MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5 plasmid pGDIA01

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011367	AGA	2	6	75	80	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011367	ACG	2	6	89	94	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011367	TAA	2	6	162	167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011367	TGG	2	6	229	234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011367	GGC	2	6	275	280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011367	TGG	2	6	351	356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011367	TCC	2	6	485	490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_011367	TAT	2	6	563	568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011367	CCG	2	6	621	626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_011367	GCC	2	6	641	646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_011367	ATC	2	6	778	783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011367	ACC	2	6	846	851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_011367	ATC	2	6	1712	1717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011367	TGA	2	6	1831	1836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011367	CAC	2	6	1849	1854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_011367	TCC	2	6	1857	1862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_011367	TCC	2	6	1893	1898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_011367	CTT	2	6	1919	1924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011367	CGG	2	6	1997	2002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011367	TCA	2	6	2046	2051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_011367	CTT	2	6	2075	2080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011367	ACA	2	6	2805	2810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011367	TTC	2	6	2874	2879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011367	CGG	2	6	2991	2996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011367	GGC	2	6	3031	3036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011367	CTT	2	6	3229	3234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011367	CGG	2	6	3258	3263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011367	GCC	2	6	3369	3374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_011367	CGG	2	6	3452	3457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011367	GGC	2	6	3912	3917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011367	GAC	2	6	5042	5047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011367	AAT	2	6	6173	6178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011367	TGA	2	6	6203	6208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011367	CAT	2	6	6245	6250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011367	GTG	2	6	6373	6378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011367	CTT	2	6	6424	6429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011367	GGC	2	6	6436	6441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011367	CGT	3	9	6615	6623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011367	GCG	2	6	6691	6696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011367	AGG	2	6	6794	6799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011367	TGT	2	6	6970	6975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011367	ATC	2	6	6995	7000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011367	TCT	2	6	7034	7039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011367	GAC	2	6	7049	7054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011367	TGA	2	6	7079	7084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011367	AAT	2	6	8101	8106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011367	AAT	2	6	9469	9474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011367	TTA	2	6	9535	9540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011367	GTA	2	6	13017	13022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011367	ATA	2	6	13107	13112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011367	TCT	2	6	13195	13200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011367	GCG	2	6	13207	13212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011367	TAT	2	6	14646	14651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011367	GTC	2	6	14678	14683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011367	CAC	2	6	17030	17035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_011367	CAG	2	6	17059	17064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011367	TCG	2	6	17117	17122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011367	ATG	2	6	18586	18591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011367	TTC	2	6	23187	23192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011367	GAC	2	6	23362	23367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011367	AAT	2	6	23373	23378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011367	ATG	3	9	23388	23396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011367	GCC	2	6	23400	23405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_011367	CAG	2	6	23410	23415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011367	TTG	2	6	23444	23449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011367	GCA	2	6	23453	23458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011367	GAA	2	6	23492	23497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011367	CAT	2	6	23499	23504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011367	CAG	2	6	23638	23643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_011367	TCT	2	6	23684	23689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011367	CAT	2	6	26191	26196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_011367	AAC	2	6	26211	26216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011367	GCA	2	6	26663	26668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_011367	ACG	2	6	26673	26678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011367	CAG	2	6	27351	27356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.