	20 %	60 %	209546463
13	NC_011368	GCGCG	2	10	13967	13976	0 %	0 %	60 %	40 %	209546464
14	NC_011368	ATCGC	2	10	14241	14250	20 %	20 %	20 %	40 %	209546464
15	NC_011368	CTCGC	2	10	17361	17370	0 %	20 %	20 %	60 %	209546467
16	NC_011368	CGACG	2	10	18410	18419	20 %	0 %	40 %	40 %	209546468
17	NC_011368	GGAAA	2	10	19752	19761	60 %	0 %	40 %	0 %	209546469
18	NC_011368	TGCAT	2	10	22334	22343	20 %	40 %	20 %	20 %	209546471
19	NC_011368	GCGCC	2	10	25471	25480	0 %	0 %	40 %	60 %	209546474
20	NC_011368	GCATC	2	10	27623	27632	20 %	20 %	20 %	40 %	209546476
21	NC_011368	GATCA	2	10	27999	28008	40 %	20 %	20 %	20 %	209546476
22	NC_011368	CGGAT	2	10	30524	30533	20 %	20 %	40 %	20 %	209546479
23	NC_011368	GAGCG	2	10	31841	31850	20 %	0 %	60 %	20 %	209546481
24	NC_011368	CGAGC	2	10	32502	32511	20 %	0 %	40 %	40 %	209546481
25	NC_011368	TTGCC	2	10	33997	34006	0 %	40 %	20 %	40 %	209546483
26	NC_011368	GCAAG	2	10	35833	35842	40 %	0 %	40 %	20 %	209546485
27	NC_011368	GCGCT	2	10	36347	36356	0 %	20 %	40 %	40 %	209546486
28	NC_011368	CGGGC	2	10	37982	37991	0 %	0 %	60 %	40 %	209546488
29	NC_011368	AGGGC	2	10	38203	38212	20 %	0 %	60 %	20 %	209546488
30	NC_011368	CGTAG	2	10	38326	38335	20 %	20 %	40 %	20 %	209546488
31	NC_011368	TCGCG	2	10	38955	38964	0 %	20 %	40 %	40 %	209546488
32	NC_011368	ACGGC	2	10	41300	41309	20 %	0 %	40 %	40 %	209546490
33	NC_011368	CGATG	2	10	41384	41393	20 %	20 %	40 %	20 %	209546490
34	NC_011368	TCCTT	2	10	42816	42825	0 %	60 %	0 %	40 %	209546492
35	NC_011368	GCCGC	2	10	43755	43764	0 %	0 %	40 %	60 %	209546492
36	NC_011368	CGGCG	2	10	44414	44423	0 %	0 %	60 %	40 %	209546493
37	NC_011368	TGAAT	2	10	45899	45908	40 %	40 %	20 %	0 %	209546494
38	NC_011368	GCTCA	2	10	46210	46219	20 %	20 %	20 %	40 %	209546495
39	NC_011368	GTTTC	2	10	48344	48353	0 %	60 %	20 %	20 %	209546496
40	NC_011368	GTTCC	2	10	52846	52855	0 %	40 %	20 %	40 %	209546499
41	NC_011368	TGGAA	2	10	53926	53935	40 %	20 %	40 %	0 %	209546500
42	NC_011368	CGAGG	2	10	54055	54064	20 %	0 %	60 %	20 %	209546500
43	NC_011368	ACAAA	2	10	55693	55702	80 %	0 %	0 %	20 %	209546502
44	NC_011368	CCGGG	2	10	56890	56899	0 %	0 %	60 %	40 %	209546503
45	NC_011368	GCGCA	2	10	59610	59619	20 %	0 %	40 %	40 %	209546506
46	NC_011368	CGGCT	2	10	60127	60136	0 %	20 %	40 %	40 %	209546506
47	NC_011368	TTGCG	2	10	61296	61305	0 %	40 %	40 %	20 %	209546507
48	NC_011368	CGCGA	2	10	61875	61884	20 %	0 %	40 %	40 %	209546508
49	NC_011368	GACCG	2	10	64369	64378	20 %	0 %	40 %	40 %	209546510
50	NC_011368	GCTCG	2	10	64747	64756	0 %	20 %	40 %	40 %	209546510
51	NC_011368	GCCTT	2	10	67346	67355	0 %	40 %	20 %	40 %	209546512
52	NC_011368	TCCAC	2	10	68389	68398	20 %	20 %	0 %	60 %	209546513
53	NC_011368	TCGGT	2	10	68659	68668	0 %	40 %	40 %	20 %	209546513
54	NC_011368	GCGCC	2	10	68840	68849	0 %	0 %	40 %	60 %	209546513
55	NC_011368	GCGCC	2	10	69232	69241	0 %	0 %	40 %	60 %	209546514
56	NC_011368	TCGCC	2	10	72903	72912	0 %	20 %	20 %	60 %	209546517
57	NC_011368	GAGCT	2	10	73697	73706	20 %	20 %	40 %	20 %	209546518
58	NC_011368	GCGCG	2	10	76738	76747	0 %	0 %	60 %	40 %	209546521
59	NC_011368	GTCGT	2	10	77426	77435	0 %	40 %	40 %	20 %	209546521
60	NC_011368	GCCAG	2	10	80314	80323	20 %	0 %	40 %	40 %	209546524
61	NC_011368	GCCGG	2	10	80872	80881	0 %	0 %	60 %	40 %	209546525
62	NC_011368	CCGGC	2	10	81627	81636	0 %	0 %	40 %	60 %	209546526
63	NC_011368	CGGTG	2	10	84772	84781	0 %	20 %	60 %	20 %	209546530
64	NC_011368	GGTCC	2	10	88274	88283	0 %	20 %	40 %	40 %	209546534
65	NC_011368	CAGAC	2	10	89912	89921	40 %	0 %	20 %	40 %	209546535
66	NC_011368	GGGCC	2	10	89999	90008	0 %	0 %	60 %	40 %	209546535
67	NC_011368	GCCGG	2	10	90078	90087	0 %	0 %	60 %	40 %	209546535
68	NC_011368	GCATA	2	10	93208	93217	40 %	20 %	20 %	20 %	209546538
69	NC_011368	ATCCG	2	10	93496	93505	20 %	20 %	20 %	40 %	209546539
70	NC_011368	TGGCA	2	10	96801	96810	20 %	20 %	40 %	20 %	209546542
71	NC_011368	CGCCT	2	10	98357	98366	0 %	20 %	20 %	60 %	209546544
72	NC_011368	GTGCC	2	10	99180	99189	0 %	20 %	40 %	40 %	209546544
73	NC_011368	CGATG	2	10	100245	100254	20 %	20 %	40 %	20 %	209546545
74	NC_011368	GCGCA	2	10	102205	102214	20 %	0 %	40 %	40 %	209546547
75	NC_011368	CGATC	2	10	105361	105370	20 %	20 %	20 %	40 %	209546549
76	NC_011368	GTCCC	2	10	106537	106546	0 %	20 %	20 %	60 %	209546550
77	NC_011368	GCCGA	2	10	108941	108950	20 %	0 %	40 %	40 %	209546553
78	NC_011368	AGGCG	2	10	111452	111461	20 %	0 %	60 %	20 %	209546556
79	NC_011368	CGTGC	2	10	113015	113024	0 %	20 %	40 %	40 %	209546557
80	NC_011368	CGGCA	2	10	113625	113634	20 %	0 %	40 %	40 %	209546558
81	NC_011368	TTGCC	2	10	114634	114643	0 %	40 %	20 %	40 %	209546560
82	NC_011368	TCCGC	2	10	117782	117791	0 %	20 %	20 %	60 %	209546562
83	NC_011368	GCAAG	2	10	117971	117980	40 %	0 %	40 %	20 %	209546562
84	NC_011368	CGTCG	2	10	118167	118176	0 %	20 %	40 %	40 %	209546562
85	NC_011368	GGTAT	2	10	119146	119155	20 %	40 %	40 %	0 %	209546563
86	NC_011368	GCGAT	2	10	125172	125181	20 %	20 %	40 %	20 %	209546569
87	NC_011368	GGCGA	2	10	127516	127525	20 %	0 %	60 %	20 %	209546571
88	NC_011368	GCCCT	2	10	128587	128596	0 %	20 %	20 %	60 %	209546572
89	NC_011368	GAAGC	2	10	131776	131785	40 %	0 %	40 %	20 %	209546574
90	NC_011368	TCGAT	2	10	132633	132642	20 %	40 %	20 %	20 %	209546575
91	NC_011368	CGACA	2	10	134908	134917	40 %	0 %	20 %	40 %	209546577
92	NC_011368	GAAGC	2	10	138155	138164	40 %	0 %	40 %	20 %	209546580
93	NC_011368	GGCGA	2	10	140471	140480	20 %	0 %	60 %	20 %	209546581
94	NC_011368	CGGCA	2	10	140737	140746	20 %	0 %	40 %	40 %	209546581
95	NC_011368	TGCGC	2	10	140884	140893	0 %	20 %	40 %	40 %	209546581
96	NC_011368	ACGGC	2	10	140946	140955	20 %	0 %	40 %	40 %	209546581
97	NC_011368	GCAAG	2	10	142170	142179	40 %	0 %	40 %	20 %	209546582
98	NC_011368	TGGCA	2	10	143977	143986	20 %	20 %	40 %	20 %	209546584
99	NC_011368	CCTTC	2	10	145793	145802	0 %	40 %	0 %	60 %	209546585
100	NC_011368	GCGAT	2	10	146181	146190	20 %	20 %	40 %	20 %	209546585
101	NC_011368	GTGCG	2	10	150403	150412	0 %	20 %	60 %	20 %	209546589
102	NC_011368	GGCCA	2	10	155163	155172	20 %	0 %	40 %	40 %	209546594
103	NC_011368	CGATG	2	10	155336	155345	20 %	20 %	40 %	20 %	209546594
104	NC_011368	AGCGC	2	10	156245	156254	20 %	0 %	40 %	40 %	209546595
105	NC_011368	TCGGT	2	10	156901	156910	0 %	40 %	40 %	20 %	209546596
106	NC_011368	TGCGC	2	10	158256	158265	0 %	20 %	40 %	40 %	209546597
107	NC_011368	GGTCT	2	10	158524	158533	0 %	40 %	40 %	20 %	209546597
108	NC_011368	CCCCT	2	10	160340	160349	0 %	20 %	0 %	80 %	209546599
109	NC_011368	CGATG	2	10	160497	160506	20 %	20 %	40 %	20 %	209546599
110	NC_011368	TCGAA	2	10	163097	163106	40 %	20 %	20 %	20 %	209546601
111	NC_011368	GCCGT	2	10	167567	167576	0 %	20 %	40 %	40 %	209546603
112	NC_011368	CACCG	2	10	171120	171129	20 %	0 %	20 %	60 %	209546608
113	NC_011368	CTCCG	2	10	174501	174510	0 %	20 %	20 %	60 %	209546612
114	NC_011368	TCGGA	2	10	175823	175832	20 %	20 %	40 %	20 %	209546614
115	NC_011368	GATCG	2	10	175998	176007	20 %	20 %	40 %	20 %	209546614
116	NC_011368	TGTCC	2	10	177766	177775	0 %	40 %	20 %	40 %	209546616
117	NC_011368	GCATC	2	10	177961	177970	20 %	20 %	20 %	40 %	209546616
118	NC_011368	AGCGG	2	10	178026	178035	20 %	0 %	60 %	20 %	209546616
119	NC_011368	TTGCC	2	10	178741	178750	0 %	40 %	20 %	40 %	209546617
120	NC_011368	CACCT	2	10	178760	178769	20 %	20 %	0 %	60 %	209546617
121	NC_011368	GCGCC	2	10	179377	179386	0 %	0 %	40 %	60 %	209546618
122	NC_011368	GGATC	2	10	180482	180491	20 %	20 %	40 %	20 %	209546619
123	NC_011368	GGCCG	2	10	183274	183283	0 %	0 %	60 %	40 %	209546621
124	NC_011368	CTGAA	2	10	184020	184029	40 %	20 %	20 %	20 %	209546622
125	NC_011368	GCGAA	2	10	184216	184225	40 %	0 %	40 %	20 %	209546622
126	NC_011368	CGCAG	2	10	184249	184258	20 %	0 %	40 %	40 %	209546622
127	NC_011368	AGGTC	2	10	185359	185368	20 %	20 %	40 %	20 %	209546624
128	NC_011368	GCAGC	2	10	188784	188793	20 %	0 %	40 %	40 %	209546628
129	NC_011368	AGCCG	2	10	188987	188996	20 %	0 %	40 %	40 %	209546628
130	NC_011368	TTCGC	2	10	189847	189856	0 %	40 %	20 %	40 %	209546629
131	NC_011368	TGACG	2	10	190129	190138	20 %	20 %	40 %	20 %	209546629
132	NC_011368	TGCCC	2	10	192966	192975	0 %	20 %	20 %	60 %	209546633
133	NC_011368	CGCGG	2	10	194176	194185	0 %	0 %	60 %	40 %	209546634
134	NC_011368	CGAAG	2	10	195327	195336	40 %	0 %	40 %	20 %	209546636
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