MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5 plasmid pGDIA01

Total Repeats: 306

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011367	CTT	2	6	1083	1088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209542159
2	NC_011367	GGA	2	6	1142	1147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209542159
3	NC_011367	AGA	2	6	1298	1303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209542159
4	NC_011367	GAA	2	6	1386	1391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209542159
5	NC_011367	CGG	2	6	2199	2204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209542160
6	NC_011367	CTG	2	6	2362	2367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209542160
7	NC_011367	CAC	2	6	2428	2433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209542160
8	NC_011367	GCC	2	6	2450	2455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209542160
9	NC_011367	ATA	3	9	2492	2500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209542160
10	NC_011367	GCT	2	6	2557	2562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209542160
11	NC_011367	CGT	2	6	2577	2582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209542160
12	NC_011367	TCG	2	6	2627	2632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209542160
13	NC_011367	GAC	2	6	2644	2649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209542160
14	NC_011367	GGC	2	6	2650	2655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209542160
15	NC_011367	TCG	2	6	2694	2699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209542160
16	NC_011367	GCA	2	6	3579	3584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209542161
17	NC_011367	GCC	2	6	3685	3690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209542161
18	NC_011367	ACG	2	6	3746	3751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209542161
19	NC_011367	TGC	2	6	3752	3757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209542161
20	NC_011367	GCC	2	6	3764	3769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209542161
21	NC_011367	CAT	2	6	3992	3997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209542162
22	NC_011367	CCG	3	9	4074	4082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209542162
23	NC_011367	TCG	2	6	4100	4105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209542162
24	NC_011367	CAG	2	6	4144	4149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209542162
25	NC_011367	CGC	2	6	4182	4187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209542162
26	NC_011367	CAG	2	6	4201	4206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209542162
27	NC_011367	GCC	2	6	4249	4254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209542162
28	NC_011367	CGG	2	6	4348	4353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209542163
29	NC_011367	TTG	2	6	4455	4460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209542163
30	NC_011367	GCC	2	6	4503	4508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209542163
31	NC_011367	CTT	2	6	4510	4515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209542163
32	NC_011367	ATA	2	6	4529	4534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209542163
33	NC_011367	GCG	2	6	4683	4688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209542164
34	NC_011367	GGC	2	6	4714	4719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209542164
35	NC_011367	GCT	2	6	4740	4745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209542164
36	NC_011367	GCC	2	6	4800	4805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209542164
37	NC_011367	AGA	2	6	5173	5178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209542165
38	NC_011367	ATC	2	6	5192	5197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209542165
39	NC_011367	TTG	2	6	5301	5306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209542165
40	NC_011367	AAT	2	6	5331	5336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209542165
41	NC_011367	CAA	2	6	5489	5494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209542165
42	NC_011367	TGT	2	6	5612	5617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209542166
43	NC_011367	TGA	2	6	5654	5659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209542166
44	NC_011367	TTC	2	6	5739	5744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209542166
45	NC_011367	TCA	2	6	5845	5850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209542166
46	NC_011367	CGT	2	6	5856	5861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209542166
47	NC_011367	GAT	2	6	5910	5915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209542166
48	NC_011367	TCG	2	6	6146	6151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209542166
49	NC_011367	CGA	2	6	7182	7187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209542167
50	NC_011367	GGC	2	6	7208	7213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209542167
51	NC_011367	GGC	2	6	7294	7299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209542167
52	NC_011367	GGC	2	6	7492	7497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209542167
53	NC_011367	GCC	3	9	7526	7534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209542167
54	NC_011367	GCG	2	6	7554	7559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209542167
55	NC_011367	CGT	2	6	7588	7593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209542167
56	NC_011367	GCC	2	6	7634	7639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209542167
57	NC_011367	CGG	2	6	7656	7661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209542167
58	NC_011367	CAG	2	6	7742	7747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209542167
59	NC_011367	GAC	2	6	7835	7840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209542167
60	NC_011367	GGA	2	6	7870	7875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209542167
61	NC_011367	GAA	2	6	7900	7905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209542167
62	NC_011367	AAG	2	6	7907	7912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209542167
63	NC_011367	GAT	2	6	7981	7986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209542167
64	NC_011367	CGG	2	6	8558	8563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209542168
65	NC_011367	GGA	2	6	8595	8600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209542168
66	NC_011367	CAA	2	6	8622	8627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209542168
67	NC_011367	GCC	2	6	8697	8702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209542168
68	NC_011367	TGG	2	6	8717	8722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209542168
69	NC_011367	AAC	2	6	8724	8729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209542168
70	NC_011367	ACC	2	6	8787	8792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209542168
71	NC_011367	AGC	2	6	8805	8810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209542168
72	NC_011367	ATT	2	6	8896	8901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209542168
73	NC_011367	ATT	2	6	8952	8957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209542168
74	NC_011367	ACA	2	6	9043	9048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209542168
75	NC_011367	GAC	2	6	9069	9074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209542168
76	NC_011367	ATT	2	6	9105	9110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209542168
77	NC_011367	AGT	2	6	9131	9136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209542168
78	NC_011367	TCG	2	6	9204	9209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209542168
79	NC_011367	GCC	2	6	9216	9221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209542168
80	NC_011367	GCA	2	6	9378	9383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209542168
81	NC_011367	CGG	2	6	9442	9447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209542168
82	NC_011367	TGC	2	6	9589	9594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209542169
83	NC_011367	GCT	2	6	9609	9614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209542169
84	NC_011367	GAC	2	6	9626	9631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209542169
85	NC_011367	AGC	2	6	9654	9659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209542169
86	NC_011367	CGC	2	6	9812	9817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209542169
87	NC_011367	GCG	2	6	9834	9839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209542169
88	NC_011367	CAG	2	6	9848	9853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209542169
89	NC_011367	CCG	2	6	10018	10023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209542169
90	NC_011367	ACG	2	6	10084	10089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209542169
91	NC_011367	ACG	2	6	10125	10130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209542169
92	NC_011367	TGA	2	6	10207	10212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209542169
93	NC_011367	GCC	2	6	10443	10448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209542169
94	NC_011367	GAC	3	9	10454	10462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209542169
95	NC_011367	AAG	2	6	10590	10595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209542169
96	NC_011367	TTC	2	6	10681	10686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209542170
97	NC_011367	CGT	2	6	10710	10715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209542170
98	NC_011367	GCC	2	6	10789	10794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209542170
99	NC_011367	ACC	2	6	10827	10832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209542170
100	NC_011367	GCG	2	6	10835	10840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209542170
101	NC_011367	TGA	2	6	10879	10884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209542170
102	NC_011367	GCC	2	6	10943	10948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209542170
103	NC_011367	CGG	2	6	11032	11037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209542170
104	NC_011367	GAG	2	6	11045	11050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209542170
105	NC_011367	CTT	2	6	11105	11110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209542170
106	NC_011367	CAC	2	6	11257	11262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209542170
107	NC_011367	CGG	2	6	11297	11302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209542170
108	NC_011367	GCA	2	6	11314	11319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209542170
109	NC_011367	ACC	2	6	11364	11369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209542170
110	NC_011367	ATT	2	6	11685	11690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209542171
111	NC_011367	ATC	2	6	11884	11889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209542171
112	NC_011367	CAG	3	9	11894	11902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209542171
113	NC_011367	CAC	2	6	11913	11918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209542171
114	NC_011367	ATG	2	6	11955	11960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209542171
115	NC_011367	TCA	2	6	12047	12052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209542171
116	NC_011367	AAC	2	6	12088	12093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209542171
117	NC_011367	GGC	2	6	12339	12344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209542171
118	NC_011367	AGA	2	6	12523	12528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209542171
119	NC_011367	CTT	2	6	12780	12785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209542171
120	NC_011367	AAG	2	6	13273	13278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209542172
121	NC_011367	CTG	2	6	13314	13319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209542172
122	NC_011367	ATA	2	6	13399	13404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209542172
123	NC_011367	CCG	2	6	13451	13456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209542172
124	NC_011367	TTG	2	6	13574	13579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209542172
125	NC_011367	TGC	2	6	13605	13610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209542172
126	NC_011367	GAC	2	6	13714	13719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209542172
127	NC_011367	CGA	2	6	13869	13874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209542172
128	NC_011367	TGC	2	6	13900	13905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209542172
129	NC_011367	CAT	2	6	13942	13947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209542172
130	NC_011367	GGC	2	6	13974	13979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209542172
131	NC_011367	TCC	2	6	13991	13996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209542172
132	NC_011367	GCC	2	6	14087	14092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209542172
133	NC_011367	GTT	2	6	14103	14108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209542172
134	NC_011367	ACG	2	6	14146	14151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209542172
135	NC_011367	CGC	2	6	14161	14166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209542172
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137	NC_011367	CGT	2	6	14289	14294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209542172
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152	NC_011367	ACC	2	6	15247	15252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209542173
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254	NC_011367	CTG	2	6	22598	22603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209542180
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.