MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 plasmid pRLG201

Total Repeats: 490

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011368	GACG	2	8	111	118	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011368	GAGG	2	8	14707	14714	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011368	CGGC	2	8	14717	14724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_011368	GAAA	2	8	14733	14740	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011368	ATGT	2	8	21913	21920	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011368	CATT	2	8	35658	35665	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_011368	GCGT	2	8	36729	36736	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_011368	TCGA	2	8	36825	36832	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011368	CCGA	2	8	37811	37818	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_011368	AGGG	2	8	37844	37851	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011368	AACT	2	8	39660	39667	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011368	CGAT	2	8	42510	42517	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_011368	CTTC	2	8	44826	44833	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_011368	CGCC	2	8	44922	44929	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15	NC_011368	GCGG	2	8	45085	45092	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011368	GGGC	2	8	45174	45181	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011368	CCGC	3	12	45929	45940	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18	NC_011368	TGCC	2	8	46089	46096	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_011368	GCAC	2	8	46162	46169	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_011368	GCTG	2	8	47695	47702	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_011368	TCGC	2	8	50518	50525	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_011368	ATCC	2	8	50594	50601	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_011368	GTTT	2	8	54518	54525	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011368	GTCC	2	8	62386	62393	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_011368	ACCC	2	8	66915	66922	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
26	NC_011368	ACCA	2	8	92935	92942	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_011368	TCGA	2	8	92956	92963	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_011368	TTCA	2	8	93058	93065	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_011368	AAGC	2	8	101764	101771	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_011368	CCAG	2	8	103210	103217	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_011368	CAGC	2	8	103552	103559	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_011368	ATAA	2	8	107604	107611	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011368	GCCT	2	8	121349	121356	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_011368	TGGA	2	8	121427	121434	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011368	TCGG	2	8	121563	121570	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_011368	GAAG	2	8	123345	123352	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011368	CTCC	2	8	142708	142715	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
38	NC_011368	TCTG	2	8	142742	142749	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_011368	CTTG	2	8	142893	142900	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_011368	ATCG	2	8	155963	155970	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_011368	ATCG	2	8	177400	177407	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_011368	CGGT	2	8	183516	183523	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_011368	GGAC	2	8	194722	194729	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_011368	GTCT	2	8	196068	196075	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_011368	TGGA	2	8	196166	196173	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011368	TCCC	2	8	200582	200589	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
47	NC_011368	AACG	2	8	203764	203771	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_011368	GCGG	2	8	208305	208312	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
49	NC_011368	CGCC	2	8	208634	208641	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
50	NC_011368	CCGG	2	8	208760	208767	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_011368	ATCG	2	8	208846	208853	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_011368	CGGG	2	8	209098	209105	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
53	NC_011368	AGGA	2	8	211345	211352	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011368	ATCG	2	8	214852	214859	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_011368	TGTC	2	8	215093	215100	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_011368	CGCT	2	8	215963	215970	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_011368	CGCC	2	8	216750	216757	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
58	NC_011368	AAGC	2	8	220826	220833	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_011368	TTGC	2	8	221469	221476	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_011368	AGCC	2	8	222053	222060	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_011368	ATGC	2	8	222212	222219	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_011368	CGGC	2	8	226171	226178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_011368	GGCC	2	8	226179	226186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_011368	GAAC	2	8	227341	227348	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_011368	GCGG	2	8	231360	231367	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
66	NC_011368	ATCT	2	8	233024	233031	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_011368	CCGG	2	8	233240	233247	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_011368	GCCG	2	8	237021	237028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_011368	TCCC	2	8	241446	241453	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
70	NC_011368	TGGC	2	8	245909	245916	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_011368	TTGC	2	8	246982	246989	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_011368	CGTC	2	8	248445	248452	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_011368	AAAC	2	8	249773	249780	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_011368	ATGG	2	8	249857	249864	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011368	AAAG	2	8	251029	251036	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011368	GTGA	2	8	258949	258956	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011368	GGGA	2	8	265060	265067	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011368	GAAA	2	8	265622	265629	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011368	TGGC	2	8	266532	266539	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_011368	GGAC	2	8	268002	268009	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_011368	TCGC	2	8	270837	270844	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_011368	GGCC	2	8	271858	271865	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_011368	TTTC	2	8	277951	277958	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_011368	AGCG	2	8	282362	282369	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_011368	GGCT	2	8	282504	282511	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_011368	GTCT	2	8	283512	283519	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_011368	TTCA	2	8	289712	289719	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_011368	GATC	2	8	305297	305304	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_011368	CAAC	2	8	307958	307965	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_011368	AGGC	2	8	313512	313519	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_011368	CGGC	2	8	313560	313567	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_011368	GGAG	2	8	313689	313696	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011368	CGAA	2	8	313897	313904	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_011368	TCTG	2	8	320607	320614	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_011368	GGCC	2	8	323497	323504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_011368	GTCG	2	8	323593	323600	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_011368	GGAT	2	8	324290	324297	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011368	CAGC	2	8	324314	324321	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_011368	TACA	2	8	324357	324364	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_011368	CTTC	2	8	324403	324410	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_011368	TCCC	2	8	327636	327643	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
102	NC_011368	GCCG	2	8	327651	327658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_011368	TTTA	2	8	327814	327821	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011368	CGGT	2	8	328168	328175	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_011368	TCAA	2	8	329544	329551	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_011368	GCCG	2	8	333116	333123	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_011368	GCAG	2	8	336214	336221	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_011368	CGGT	2	8	337759	337766	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_011368	ATTA	2	8	337792	337799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011368	TGTC	2	8	340962	340969	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_011368	TTCG	2	8	344398	344405	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_011368	AAGT	2	8	345524	345531	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011368	GACT	2	8	345545	345552	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_011368	TCGG	2	8	345826	345833	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_011368	AGGC	2	8	345941	345948	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_011368	GATC	2	8	347416	347423	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_011368	GCAG	2	8	347456	347463	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_011368	CCGG	2	8	347553	347560	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_011368	GGAC	2	8	348935	348942	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_011368	GGGC	2	8	355365	355372	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
121	NC_011368	AAAT	2	8	355802	355809	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011368	CGCT	2	8	355911	355918	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_011368	AAAG	2	8	357801	357808	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011368	TGGC	2	8	357864	357871	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_011368	GCTT	2	8	358830	358837	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_011368	TTGG	2	8	365361	365368	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011368	CGAC	2	8	365609	365616	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_011368	TCAT	2	8	366386	366393	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_011368	AGGG	2	8	369599	369606	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011368	CGCC	2	8	374730	374737	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
131	NC_011368	GGCG	2	8	374802	374809	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
132	NC_011368	TAGC	2	8	376551	376558	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_011368	CGAA	2	8	376903	376910	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_011368	TCCA	2	8	377404	377411	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_011368	GTAG	2	8	379689	379696	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011368	AGCC	2	8	383796	383803	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_011368	CGTC	2	8	383964	383971	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_011368	ACCT	2	8	396696	396703	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_011368	ATCG	2	8	400031	400038	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_011368	ACCA	2	8	401464	401471	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_011368	CGAT	2	8	406585	406592	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_011368	GATT	2	8	409675	409682	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011368	AGGC	2	8	409735	409742	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_011368	CCGA	2	8	409783	409790	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_011368	GTCT	2	8	414040	414047	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_011368	AAGG	2	8	416294	416301	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011368	ACGA	2	8	418800	418807	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_011368	GGCA	2	8	418927	418934	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_011368	GGCC	2	8	419203	419210	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_011368	GTCT	2	8	419364	419371	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_011368	GTTC	2	8	419501	419508	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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483	NC_011368	TTTG	2	8	1223400	1223407	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
484	NC_011368	CAAT	2	8	1225913	1225920	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
485	NC_011368	CTAC	2	8	1227727	1227734	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
486	NC_011368	AAAG	2	8	1238996	1239003	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
487	NC_011368	TCGT	2	8	1259537	1259544	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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489	NC_011368	ATCA	2	8	1261173	1261180	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
490	NC_011368	CGCC	2	8	1261361	1261368	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.